AMBRA1

AMBRA1
Ідентифікатори
Символи	AMBRA1, DCAF3, WDR94, autophagy and beclin 1 regulator 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611359 MGI: 2443564 HomoloGene: 18204 GeneCards: AMBRA1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • GTPase binding Клітинна компонента • цитоплазма • autophagosome • мітохондріальна зовнішня мембрана • phagocytic vesicle • мітохондрія • perinuclear region of cytoplasm • GO:0035085 Аксонема • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма Біологічний процес • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • диференціація клітин • нейробіологія розвитку • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • автофагія • multicellular organism development • neural tube development • macroautophagy • negative regulation of cell population proliferation • cellular response to starvation • positive regulation of autophagy • negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • response to nutrient levels • autophagosome assembly • autophagy of mitochondrion • mitophagy • response to mitochondrial depolarisation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55626	228361
Ensembl	ENSG00000110497	ENSMUSG00000040506
UniProt	Q9C0C7	A2AH22
RefSeq (мРНК)	NM_001267782 NM_001267783 NM_001300731 NM_017749 NM_001367468 NM_001367469 NM_001367470 NM_001367471 NM_001387011	NM_001080754 NM_172669
RefSeq (білок)	NP_001254711 NP_001254712 NP_001287660 NP_060219 NP_001354397 NP_001354398 NP_001354399 NP_001354400	NP_001074223 NP_766257
Локус (UCSC)	Хр. 11: 46.4 – 46.59 Mb	Хр. 2: 91.56 – 91.75 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AMBRA1 (англ. Autophagy and beclin 1 regulator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 298 амінокислот, а молекулярна маса — 142 507^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKVVPEKNAV		RILWGRERGA		RAMGAQRLLQ		ELVEDKTRWM		KWEGKRVELP
DSPRSTFLLA		FSPDRTLLAS		THVNHNIYIT		EVKTGKCVHS		LIGHRRTPWC
VTFHPTISGL		IASGCLDGEV		RIWDLHGGSE		SWFTDSNNAI		ASLAFHPTAQ
LLLIATANEI		HFWDWSRREP		FAVVKTASEM		ERVRLVRFDP		LGHYLLTAIV
NPSNQQGDDE		PEIPIDGTEL		SHYRQRALLQ		SQPVRRTPLL		HNFLHMLSSR
SSGIQVGEQS		TVQDSATPSP		PPPPPQPSTE		RPRTSAYIRL		RQRVSYPTAE
CCQHLGILCL		CSRCSGTRVP		SLLPHQDSVP		PASARATTPS		FSFVQTEPFH
PPEQASSTQQ		DQGLLNRPSA		FSTVQSSTAG		NTLRNLSLGP		TRRSLGGPLS
SHPSRYHREI		APGLTGSEWT		RTVLSLNSRS		EAESMPPPRT		SASSVSLLSV
LRQQEGGSQA		SVYTSATEGR		GFPASGLATE		SDGGNGSSQN		NSGSIRHELQ
CDLRRFFLEY		DRLQELDQSL		SGEAPQTQQA		QEMLNNNIES		ERPGPSHQPT
PHSSENNSNL		SRGHLNRCRA		CHNLLTFNND		TLRWERTTPN		YSSGEASSSW
QVPSSFESVP		SSGSQLPPLE		RTEGQTPSSS		RLELSSSASP		QEERTVGVAF
NQETGHWERI		YTQSSRSGTV		SQEALHQDMP		EESSEEDSLR		RRLLESSLIS
LSRYDGAGSR		EHPIYPDPAR		LSPAAYYAQR		MIQYLSRRDS		IRQRSMRYQQ
NRLRSSTSSS		SSDNQGPSVE		GTDLEFEDFE		DNGDRSRHRA		PRNARMSAPS
LGRFVPRRFL		LPEYLPYAGI		FHERGQPGLA		THSSVNRVLA		GAVIGDGQSA
VASNIANTTY		RLQWWDFTKF		DLPEISNASV		NVLVQNCKIY		NDASCDISAD
GQLLAAFIPS		SQRGFPDEGI		LAVYSLAPHN		LGEMLYTKRF		GPNAISVSLS
PMGRYVMVGL		ASRRILLHPS		TEHMVAQVFR		LQQAHGGETS		MRRVFNVLYP
MPADQRRHVS		INSARWLPEP		GLGLAYGTNK		GDLVICRPEA		LNSGVEYYWD
QLNETVFTVH		SNSRSSERPG		TSRATWRTDR		DMGLMNAIGL		QPRNPATSVT
SQGTQTLALQ		LQNAETQTER		EVPEPGTAAS		GPGEGEGSEY		GASGEDALSR
IQRLMAEGGM		TAVVQREQST		TMASMGGFGN		NIIVSHRIHR		SSQTGTEPGA
AHTSSPQPST		SRGLLPEAGQ		LAERGLSPRT		ASWDQPGTPG		REPTQPTLPS
SSPVPIPVSL		PSAEGPTLHC		ELTNNNHLLD		GGSSRGDAAG		PRGEPRNR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг, метилювання. Локалізований у цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25990 (англ.) . Архів оригіналу за 13 жовтня 2017. Процитовано 19 вересня 2017. [Архівовано 2017-10-13 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q9C0C7 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 11

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»