ARHGEF3

ARHGEF3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Z0Q
Ідентифікатори
Символи	ARHGEF3, GEF3, STA3, XPLN, Rho guanine nucleotide exchange factor 3
Зовнішні ІД	OMIM: 612115 MGI: 1918954 HomoloGene: 41329 GeneCards: ARHGEF3
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, ревматоїдний артрит[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинний Біологічний процес • regulation of Rho protein signal transduction • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • Rho protein signal transduction • positive regulation of apoptotic process • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	50650	71704
Ensembl	ENSG00000163947	ENSMUSG00000021895
UniProt	Q9NR81	Q91X46
RefSeq (мРНК)	NM_001128615 NM_001128616 NM_001289698 NM_019555 NM_001377407 NM_001377408 NM_001377409 NM_001377410 NM_001377411 NM_001377412 NM_001377413 NM_001377414 NM_001377415	NM_001289686 NM_001289687 NM_001289688 NM_027871
RefSeq (білок)	NP_001122087 NP_001122088 NP_001276627 NP_062455 NP_001364336 NP_001364337 NP_001364338 NP_001364339 NP_001364340 NP_001364341 NP_001364342 NP_001364343 NP_001364344	NP_001276615 NP_001276616 NP_001276617 NP_082147
Локус (UCSC)	Хр. 3: 56.73 – 57.08 Mb	Хр. 14: 26.84 – 27.13 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARHGEF3 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 526 амінокислот, а молекулярна маса — 59 783^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVAKDYPFYL		TVKRANCSLE		LPPASGPAKD		AEEPSNKRVK		PLSRVTSLAN
LIPPVKATPL		KRFSQTLQRS		ISFRSESRPD		ILAPRPWSRN		AAPSSTKRRD
SKLWSETFDV		CVNQMLTSKE		IKRQEAIFEL		SQGEEDLIED		LKLAKKAYHD
PMLKLSIMTE		QELNQIFGTL		DSLIPLHEEL		LSQLRDVRKP		DGSTEHVGPI
LVGWLPCLSS		YDSYCSNQVA		AKALLDHKKQ		DHRVQDFLQR		CLESPFSRKL
DLWNFLDIPR		SRLVKYPLLL		REILRHTPND		NPDQQHLEEA		INIIQGIVAE
INTKTGESEC		RYYKERLLYL		EEGQKDSLID		SSRVLCCHGE		LKNNRGVKLH
VFLFQEVLVI		TRAVTHNEQL		CYQLYRQPIP		VKDLLLEDLQ		DGEVRLGGSL
RGAFSNNERI		KNFFRVSFKN		GSQSQTHSLQ		ANDTFNKQQW		LNCIRQAKET
VLCAAGQAGV		LDSEGSFLNP		TTGSRELQGE		TKLEQMDQSD		SESDCSMDTS
EVSLDCERME		QTDSSCGNSR		HGESNV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Thiesen S., Kuebart S., Ropers H.-H., Nothwang H.G. (2000). Isolation of two novel human RhoGEFs, ARHGEF3 and ARHGEF4, in 3p13-21 and 2q22. Biochem. Biophys. Res. Commun. 273: 364—369. PMID 10873612 DOI:10.1006/bbrc.2000.2925
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Arthur W.T., Ellerbroek S.M., Der C.J., Burridge K., Wennerberg K. (2002). XPLN, a guanine nucleotide exchange factor for RhoA and RhoB, but not RhoC. J. Biol. Chem. 277: 42964—42972. PMID 12221096 DOI:10.1074/jbc.M207401200

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з ARHGEF3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:683 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
5. UniProt, Q9NR81 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 3

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»