ABCE1

ABCE1
Ідентифікатори
Символи	ABCE1, ABC38, OABP, RLI, RNASEL1, RNASELI, RNS4I, ATP binding cassette subfamily E member 1, RLI1
Зовнішні ІД	OMIM: 601213 MGI: 1195458 HomoloGene: 2205 GeneCards: ABCE1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • ATPase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • iron ion binding; • ribosomal small subunit binding; • ATP binding; • endoribonuclease inhibitor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мітохондріальний матрикс; • мембрана; • мітохондрія; • eukaryotic translation initiation factor 3 complex; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• GO:0022415 viral process; • ribosomal subunit export from nucleus; • translational termination; • negative regulation of endoribonuclease activity; • translational initiation; • regulation of type I interferon-mediated signaling pathway; • defense response to virus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6059
	24015
	ENSG00000164163
	ENSMUSG00000058355
	P61221
	P61222
	NM_002940; NM_001040876
	NM_015751
	NP_001035809; NP_002931
	NP_056566
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ABCE1 (англ. ATP binding cassette subfamily E member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 599 амінокислот, а молекулярна маса — 67 314^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADKLTRIAI	VNHDKCKPKK	CRQECKKSCP	VVRMGKLCIE	VTPQSKIAWI
SETLCIGCGI	CIKKCPFGAL	SIVNLPSNLE	KETTHRYCAN	AFKLHRLPIP
RPGEVLGLVG	TNGIGKSTAL	KILAGKQKPN	LGKYDDPPDW	QEILTYFRGS
ELQNYFTKIL	EDDLKAIIKP	QYVDQIPKAA	KGTVGSILDR	KDETKTQAIV
CQQLDLTHLK	ERNVEDLSGG	ELQRFACAVV	CIQKADIFMF	DEPSSYLDVK
QRLKAAITIR	SLINPDRYII	VVEHDLSVLD	YLSDFICCLY	GVPSAYGVVT
MPFSVREGIN	IFLDGYVPTE	NLRFRDASLV	FKVAETANEE	EVKKMCMYKY
PGMKKKMGEF	ELAIVAGEFT	DSEIMVMLGE	NGTGKTTFIR	MLAGRLKPDE
GGEVPVLNVS	YKPQKISPKS	TGSVRQLLHE	KIRDAYTHPQ	FVTDVMKPLQ
IENIIDQEVQ	TLSGGELQRV	ALALCLGKPA	DVYLIDEPSA	YLDSEQRLMA
ARVVKRFILH	AKKTAFVVEH	DFIMATYLAD	RVIVFDGVPS	KNTVANSPQT
LLAGMNKFLS	QLEITFRRDP	NNYRPRINKL	NSIKDVEQKK	SGNYFFLDD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

Bisbal C., Martinand C., Silhol M., Lebleu B., Salehzada T. (1995). Cloning and characterization of a RNase L inhibitor. A new component of the interferon-regulated 2-5A pathway. J. Biol. Chem. 270: 13308—13317. PMID 7539425 DOI:10.1074/jbc.270.22.13308
Aubry F., Mattei M.-G., Barque J.-P., Galibert F. (1996). Chromosomal localization and expression pattern of the RNase L inhibitor gene. FEBS Lett. 381: 135—139. PMID 8641422 DOI:10.1016/0014-5793(96)00099-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Martinand C., Salehzada T., Silhol M., Lebleu B., Bisbal C. (1998). RNase L inhibitor (RLI) antisense constructions block partially the down regulation of the 2-5A/RNase L pathway in encephalomyocarditis-virus-(EMCV)-infected cells. Eur. J. Biochem. 254: 248—255. PMID 9660177 DOI:10.1046/j.1432-1327.1998.2540248.x
Dooher J.E., Lingappa J.R. (2004). Conservation of a stepwise, energy-sensitive pathway involving HP68 for assembly of primate lentivirus capsids in cells. J. Virol. 78: 1645—1656. PMID 14747530 DOI:10.1128/JVI.78.4.1645-1656.2004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:69 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 18 вересня 2017.
↑ UniProt, P61221 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:69 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 18 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P61221 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]