АпоЕ-рецептор 2

АпоЕ-рецептор 2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3A7Q
Ідентифікатори
Символи	LRP8, APOER2, HSZ75190, LRP-8, MCI1, low density lipoprotein receptor-related protein 8, LDL receptor related protein 8
Зовнішні ІД	OMIM: 602600 MGI: 1340044 HomoloGene: 31250 GeneCards: LRP8
Пов'язані генетичні захворювання
myocardial infarction, susceptibility to[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • reelin receptor activity • calcium ion binding • apolipoprotein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinesin binding • high-density lipoprotein particle binding • very-low-density lipoprotein particle receptor activity • transmembrane signaling receptor activity • low-density lipoprotein particle receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • receptor complex • клітинна мембрана • microtubule associated complex • extracellular region • аксон • soma • дендрит (нейробіологія) • caveola Біологічний процес • ендоцитоз • ammon gyrus development • lipid metabolism • cytokine-mediated signaling pathway • cellular response to growth factor stimulus • positive regulation of protein tyrosine kinase activity • modulation of chemical synaptic transmission • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of dendrite development • cellular response to cholesterol • протеоліз • retinoid metabolic process • reelin-mediated signaling pathway • positive regulation of CREB transcription factor activity • cerebral cortex development • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • positive regulation of dendritic spine morphogenesis • GO:0072468 сигнальна трансдукція • рецептор-опосередкований ендоцитоз • regulation of apoptotic process • regulation of innate immune response Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7804	16975
Ensembl	ENSG00000157193	ENSMUSG00000028613
UniProt	Q14114	Q924X6
RefSeq (мРНК)	NM_001018054 NM_004631 NM_017522 NM_033300	NM_001080926 NM_053073 NM_001369051 NM_001369052 NM_001369053 NM_001369054
RefSeq (білок)	NP_001018064 NP_004622 NP_059992 NP_150643	NP_001074395 NP_001355980 NP_001355981 NP_001355982 NP_001355983 NP_444303
Локус (UCSC)	Хр. 1: 53.24 – 53.33 Mb	Хр. 4: 107.8 – 107.88 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

АпоЕ-рецептор 2, АпоЕ рецептор 2 типу (англ. LDL receptor related protein 8, ApoER2) – білок, який кодується геном LRP8, розташованим у людини на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 105 634^[5]. Рецептор, що належить до родини рецепторів ліпопротеїнів низької щільності (англ. Low density lipoprotein receptor gene family) та виявляється переважно в мозку і плаценті. ApoER2 складається з п'яти функціональних доменів, подібно до інших білків своєї родини.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLPEPGPLR		LLALLLLLLL		LLLLQLQHLA		AAAADPLLGG		QGPAKDCEKD
QFQCRNERCI		PSVWRCDEDD		DCLDHSDEDD		CPKKTCADSD		FTCDNGHCIH
ERWKCDGEEE		CPDGSDESEA		TCTKQVCPAE		KLSCGPTSHK		CVPASWRCDG
EKDCEGGADE		AGCATLCAPH		EFQCGNRSCL		AAVFVCDGDD		DCGDGSDERG
CADPACGPRE		FRCGGDGGGA		CIPERWVCDR		QFDCEDRSDE		AAELCGRPGP
GATSAPAACA		TASQFACRSG		ECVHLGWRCD		GDRDCKDKSD		EADCPLGTCR
GDEFQCGDGT		CVLAIKHCNQ		EQDCPDGSDE		AGCLQGLNEC		LHNNGGCSHI
CTDLKIGFEC		TCPAGFQLLD		QKTCGDIDEC		KDPDACSQIC		VNYKGYFKCE
CYPGYEMDLL		TKNCKAAAGK		SPSLIFTNRH		EVRRIDLVKR		NYSRLIPMLK
NVVALDVEVA		TNRIYWCDLS		YRKIYSAYMD		KASDPKEQEV		LIDEQLHSPE
GLAVDWVHKH		IYWTDSGNKT		ISVATVDGGR		RRTLFSRNLS		EPRAIAVDPL
RGFMYWSDWG		DQAKIEKSGL		NGVDRQTLVS		DNIEWPNGIT		LDLLSQRLYW
VDSKLHQLSS		IDFSGGNRKT		LISSTDFLSH		PFGIAVFEDK		VFWTDLENEA
IFSANRLNGL		EISILAENLN		NPHDIVIFHE		LKQPRAPDAC		ELSVQPNGGC
EYLCLPAPQI		SSHSPKYTCA		CPDTMWLGPD		MKRCYRAPQS		TSTTTLASTM
TRTVPATTRA		PGTTVHRSTY		QNHSTETPSL		TAAVPSSVSV		PRAPSISPST
LSPATSNHSQ		HYANEDSKMG		STVTAAVIGI		IVPIVVIALL		CMSGYLIWRN
WKRKNTKSMN		FDNPVYRKTT		EEEDEDELHI		GRTAQIGHVY		PAAISSFDRP
LWAEPCLGET		REPEDPAPAL		KELFVLPGEP		RSQLHQLPKN		PLSELPVVKS
KRVALSLEDD		GLP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, також секретований назовні.

