Катепсин S

CTSS
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1GLO, 1MS6, 1NPZ, 1NQC, 2C0Y, 2F1G, 2FQ9, 2FRA, 2FRQ, 2FT2, 2FUD, 2FYE, 2G6D, 2G7Y, 2H7J, 2HH5, 2HHN, 2HXZ, 2OP3, 2R9M, 2R9N, 2R9O, 3IEJ, 3KWN, 3MPE, 3MPF, 3N3G, 3N4C, 3OVX, 4P6E, 4P6G
Ідентифікатори
Символи	CTSS, cathepsin S
Зовнішні ІД	OMIM: 116845 MGI: 107341 HomoloGene: 20867 GeneCards: CTSS
Реагує на сполуку
odanacatib[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • fibronectin binding • cysteine-type peptidase activity • collagen binding • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • laminin binding • hydrolase activity • proteoglycan binding • serine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • extracellular region • endolysosome lumen • lysosomal lumen • лізосома • міжклітинний простір • tertiary granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • collagen-containing extracellular matrix • late endosome Біологічний процес • positive regulation of cation channel activity • antigen processing and presentation • адаптивна імунна відповідь • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • protein processing • extracellular matrix disassembly • протеоліз • toll-like receptor signaling pathway • antigen processing and presentation of peptide antigen • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • cellular response to thyroid hormone stimulus • collagen catabolic process • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • basement membrane disassembly • response to acidic pH • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1520	13040
Ensembl	ENSG00000163131	ENSMUSG00000038642
UniProt	P25774	O70370
RefSeq (мРНК)	NM_004079 NM_001199739	NM_001267695 NM_021281
RefSeq (білок)	NP_001186668 NP_004070	NP_001254624 NP_067256
Локус (UCSC)	Хр. 1: 150.73 – 150.77 Mb	Хр. 3: 95.43 – 95.46 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Катепсін С (англ. Cathepsin S) — білок, який кодується геном CTSS, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 331 амінокислот, а молекулярна маса — 37 496^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKRLVCVLLV		CSSAVAQLHK		DPTLDHHWHL		WKKTYGKQYK		EKNEEAVRRL
IWEKNLKFVM		LHNLEHSMGM		HSYDLGMNHL		GDMTSEEVMS		LMSSLRVPSQ
WQRNITYKSN		PNRILPDSVD		WREKGCVTEV		KYQGSCGACW		AFSAVGALEA
QLKLKTGKLV		SLSAQNLVDC		STEKYGNKGC		NGGFMTTAFQ		YIIDNKGIDS
DASYPYKAMD		QKCQYDSKYR		AATCSKYTEL		PYGREDVLKE		AVANKGPVSV
GVDARHPSFF		LYRSGVYYEP		SCTQNVNHGV		LVVGYGDLNG		KEYWLVKNSW
GHNFGEEGYI		RMARNKGNHC		GIASFPSYPE		I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Локалізований у лізосомі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fengler A., Brandt W. (1998). Three-dimensional structures of the cysteine proteases cathepsins K and S deduced by knowledge-based modelling and active site characteristics. Protein Eng. 11: 1007—1013. PMID 9876921 DOI:10.1093/protein/11.11.1007
• Shi G.-P., Munger J.S., Meara J.P., Rich D.H., Chapman H.A. (1992). Molecular cloning and expression of human alveolar macrophage cathepsin S, an elastinolytic cysteine protease. J. Biol. Chem. 267: 7258—7262. PMID 1373132

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Cathepsin S переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2545 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
5. UniProt, P25774 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»