ABCA5

ABCA5
Ідентифікатори
Символи	ABCA5, ABC13, EST90625, ATP binding cassette subfamily A member 5, HTC3
Зовнішні ІД	OMIM: 612503 MGI: 2386607 HomoloGene: 10263 GeneCards: ABCA5
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ATPase activity • ATP binding • lipid transporter activity • ATPase-coupled transmembrane transporter activity Клітинна компонента • integral component of membrane • ендосома • late endosome • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • late endosome membrane • мембрана • Golgi membrane • лізосома • lysosomal membrane Біологічний процес • lipid transport • high-density lipoprotein particle remodeling • cholesterol efflux • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation • reverse cholesterol transport • cholesterol transport • трансмембранний транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23461	217265
Ensembl	ENSG00000154265	ENSMUSG00000018800
UniProt	Q8WWZ7	Q8K448
RefSeq (мРНК)	NM_172232 NM_018672	NM_147219
RefSeq (білок)	NP_061142 NP_758424	NP_671752
Локус (UCSC)	Хр. 17: 69.24 – 69.33 Mb	Хр. 11: 110.16 – 110.23 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ABCA5 (англ. ATP binding cassette subfamily A member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 642 амінокислот, а молекулярна маса — 186 508^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSTAIREVGV		WRQTRTLLLK		NYLIKCRTKK		SSVQEILFPL		FFLFWLILIS
MMHPNKKYEE		VPNIELNPMD		KFTLSNLILG		YTPVTNITSS		IMQKVSTDHL
PDVIITEEYT		NEKEMLTSSL		SKPSNFVGVV		FKDSMSYELR		FFPDMIPVSS
IYMDSRAGCS		KSCEAAQYWS		SGFTVLQASI		DAAIIQLKTN		VSLWKELEST
KAVIMGETAV		VEIDTFPRGV		ILIYLVIAFS		PFGYFLAIHI		VAEKEKKIKE
FLKIMGLHDT		AFWLSWVLLY		TSLIFLMSLL		MAVIATASLL		FPQSSSIVIF
LLFFLYGLSS		VFFALMLTPL		FKKSKHVGIV		EFFVTVAFGF		IGLMIILIES
FPKSLVWLFS		PFCHCTFVIG		IAQVMHLEDF		NEGASFSNLT		AGPYPLIITI
IMLTLNSIFY		VLLAVYLDQV		IPGEFGLRRS		SLYFLKPSYW		SKSKRNYEEL
SEGNVNGNIS		FSEIIEPVSS		EFVGKEAIRI		SGIQKTYRKK		GENVEALRNL
SFDIYEGQIT		ALLGHSGTGK		STLMNILCGL		CPPSDGFASI		YGHRVSEIDE
MFEARKMIGI		CPQLDIHFDV		LTVEENLSIL		ASIKGIPANN		IIQEVQKVLL
DLDMQTIKDN		QAKKLSGGQK		RKLSLGIAVL		GNPKILLLDE		PTAGMDPCSR
HIVWNLLKYR		KANRVTVFST		HFMDEADILA		DRKAVISQGM		LKCVGSSMFL
KSKWGIGYRL		SMYIDKYCAT		ESLSSLVKQH		IPGATLLQQN		DQQLVYSLPF
KDMDKFSGLF		SALDSHSNLG		VISYGVSMTT		LEDVFLKLEV		EAEIDQADYS
VFTQQPLEEE		MDSKSFDEME		QSLLILSETK		AALVSTMSLW		KQQMYTIAKF
HFFTLKRESK		SVRSVLLLLL		IFFTVQIFMF		LVHHSFKNAV		VPIKLVPDLY
FLKPGDKPHK		YKTSLLLQNS		ADSDISDLIS		FFTSQNIMVT		MINDSDYVSV
APHSAALNVM		HSEKDYVFAA		VFNSTMVYSL		PILVNIISNY		YLYHLNVTET
IQIWSTPFFQ		EITDIVFKIE		LYFQAALLGI		IVTAMPPYFA		MENAENHKIK
AYTQLKLSGL		LPSAYWIGQA		VVDIPLFFII		LILMLGSLLA		FHYGLYFYTV
KFLAVVFCLI		GYVPSVILFT		YIASFTFKKI		LNTKEFWSFI		YSVAALACIA
ITEITFFMGY		TIATILHYAF		CIIIPIYPLL		GCLISFIKIS		WKNVRKNVDT
YNPWDRLSVA		VISPYLQCVL		WIFLLQYYEK		KYGGRSIRKD		PFFRNLSTKS
KNRKLPEPPD		NEDEDEDVKA		ERLKVKELMG		CQCCEEKPSI		MVSNLHKEYD
DKKDFLLSRK		VKKVATKYIS		FCVKKGEILG		LLGPNGAGKS		TIINILVGDI
EPTSGQVFLG		DYSSETSEDD		DSLKCMGYCP		QINPLWPDTT		LQEHFEIYGA
VKGMSASDMK		EVISRITHAL		DLKEHLQKTV		KKLPAGIKRK		LCFALSMLGN
PQITLLDEPS		TGMDPKAKQH		MWRAIRTAFK		NRKRAAILTT		HYMEEAEAVC
DRVAIMVSGQ		LRCIGTVQHL		KSKFGKGYFL		EIKLKDWIEN		LEVDRLQREI
QYIFPNASRQ		ESFSSILAYK		IPKEDVQSLS		QSFFKLEEAK		HAFAIEEYSF
SQATLEQVFV		ELTKEQEEED		NSCGTLNSTL		WWERTQEDRV		VF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• Petry F., Kotthaus A., Hirsch-Ernst K.I. (2003). Cloning of human and rat ABCA5/Abca5 and detection of a human splice variant. Biochem. Biophys. Res. Commun. 300: 343—350. PMID 12504089 doi:10.1016/S0006-291X(02)02827-9
• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 doi:10.1093/dnares/8.4.179

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:35 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
4. UniProt, Q8WWZ7 (англ.) . Архів оригіналу за 1 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 17

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»