Нейрексин-1

NRXN1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3B3Q
Ідентифікатори
Символи	NRXN1, Hs.22998, PTHSL2, SCZD17, neurexin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600565 MGI: 1096391 HomoloGene: 21005 GeneCards: NRXN1
Пов'язані генетичні захворювання
	chromosome 2P16.3 deletion syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • calcium-dependent protein binding; • neuroligin family protein binding; • signaling receptor binding; • transmembrane signaling receptor activity; • cell adhesion molecule binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • type 1 fibroblast growth factor receptor binding; • calcium ion binding; • acetylcholine receptor binding; • calcium channel regulator activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • везикула; • ядерна мембрана; • мембрана; • endocytic vesicle; • axonal growth cone; • синапс; • cell surface; • міжклітинні контакти; • soma; • ендоплазматичний ретикулум; • presynaptic membrane; • клітинна мембрана; • integral component of presynaptic membrane; • presynapse; • integral component of plasma membrane; • ядерце; • GO:0009327 protein-containing complex; • Schaffer collateral - CA1 synapse; • glutamatergic synapse; • GABA-ergic synapse; • integral component of presynaptic active zone membrane;
Біологічний процес	• calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • receptor localization to synapse; • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • NMDA glutamate receptor clustering; • establishment of protein localization; • neuron cell-cell adhesion; • gamma-aminobutyric acid receptor clustering; • neuronal signal transduction; • gephyrin clustering involved in postsynaptic density assembly; • postsynaptic density protein 95 clustering; • навчення; • regulation of AMPA receptor activity; • negative regulation of filopodium assembly; • presynaptic membrane assembly; • regulation of NMDA receptor activity; • vocalization behavior; • neuroligin clustering involved in postsynaptic membrane assembly; • adult behavior; • positive regulation of synaptic transmission, glutamatergic; • postsynaptic membrane assembly; • адгезія клітин; • Ангіогенез; • positive regulation of excitatory postsynaptic potential; • соціальна поведінка; • guanylate kinase-associated protein clustering; • synapse assembly; • protein-containing complex assembly involved in synapse maturation; • synaptic vesicle clustering; • protein localization to synapse; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • cerebellar granule cell differentiation; • positive regulation of synapse assembly; • positive regulation of presynaptic active zone assembly; • positive regulation of protein localization to plasma membrane; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • negative regulation of gene expression; • positive regulation of protein kinase A signaling; • neuron projection development; • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • positive regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • positive regulation of protein kinase B signaling; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • cellular response to calcium ion; • positive regulation of protein kinase C activity; • vocal learning; • chemical synaptic transmission; • regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; • axon guidance; • prepulse inhibition; • neuromuscular process controlling balance; • positive regulation of synapse maturation; • GO:0010554 neurotransmitter secretion; • regulation of grooming behavior; • synaptic membrane adhesion; • regulation of synaptic vesicle cycle; • regulation of postsynaptic specialization assembly; • regulation of presynapse assembly; • regulation of postsynaptic density assembly; • trans-synaptic signaling by endocannabinoid;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	9378
	18189
	ENSG00000179915
	ENSMUSG00000024109
	P58400; Q9ULB1; Q49A31
	P0DI97; Q9CS84
NM_001135659; NM_004801; NM_138735; NM_001320156; NM_001320157;
	NM_001330077; NM_001330078; NM_001330079; NM_001330081; NM_001330082; NM_001330083; NM_001330084; NM_001330085; NM_001330086; NM_001330087; NM_001330088; NM_001330089; NM_001330090; NM_001330091; NM_001330092; NM_001330093; NM_001330094; NM_001330095; NM_001330096; NM_001330097
NM_020252; NM_177284; NM_001346957; NM_001346958; NM_001346959;
	NM_001346960; NM_001346961; NM_001346962; NM_001347419
NP_001129131; NP_001307085; NP_001307086; NP_001317006; NP_001317007;
	NP_001317008; NP_001317010; NP_001317011; NP_001317012; NP_001317013; NP_001317014; NP_001317015; NP_001317016; NP_001317017; NP_001317018; NP_001317019; NP_001317020; NP_001317021; NP_001317022; NP_001317023; NP_001317024; NP_001317025; NP_001317026; NP_004792; NP_620072; NP_001129131.1; NP_004792.1; NP_620072.1; NP_004792.1; NP_004792.1; NP_620072.1
NP_001333886; NP_001333887; NP_001333888; NP_001333889; NP_001333890;
	NP_001333891; NP_001334348; NP_064648; NP_796258; NP_001390248; NP_001390249; NP_001390250; NP_001390251; NP_001390252; NP_001390253; NP_001390254; NP_001390255; NP_001390256; NP_001390257; NP_001390258; NP_001390259; NP_001390260; NP_001390261; NP_064648.3; NP_796258.2
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NRXN1 (англ. Neurexin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 472 амінокислот, а молекулярна маса — 50 424^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYQRMLRCGA	ELGSPGGGGG	GGGGGGAGGR	LALLWIVPLT	LSGLLGVAWG
ASSLGAHHIH	HFHGSSKHHS	VPIAIYRSPA	SLRGGHAGTT	YIFSKGGGQI
TYKWPPNDRP	STRADRLAIG	FSTVQKEAVL	VRVDSSSGLG	DYLELHIHQG
KIGVKFNVGT	DDIAIEESNA	IINDGKYHVV	RFTRSGGNAT	LQVDSWPVIE
RYPAGNNDNE	RLAIARQRIP	YRLGRVVDEW	LLDKGRQLTI	FNSQATIIIG
GKEQGQPFQG	QLSGLYYNGL	KVLNMAAEND	ANIAIVGNVR	LVGEVPSSMT
TESTATAMQS	EMSTSIMETT	TTLATSTARR	GKPPTKEPIS	QTTDDILVAS
AECPSDDEDI	DPCEPSSGGL	ANPTRAGGRE	PYPGSAEVIR	ESSSTTGMVV
GIVAAAALCI	LILLYAMYKY	RNRDEGSYHV	DESRNYISNS	AQSNGAVVKE
KQPSSAKSSN	KNKKNKDKEY	YV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, ангіогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Chen X., Liu H., Shim A.H., Focia P.J., He X. (2008). Structural basis for synaptic adhesion mediated by neuroligin-neurexin interactions. Nat. Struct. Mol. Biol. 15: 50—56. PMID 18084303 doi:10.1038/nsmb1350

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NRXN1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8008 (англ.) . Архів оригіналу за 31 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P58400 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з NRXN1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8008 (англ.) . Архів оригіналу за 31 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P58400 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]