BRDT

BRDT
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2RFJ, 4FLP, 4KCX
Ідентифікатори
Символи	BRDT, BRD6, CT9, bromodomain testis associated, SPGF21
Зовнішні ІД	OMIM: 602144 MGI: 1891374 HomoloGene: 21064 GeneCards: BRDT
Реагує на сполуку
	JQ1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0031493 histone binding; • lysine-acetylated histone binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• male meiotic nuclear division; • positive regulation of transcription involved in meiotic cell cycle; • ремоделювання хроматину; • mRNA processing; • male meiosis I; • диференціація клітин; • regulation of RNA splicing; • GO:0007126 мейоз; • transcription, DNA-templated; • Сперматогенез; • Сплайсинг РНК; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	676
	114642
	ENSG00000137948
	ENSMUSG00000029279
	Q58F21
	Q91Y44
NM_001242805; NM_001242806; NM_001242807; NM_001242808; NM_001242810;
	NM_001726; NM_207189
	NM_001079873; NM_054054
NP_001229734; NP_001229735; NP_001229736; NP_001229737; NP_001229739;
	NP_001717; NP_997072
	NP_001073342; NP_473395
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

BRDT (англ. Bromodomain testis associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 947 амінокислот, а молекулярна маса — 107 954^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLPSRQTAI	IVNPPPPEYI	NTKKNGRLTN	QLQYLQKVVL	KDLWKHSFSW
PFQRPVDAVK	LQLPDYYTII	KNPMDLNTIK	KRLENKYYAK	ASECIEDFNT
MFSNCYLYNK	PGDDIVLMAQ	ALEKLFMQKL	SQMPQEEQVV	GVKERIKKGT
QQNIAVSSAK	EKSSPSATEK	VFKQQEIPSV	FPKTSISPLN	VVQGASVNSS
SQTAAQVTKG	VKRKADTTTP	ATSAVKASSE	FSPTFTEKSV	ALPPIKENMP
KNVLPDSQQQ	YNVVKTVKVT	EQLRHCSEIL	KEMLAKKHFS	YAWPFYNPVD
VNALGLHNYY	DVVKNPMDLG	TIKEKMDNQE	YKDAYKFAAD	VRLMFMNCYK
YNPPDHEVVT	MARMLQDVFE	THFSKIPIEP	VESMPLCYIK	TDITETTGRE
NTNEASSEGN	SSDDSEDERV	KRLAKLQEQL	KAVHQQLQVL	SQVPFRKLNK
KKEKSKKEKK	KEKVNNSNEN	PRKMCEQMRL	KEKSKRNQPK	KRKQQFIGLK
SEDEDNAKPM	NYDEKRQLSL	NINKLPGDKL	GRVVHIIQSR	EPSLSNSNPD
EIEIDFETLK	ASTLRELEKY	VSACLRKRPL	KPPAKKIMMS	KEELHSQKKQ
ELEKRLLDVN	NQLNSRKRQT	KSDKTQPSKA	VENVSRLSES	SSSSSSSSES
ESSSSDLSSS	DSSDSESEMF	PKFTEVKPND	SPSKENVKKM	KNECIPPEGR
TGVTQIGYCV	QDTTSANTTL	VHQTTPSHVM	PPNHHQLAFN	YQELEHLQTV
KNISPLQILP	PSGDSEQLSN	GITVMHPSGD	SDTTMLESEC	QAPVQKDIKI
KNADSWKSLG	KPVKPSGVMK	SSDELFNQFR	KAAIEKEVKA	RTQELIRKHL
EQNTKELKAS	QENQRDLGNG	LTVESFSNKI	QNKCSGEEQK	EHQQSSEAQD
KSKLWLLKDR	DLARQKEQER	RRREAMVGTI	DMTLQSDIMT	MFENNFD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, сперматогенез, мейоз, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

Jones M.H., Numata M., Shimane M. (1997). Identification and characterization of BRDT: a testis-specific gene related to the bromodomain genes RING3 and Drosophila fsh. Genomics. 45: 529—534. PMID 9367677 doi:10.1006/geno.1997.5000
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Fukazawa H., Masumi A. (2012). The conserved 12-amino acid stretch in the inter-bromodomain region of BET family proteins functions as a nuclear localization signal. Biol. Pharm. Bull. 35: 2064—2068. PMID 22971749 doi:10.1248/bpb.b12-00527
Zheng Y., Yuan W., Zhou Z., Xu M., Sha J.-H. (2005). Molecular cloning and expression of a novel alternative splice variant of BRDT gene. Int. J. Mol. Med. 15: 315—321. PMID 15647849

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з bromodomain testis associated переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1105 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q58F21 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з bromodomain testis associated переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1105 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q58F21 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]