ApoER2 здатний зв'язуватися з аполіпопротеїн E-вмісними ліпопротеїнами, але його основна виявлена функція — передача сигналу риліну. Білок рилін, його рецептори ApoER2 і VLDLR, і адаптерний білок цитоплазми DAB1 є учасниками єдиного сигнального шляху, що регулює правильну побудову шарів кори головного мозку. За відсутності обох рецепторів ApoER2 і VLDLR у мишей спостерігається фенотип reeler, такий же, як і за відсутності риліну. ApoER2 грає важливішу роль в сигнальному шляху риліну, оскільки при його відсутності спостерігаються серйозніші порушення міграції нейронів, чим за відсутності лише рецептора VLDLR.

Посилення довготривалої потенціації, що викликається риліном, також опосередковано рецептором ApoER2. Внутріклітинний домен рецептора, що кодується екзоном 19, впливає на рецептор NMDA (NMDAR), що грає важливу роль в механізмах пам'яті і навчання. Точний механізм дії цього білка, проте, поки що невідомий. Передбачається, що ApoER2 утворює комплекси з NMDAR і білком PSD95. Екзон 19 схильний до альтернативному сплайсингу, причому відносна кількість рецепторів з екзоном 19 збільшується під час активності і зменшується під час сну. Відсутність екзона 19 у піддослідних мишей не порушує процес кортикогенезу, але приводить до порушення роботи пам'яті^[6].

Див. також

• Хромосома 1

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sacre S.M., Stannard A.K., Owen J.S. (2003). Apolipoprotein E (apoE) isoforms differentially induce nitric oxide production in endothelial cells. FEBS Lett. 540: 181—187. PMID 12681505 DOI:10.1016/S0014-5793(03)00261-8
• Andersen O.M., Benhayon D., Curran T., Willnow T.E. (2003). Differential binding of ligands to the apolipoprotein E receptor 2. Biochemistry. 42: 9355—9364. PMID 12899622 DOI:10.1021/bi034475p
• Li X., Kypreos K., Zanni E.E., Zannis V. (2003). Domains of apoE required for binding to apoE receptor 2 and to phospholipids: implications for the functions of apoE in the brain. Biochemistry. 42: 10406—10417. PMID 12950167 DOI:10.1021/bi027093c
• Riddell D.R., Vinogradov D.V., Stannard A.K., Chadwick N., Owen J.S. (1999). Identification and characterization of LRP8 (apoER2) in human blood platelets. J. Lipid Res. 40: 1925—1930. PMID 10508213

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з АпоЕ-рецептор 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6700 (англ.) . Архів оригіналу за 3 травня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.
5. UniProt, Q14114 (англ.) . Архів оригіналу за 2 травня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.
6. Beffert U, Weeber EJ, Durudas A, Qiu S, Masiulis I, Sweatt JD, Li WP, Adelmann G, Frotscher M, Hammer RE, Herz J. Modulation of synaptic plasticity and memory by Reelin involves differential splicing of the lipoprotein receptor Apoer2. Neuron . 2005 Aug 18 ; 47(4):567-79. PMID 16102539 free full text PDF [Архівовано 30 вересня 2007 у Wayback Machine.]

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»