ATG7

ATG7
Ідентифікатори
Символи	ATG7, APG7-LIKE, APG7L, GSA7, autophagy related 7, SCAR31
Зовнішні ІД	OMIM: 608760 MGI: 1921494 HomoloGene: 4662 GeneCards: ATG7
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • transcription factor binding • ubiquitin activating enzyme activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin-like modifier activating enzyme activity • Atg12 activating enzyme activity • Atg8 activating enzyme activity Клітинна компонента • цитоплазма • GO:0035085 Аксонема • extracellular region • аксон • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • гіалоплазма • phagophore assembly site Біологічний процес • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • cellular response to hyperoxia • cellular response to starvation • membrane fusion • defense response to virus • positive regulation of protein modification process • positive regulation of apoptotic process • protein transport • protein lipidation • suppression by virus of host autophagy • Убіквітин-залежний протеоліз • автофагія • GO:0010260 старіння людини • response to glucose • macroautophagy • response to nutrient levels • neutrophil degranulation • negative regulation of cell death • cellular response to morphine • negative regulation of mitochondrial DNA replication • regulation of neuron death • response to fluoride • negative regulation of oxidative stress-induced neuron death • autophagy of mitochondrion • autophagosome assembly • C-terminal protein lipidation • cellular response to nitrogen starvation • piecemeal microautophagy of the nucleus • late nucleophagy • positive regulation of autophagy • regulation of circadian rhythm • chaperone-mediated autophagy • protein modification by small protein conjugation • ритмічний процес Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10533	74244
Ensembl	ENSG00000197548	ENSMUSG00000030314
UniProt	O95352	Q9D906
RefSeq (мРНК)	NM_001136031 NM_001144912 NM_006395 NM_001349232 NM_001349233 NM_001349234 NM_001349235 NM_001349236 NM_001349237 NM_001349238	NM_001253717 NM_001253718 NM_028835 NM_001379130
RefSeq (білок)	NP_001129503 NP_001138384 NP_006386 NP_001336161 NP_001336162 NP_001336163 NP_001336164 NP_001336165 NP_001336166 NP_001336167	NP_001240646 NP_001240647 NP_083111 NP_001366059
Локус (UCSC)	Хр. 3: 11.27 – 11.56 Mb	Хр. 6: 114.62 – 114.84 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATG7 (англ. Autophagy related 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот, а молекулярна маса — 77 960^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAATGDPGL		SKLQFAPFSS		ALDVGFWHEL		TQKKLNEYRL		DEAPKDIKGY
YYNGDSAGLP		ARLTLEFSAF		DMSAPTPARC		CPAIGTLYNT		NTLESFKTAD
KKLLLEQAAN		EIWESIKSGT		ALENPVLLNK		FLLLTFADLK		KYHFYYWFCY
PALCLPESLP		LIQGPVGLDQ		RFSLKQIEAL		ECAYDNLCQT		EGVTALPYFL
IKYDENMVLV		SLLKHYSDFF		QGQRTKITIG		VYDPCNLAQY		PGWPLRNFLV
LAAHRWSSSF		QSVEVVCFRD		RTMQGARDVA		HSIIFEVKLP		EMAFSPDCPK
AVGWEKNQKG		GMGPRMVNLS		ECMDPKRLAE		SSVDLNLKLM		CWRLVPTLDL
DKVVSVKCLL		LGAGTLGCNV		ARTLMGWGVR		HITFVDNAKI		SYSNPVRQPL
YEFEDCLGGG		KPKALAAADR		LQKIFPGVNA		RGFNMSIPMP		GHPVNFSSVT
LEQARRDVEQ		LEQLIESHDV		VFLLMDTRES		RWLPAVIAAS		KRKLVINAAL
GFDTFVVMRH		GLKKPKQQGA		GDLCPNHPVA		SADLLGSSLF		ANIPGYKLGC
YFCNDVVAPG		DSTRDRTLDQ		QCTVSRPGLA		VIAGALAVEL		MVSVLQHPEG
GYAIASSSDD		RMNEPPTSLG		LVPHQIRGFL		SRFDNVLPVS		LAFDKCTACS
SKVLDQYERE		GFNFLAKVFN		SSHSFLEDLT		GLTLLHQETQ		AAEIWDMSDD
ETI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Yuan W., Stromhaug P.E., Dunn W.A. Jr. (1999). Glucose-induced autophagy of peroxisomes in Pichia pastoris requires a unique E1-like protein. Mol. Biol. Cell. 10: 1353—1366. PMID 10233149 DOI:10.1091/mbc.10.5.1353
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tanida I., Tanida-Miyake E., Ueno T., Kominami E. (2001). The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein-activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3. J. Biol. Chem. 276: 1701—1706. PMID 11096062 DOI:10.1074/jbc.C000752200
• Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p. J. Biol. Chem. 277: 13739—13744. PMID 11825910 DOI:10.1074/jbc.M200385200
• Sou Y.S., Tanida I., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2006). Phosphatidylserine in addition to phosphatidylethanolamine is an in vitro target of the mammalian Atg8 modifiers, LC3, GABARAP, and GATE-16. J. Biol. Chem. 281: 3017—3024. PMID 16303767 DOI:10.1074/jbc.M505888200
• Lee I.H., Finkel T. (2009). Regulation of autophagy by the p300 acetyltransferase. J. Biol. Chem. 284: 6322—6328. PMID 19124466 DOI:10.1074/jbc.M807135200

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16935 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
4. UniProt, O95352 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 3

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»