CASS4

CASS4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CRE
Ідентифікатори
Символи	CASS4, C20orf32, CAS4, HEFL, HEPL, Cas scaffolding protein family member 4, Cas scaffold protein family member 4
Зовнішні ІД	MGI: 2444482 HomoloGene: 75128 GeneCards: CASS4
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • structural constituent of cytoskeleton • protein tyrosine kinase binding Клітинна компонента • цитоплазма • міжклітинні контакти • цитоскелет • focal adhesion • клітинна мембрана Біологічний процес • адгезія клітин • positive regulation of cell migration • positive regulation of protein tyrosine kinase activity • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • cell migration • actin filament reorganization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57091	320664
Ensembl	ENSG00000087589	ENSMUSG00000074570
UniProt	Q9NQ75	Q08EC4
RefSeq (мРНК)	NM_001164114 NM_001164115 NM_001164116 NM_020356	NM_001033538 NM_001080820 NM_001276422 NM_001276423 NM_001379465 NM_001379466 NM_001379467
RefSeq (білок)	NP_001157586 NP_001157587 NP_001157588 NP_065089	NP_001074289 NP_001263351 NP_001263352 NP_001366394 NP_001366395 NP_001366396
Локус (UCSC)	Хр. 20: 56.41 – 56.46 Mb	Хр. 2: 172.24 – 172.28 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CASS4 (англ. Cas scaffolding protein family member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 786 амінокислот, а молекулярна маса — 87 144^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKGTGIMDCA		PKALLARALY		DNCPDCSDEL		AFSRGDILTI		LEQHVPESEG
WWKCLLHGRQ		GLAPANRLQI		LTEVAADRPC		PPFLRGLEEA		PASSEETYQV
PTLPRPPTPG		PVYEQMRSWA		EGPQPPTAQV		YEFPDPPTSA		RIICEKTLSF
PKQAILTLPR		PVRASLPTLP		SQVYDVPTQH		RGPVVLKEPE		KQQLYDIPAS
PKKAGLHPPD		SQASGQGVPL		ISVTTLRRGG		YSTLPNPQKS		EWIYDTPVSP
GKASVRNTPL		TSFAEESRPH		ALPSSSSTFY		NPPSGRSRSL		TPQLNNNVPM
QKKLSLPEIP		SYGFLVPRGT		FPLDEDVSYK		VPSSFLIPRV		EQQNTKPNIY
DIPKATSSVS		QAGKELEKAK		EVSENSAGHN		SSWFSRRTTS		PSPEPDRLSG
SSSDSRASIV		SSCSTTSTDD		SSSSSSEESA		KELSLDLDVA		KETVMALQHK
VVSSVAGLML		FVSRKWRFRD		YLEANIDAIH		RSTDHIEESV		REFLDFARGV
HGTACNLTDS		NLQNRIRDQM		QTISNSYRIL		LETKESLDNR		NWPLEVLVTD
SVQNSPDDLE		RFVMVARMLP		EDIKRFASIV		IANGRLLFKR		NCEKEETVQL
TPNAEFKCEK		YIQPPQRETE		SHQKSTPSTK		QREDEHSSEL		LKKNRANICG
QNPGPLIPQP		SSQQTPERKP		RLSEHCRLYF		GALFKAISAF		HGSLSSSQPA
EIITQSKLVI		MVGQKLVDTL		CMETQERDVR		NEILRGSSHL		CSLLKDVALA
TKNAVLTYPS		PAALGHLQAE		AEKLEQHTRQ		FRGTLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з CASS4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15878 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
5. UniProt, Q9NQ75 (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 20

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»