AGER

AGER
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2ENS, 2M1K, 2LE9, 4LP5, 2MOV, 3O3U, 2LMB, 4LP4, 4OF5, 4OI8, 4XYN, 2MJW, 2E5E, 2L7U, 3CJJ, 4OFV, 4P2Y, 4OI7, 4YBH,%%s1PWI, 2BJP, 2E5E, 2ENS, 2L7U, 2LE9, 2LMB, 2M1K, 2MJW, 2MOV, 3CJJ, 3O3U, 4LP4, 4LP5, 4OF5, 4OFV, 4OI7, 4OI8, 4P2Y, 4XYN
Ідентифікатори
Символи	AGER, Ager, RAGE, SCARJ1, advanced glycosylation end product-specific receptor, advanced glycosylation end-product specific receptor, sRAGE
Зовнішні ІД	OMIM: 600214 MGI: 893592 HomoloGene: 883 GeneCards: AGER
Онтологія гена
Молекулярна функція	• S100 protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • transmembrane signaling receptor activity; • advanced glycation end-product binding; • heparin binding; • amyloid-beta binding; • scavenger receptor activity; • signaling receptor activity; • advanced glycation end-product receptor activity; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • integral component of plasma membrane; • extracellular region; • fibrillar center; • клітинна мембрана; • міжклітинні контакти; • cell surface; • apical plasma membrane; • postsynapse;
Біологічний процес	• negative regulation of interleukin-10 production; • positive regulation of interleukin-12 production; • cell surface receptor signaling pathway; • response to wounding; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of dendritic cell differentiation; • вроджений імунітет; • inflammatory response; • regulation of T cell mediated cytotoxicity; • regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell activation; • positive regulation of activated T cell proliferation; • negative regulation of advanced glycation end-product receptor activity; • protein localization to membrane; • positive regulation of JUN kinase activity; • regulation of DNA binding; • induction of positive chemotaxis; • regulation of inflammatory response; • response to hypoxia; • astrocyte development; • neuron projection development; • negative regulation of connective tissue replacement involved in inflammatory response wound healing; • positive regulation of monocyte chemotactic protein-1 production; • positive regulation of protein phosphorylation; • рецептор-опосередкований ендоцитоз; • learning or memory; • glucose mediated signaling pathway; • positive regulation of heterotypic cell-cell adhesion; • Цитопемпсис; • positive regulation of JNK cascade; • regulation of synaptic plasticity; • positive regulation of astrocyte activation; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • regulation of spontaneous synaptic transmission; • regulation of long-term synaptic potentiation; • negative regulation of long-term synaptic potentiation; • negative regulation of long-term synaptic depression; • regulation of p38MAPK cascade; • positive regulation of p38MAPK cascade; • regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • positive regulation of aspartic-type endopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process; • negative regulation of blood circulation; • positive regulation of microglial cell activation; • response to amyloid-beta; • cellular response to amyloid-beta; • positive regulation of monocyte extravasation; • ендоцитоз;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	177
	11596
ENSG00000237405; ENSG00000206320; ENSG00000231268; ENSG00000234729; ENSG00000229058;
	ENSG00000204305; ENSG00000230514
	ENSMUSG00000015452
	Q15109
	Q62151
NM_001136; NM_001206929; NM_001206932; NM_001206934; NM_001206936;
	NM_001206940; NM_001206954; NM_001206966; NM_172197
	NM_001271422; NM_001271423; NM_001271424; NM_007425
NP_001127; NP_001193858; NP_001193861; NP_001193863; NP_001193865;
	NP_001193869; NP_001193883; NP_001193895; NP_751947
	NP_001258351; NP_001258352; NP_001258353; NP_031451
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

AGER (англ. Advanced glycosylation end-product specific receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 404 амінокислот, а молекулярна маса — 42 803^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAGTAVGAW	VLVLSLWGAV	VGAQNITARI	GEPLVLKCKG	APKKPPQRLE
WKLNTGRTEA	WKVLSPQGGG	PWDSVARVLP	NGSLFLPAVG	IQDEGIFRCQ
AMNRNGKETK	SNYRVRVYQI	PGKPEIVDSA	SELTAGVPNK	VGTCVSEGSY
PAGTLSWHLD	GKPLVPNEKG	VSVKEQTRRH	PETGLFTLQS	ELMVTPARGG
DPRPTFSCSF	SPGLPRHRAL	RTAPIQPRVW	EPVPLEEVQL	VVEPEGGAVA
PGGTVTLTCE	VPAQPSPQIH	WMKDGVPLPL	PPSPVLILPE	IGPQDQGTYS
CVATHSSHGP	QESRAVSISI	IEPGEEGPTA	GSVGGSGLGT	LALALGILGG
LGTAALLIGV	ILWQRRQRRG	EERKAPENQE	EEEERAELNQ	SEEPEAGESS
TGGP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Jules J., Maiguel D., Hudson B.I. (2013). Alternative splicing of the RAGE cytoplasmic domain regulates cell signaling and function. PLoS ONE. 8: E78267—E78267. PMID 24260107 doi:10.1371/journal.pone.0078267
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Hudson B.I., Stickland M.H., Futers T.S., Grant P.J. (2001). Effects of novel polymorphisms in the RAGE gene on transcriptional regulation and their association with diabetic retinopathy. Diabetes. 50: 1505—1511. PMID 11375354 doi:10.2337/diabetes.50.6.1505
Jin Q., Chen H., Luo A., Ding F., Liu Z. (2011). S100A14 stimulates cell proliferation and induces cell apoptosis at different concentrations via receptor for advanced glycation end products (RAGE). PLoS ONE. 6: E19375—E19375. PMID 21559403 doi:10.1371/journal.pone.0019375
Park H., Adsit F.G., Boyington J.C. (2010). The 1.5 A crystal structure of human receptor for advanced glycation endproducts (RAGE) ectodomains reveals unique features determining ligand binding. J. Biol. Chem. 285: 40762—40770. PMID 20943659 doi:10.1074/jbc.M110.169276

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:320 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-18 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q15109 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:320 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-18 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q15109 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]