ATG12

ATG12
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4GDK, 4GDL, 4NAW
Ідентифікатори
Символи	ATG12, APG12, APG12L, FBR93, HAPG12, autophagy related 12
Зовнішні ІД	OMIM: 609608 MGI: 1914776 HomoloGene: 37953 GeneCards: ATG12
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • Atg8 ligase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • phagophore assembly site membrane • phagocytic vesicle membrane • Atg12-Atg5-Atg16 complex • мембрана • autophagosome • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • автофагія • autophagy of nucleus • C-terminal protein lipidation • autophagy of mitochondrion • macroautophagy • autophagosome assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9140	67526
Ensembl	ENSG00000145782	ENSMUSG00000032905
UniProt	O94817	Q9CQY1
RefSeq (мРНК)	NM_001277783 NM_004707	NM_026217
RefSeq (білок)	NP_001264712 NP_004698	NP_080493
Локус (UCSC)	Хр. 5: 115.83 – 115.84 Mb	Хр. 18: 46.86 – 46.87 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATG12 (англ. Autophagy related 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 140 амінокислот, а молекулярна маса — 15 113^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEEPQSVLQ		LPTSIAAGGE		GLTDVSPETT		TPEPPSSAAV		SPGTEEPAGD
TKKKIDILLK		AVGDTPIMKT		KKWAVERTRT		IQGLIDFIKK		FLKLVASEQL
FIYVNQSFAP		SPDQEVGTLY		ECFGSDGKLV		LHYCKSQAWG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, убіквітинування білків, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

• Mizushima N., Sugita H., Yoshimori T., Ohsumi Y. (1998). A new protein conjugation system in human. The counterpart of the yeast Apg12p conjugation system essential for autophagy. J. Biol. Chem. 273: 33889—33892. PMID 9852036 DOI:10.1074/jbc.273.51.33889
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tanida I., Tanida-Miyake E., Ueno T., Kominami E. (2001). The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein-activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3. J. Biol. Chem. 276: 1701—1706. PMID 11096062 DOI:10.1074/jbc.C000752200
• Tanida I., Nishitani T., Nemoto T., Ueno T., Kominami E. (2002). Mammalian Apg12p, but not the Apg12p.Apg5p conjugate, facilitates LC3 processing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296: 1164—1170. PMID 12207896 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02057-0
• Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p. J. Biol. Chem. 277: 13739—13744. PMID 11825910 DOI:10.1074/jbc.M200385200
• Shao Y., Gao Z., Feldman T., Jiang X. (2007). Stimulation of ATG12-ATG5 conjugation by ribonucleic acid. Autophagy. 3: 10—16. PMID 16963840 DOI:10.4161/auto.3270

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:588 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
4. UniProt, O94817 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 5

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»