CCL1

CCL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1EL0, 4OIJ, 4OIK
Ідентифікатори
Символи	CCL1, I-309, P500, SCYA1, SISe, TCA3, C-C motif chemokine ligand 1
Зовнішні ІД	OMIM: 182281 MGI: 98258 HomoloGene: 55541 GeneCards: CCL1
Онтологія гена Молекулярна функція • cytokine activity • CCR chemokine receptor binding • chemokine activity Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • chemokine-mediated signaling pathway • cellular response to tumor necrosis factor • cellular calcium ion homeostasis • neutrophil chemotaxis • хемотаксис • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • cellular response to interleukin-1 • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to interferon-gamma • lymphocyte chemotaxis • inflammatory response • GO:0022415 viral process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • positive regulation of monocyte chemotaxis • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • positive regulation of inflammatory response • monocyte chemotaxis • eosinophil chemotaxis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6346	20290
Ensembl	ENSG00000108702	ENSMUSG00000020702
UniProt	P22362	P10146
RefSeq (мРНК)	NM_002981	NM_011329
RefSeq (білок)	NP_002972	NP_035459
Локус (UCSC)	Хр. 17: 34.36 – 34.36 Mb	Хр. 11: 82.07 – 82.2 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CCL1 (англ. C-C motif chemokine ligand 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 96 амінокислот, а молекулярна маса — 10 992^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQIITTALVC		LLLAGMWPED		VDSKSMQVPF		SRCCFSFAEQ		EIPLRAILCY
RNTSSICSNE		GLIFKLKRGK		EACALDTVGW		VQRHRKMLRH		CPSKRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі, як хемотаксис. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Miller M.D., Krangel M.S. (1992). The human cytokine I-309 is a monocyte chemoattractant. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 2950—2954. PMID 1557400 DOI:10.1073/pnas.89.7.2950
• Miller M.D., Hata S., Waal Malefyt R., Krangel M.S. (1989). A novel polypeptide secreted by activated human T lymphocytes. J. Immunol. 143: 2907—2916. PMID 2809212

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10609 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 21 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P22362 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 17

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»