A1CF

A1CF
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CPD
Ідентифікатори
Символи	A1CF, ACF, ACF64, ACF65, APOBEC1CF, ASP, APOBEC1 complementation factor
Зовнішні ІД	OMIM: 618199 MGI: 1917115 HomoloGene: 16363 GeneCards: A1CF
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding; • double-stranded RNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • single-stranded RNA binding; • RNA binding; • mRNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • apolipoprotein B mRNA editing enzyme complex; • ендоплазматичний ретикулум; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• mRNA processing; • protein stabilization; • cytidine to uridine editing; • mRNA modification; • mRNA localization resulting in posttranscriptional regulation of gene expression;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	29974
	69865
	ENSG00000148584
	ENSMUSG00000052595
	Q9NQ94
	Q5YD48
NM_001198818; NM_001198819; NM_001198820; NM_014576; NM_138932;
	NM_138933; NM_001370130; NM_001370131
	NM_001081074; NM_001365078
NP_001185747; NP_001185748; NP_001185749; NP_055391; NP_620310;
	NP_620311; NP_001357059; NP_001357060
	NP_001074543; NP_001352007
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

A1CF (англ. APOBEC1 complementation factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 65 202^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESNHKSGDG	LSGTQKEAAL	RALVQRTGYS	LVQENGQRKY	GGPPPGWDAA
PPERGCEIFI	GKLPRDLFED	ELIPLCEKIG	KIYEMRMMMD	FNGNNRGYAF
VTFSNKVEAK	NAIKQLNNYE	IRNGRLLGVC	ASVDNCRLFV	GGIPKTKKRE
EILSEMKKVT	EGVVDVIVYP	SAADKTKNRG	FAFVEYESHR	AAAMARRKLL
PGRIQLWGHG	IAVDWAEPEV	EVDEDTMSSV	KILYVRNLML	STSEEMIEKE
FNNIKPGAVE	RVKKIRDYAF	VHFSNREDAV	EAMKALNGKV	LDGSPIEVTL
AKPVDKDSYV	RYTRGTGGRG	TMLQGEYTYS	LGQVYDPTTT	YLGAPVFYAP
QTYAAIPSLH	FPATKGHLSN	RAIIRAPSVR	EIYMNVPVGA	AGVRGLGGRG
YLAYTGLGRG	YQVKGDKRED	KLYDILPGME	LTPMNPVTLK	PQGIKLAPQI
LEEICQKNNW	GQPVYQLHSA	IGQDQRQLFL	YKITIPALAS	QNPAIHPFTP
PKLSAFVDEA	KTYAAEYTLQ	TLGIPTDGGD	GTMATAAAAA	TAFPGYAVPN
ATAPVSAAQL	KQAVTLGQDL	AAYTTYEVYP	TFAVTARGDG	YGTF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.

Цей білок бере участь у редагуванні РНК шляхом дезамінування цитидину разом з білком APOBEC1. Комплекс редагує вже зрілі мРНК в ядрі. Він розпізнає ділянку РНК у 30-40 нуклеотидів, яка утворює шпильку, причому цільовий цитозин міститься в «голівці» (неспареній ділянці) цієї шпильки. Білок ACF виконує адапторну функцію, забезпечуючи контакт дезамінази з РНК. Комплекс розпізнає послідовність UUUN(A/U)U, яка має міститися далі за сайтом редагування та перетинається з якірною послідовністю, до якої приєднується молекула ACF. Від ступеня збігу цієї ділянки різних РНК з послідовністю мРНК ApoB залежить ефективність редагування конкретного цитидину.

Література

Mehta A., Kinter M.T., Sherman N.E., Driscoll D.M. (2000). Molecular cloning of APOBEC-1 complementation factor, a novel RNA-binding protein involved in the editing of apolipoprotein B mRNA. Mol. Cell. Biol. 20: 1846—1854. PMID 10669759 DOI:10.1128/MCB.20.5.1846-1854.2000
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Henderson J.O., Blanc V., Davidson N.O. (2001). Isolation, characterization and developmental regulation of the human apobec-1 complementation factor (ACF) gene. Biochim. Biophys. Acta. 1522: 22—30. PMID 11718896 DOI:10.1016/S0167-4781(01)00295-0
Mehta A., Driscoll D.M. (2002). Identification of domains in apobec-1 complementation factor required for RNA binding and apolipoprotein-B mRNA editing. RNA. 8: 69—82. PMID 11871661 DOI:10.1017/S1355838202015649
Blanc V., Kennedy S., Davidson N.O. (2003). A novel nuclear localization signal in the auxiliary domain of apobec-1 complementation factor regulates nucleocytoplasmic import and shuttling. J. Biol. Chem. 278: 41198—41204. PMID 12896982 DOI:10.1074/jbc.M302951200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24086 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9NQ94 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24086 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9NQ94 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]