ARHGEF7

ARHGEF7
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BY1, 1ZSG, 2L3G
Ідентифікатори
Символи	ARHGEF7, BETA-PIX, COOL-1, COOL1, Nbla10314, P50, P50BP, P85, P85COOL1, P85SPR, PAK3, PIXB, Rho guanine nucleotide exchange factor 7
Зовнішні ІД	OMIM: 605477 MGI: 1860493 HomoloGene: 2895 GeneCards: ARHGEF7
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • guanyl-nucleotide exchange factor activity; • protein kinase binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • cell projection; • focal adhesion; • ruffle; • клітинна мембрана; • міжклітинні контакти; • soma; • cell cortex; • neuron projection; • storage vacuole; • lamellipodium; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• regulation of GTP binding; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway; • positive regulation of lamellipodium morphogenesis; • Golgi organization; • ephrin receptor signaling pathway; • нейробіологія розвитку; • focal adhesion assembly; • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading; • positive regulation of growth hormone secretion; • hematopoietic progenitor cell differentiation; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of protein binding; • regulation of Rho protein signal transduction; • regulation of small GTPase mediated signal transduction; • positive regulation of fibroblast migration; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • lamellipodium assembly; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • G protein-coupled receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	8874
	54126
	ENSG00000102606
	ENSMUSG00000031511
	Q14155
	Q9ES28
NM_001113511; NM_001113512; NM_001113513; NM_003899; NM_145735;
	NM_001320851; NM_001320852; NM_001320853; NM_001320854; NM_001330597; NM_001330598; NM_001354046; NM_001354047; NM_001354048; NM_001354049; NM_001354050; NM_001354051; NM_001354052; NM_001354053; NM_001354054; NM_001354055; NM_001354056; NM_001354057; NM_001354058; NM_001354059; NM_001354060; NM_001354061
NM_001113517; NM_001113518; NM_017402; NM_001372321; NM_001372322;
	NM_001372323; NM_001372324; NM_001372325; NM_001372326
NP_001106983; NP_001106984; NP_001106985; NP_001307780; NP_001307781;
	NP_001307782; NP_001307783; NP_001317526; NP_001317527; NP_003890; NP_663788; NP_001340975; NP_001340976; NP_001340977; NP_001340978; NP_001340979; NP_001340980; NP_001340981; NP_001340982; NP_001340983; NP_001340984; NP_001340985; NP_001340986; NP_001340987; NP_001340988; NP_001340989; NP_001340990; NP_001106985.1; NP_003890.1; NP_001307780.1
NP_001106989; NP_001106990; NP_059098; NP_001359250; NP_001359251;
	NP_001359252; NP_001359253; NP_001359254; NP_001359255
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ARHGEF7 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 803 амінокислот, а молекулярна маса — 90 012^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNSAEQTVTW	LITLGVLESP	KKTISDPEGF	LQASLKDGVV	LCRLLERLLP
GTIEKVYPEP	RSESECLSNI	REFLRGCGAS	LRLELLFPPS	QPPQHLVTTI
LLSASTFDAN	DLYQGQNFNK	VLSSLVTLNK	VTADIGLGSD	SVCARPSSHR
IKSFDSLGSQ	SLHTRTSKLF	QGQYRSLDMT	DNSNNQLVVR	AKFNFQQTNE
DELSFSKGDV	IHVTRVEEGG	WWEGTLNGRT	GWFPSNYVRE	VKASEKPVSP
KSGTLKSPPK	GFDTTAINKS	YYNVVLQNIL	ETENEYSKEL	QTVLSTYLRP
LQTSEKLSSA	NISYLMGNLE	EICSFQQMLV	QSLEECTKLP	EAQQRVGGCF
LNLMPQMKTL	YLTYCANHPS	AVNVLTEHSE	ELGEFMETKG	ASSPGILVLT
TGLSKPFMRL	DKYPTLLKEL	ERHMEDYHTD	RQDIQKSMAA	FKNLSAQCQE
VRKRKELELQ	ILTEAIRNWE	GDDIKTLGNV	TYMSQVLIQC	AGSEEKNERY
LLLFPNVLLM	LSASPRMSGF	IYQGKLPTTG	MTITKLEDSE	NHRNAFEISG
SMIERILVSC	NNQQDLQEWV	EHLQKQTKVT	SVGNPTIKPH	SVPSHTLPSH
PVTPSSKHAD	SKPAPLTPAY	HTLPHPSHHG	TPHTTINWGP	LEPPKTPKPW
SLSCLRPAPP	LRPSAALCYK	EDLSKSPKTM	KKLLPKRKPE	RKPSDEEFAS
RKSTAALEED	AQILKVIEAY	CTSAKTRQTL	NSTWQGTDLM	HNHVLADDDQ
PSLDSLGRRS	SLSRLEPSDL	SEDSDYDSIW	TAHSYRMGST	SRKSCCSYIS
HQN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
Bagrodia S., Taylor S.J., Jordon K.A., Van Aelst L., Cerione R.A. (1998). A novel regulator of p21-activated kinases. J. Biol. Chem. 273: 23633—23636. PMID 9726964 DOI:10.1074/jbc.273.37.23633
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Homma K., Kikuno R.F., Nagase T., Ohara O., Nishikawa K. (2004). Alternative splice variants encoding unstable protein domains exist in the human brain. J. Mol. Biol. 343: 1207—1220. PMID 15491607 DOI:10.1016/j.jmb.2004.09.028
Mott H.R., Nietlispach D., Evetts K.A., Owen D. (2005). Structural analysis of the SH3 domain of beta-PIX and its interaction with alpha-p21 activated kinase (PAK). Biochemistry. 44: 10977—10983. PMID 16101281 DOI:10.1021/bi050374a

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15607 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q14155 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 13

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15607 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q14155 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]