CDH13

CDH13
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2V37
Ідентифікатори
Символи	CDH13, CDHH, P105, cadherin 13
Зовнішні ІД	OMIM: 601364 MGI: 99551 HomoloGene: 20335 GeneCards: CDH13
Пов'язані генетичні захворювання
періодонтит, шизофренія, депресія клінічна, розлад дефіциту уваги та гіперактивності[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • protein homodimerization activity • adiponectin binding • cadherin binding • зв'язування з іоном металу • low-density lipoprotein particle binding • lipoprotein particle binding • cytoskeletal protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • focal adhesion • клітинна мембрана • perinuclear region of cytoplasm • caveola • anchored component of membrane • neuron projection • екзосома • external side of plasma membrane • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • cell surface • catenin complex • синапс • collagen-containing extracellular matrix • GABA-ergic synapse Біологічний процес • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • regulation of endocytosis • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • negative regulation of cell adhesion • positive regulation of calcium-mediated signaling • positive regulation of endothelial cell proliferation • positive regulation of cell-matrix adhesion • positive regulation of cell migration • low-density lipoprotein particle mediated signaling • regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • sprouting angiogenesis • response to organic substance • positive regulation of positive chemotaxis • keratinocyte proliferation • адгезія клітин • Rho protein signal transduction • GO:0007067 мітоз • Rac protein signal transduction • localization within membrane • adherens junction organization • endothelial cell migration • negative regulation of cell population proliferation • lamellipodium assembly • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0000767 cell morphogenesis • cell-cell junction assembly • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1012	12554
Ensembl	ENSG00000140945	ENSMUSG00000031841
UniProt	P55290	Q9WTR5
RefSeq (мРНК)	NM_001220488 NM_001220489 NM_001220490 NM_001220491 NM_001220492 NM_001257	NM_019707
RefSeq (білок)	NP_001207417 NP_001207418 NP_001207419 NP_001207420 NP_001207421 NP_001248	NP_062681
Локус (UCSC)	Хр. 16: 82.63 – 83.8 Mb	Хр. 8: 119.01 – 120.05 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH13 (англ. Cadherin 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 713 амінокислот, а молекулярна маса — 78 287^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQPRTPLVLC		VLLSQVLLLT		SAEDLDCTPG		FQQKVFHINQ		PAEFIEDQSI
LNLTFSDCKG		NDKLRYEVSS		PYFKVNSDGG		LVALRNITAV		GKTLFVHART
PHAEDMAELV		IVGGKDIQGS		LQDIFKFART		SPVPRQKRSI		VVSPILIPEN
QRQPFPRDVG		KVVDSDRPER		SKFRLTGKGV		DQEPKGIFRI		NENTGSVSVT
RTLDREVIAV		YQLFVETTDV		NGKTLEGPVP		LEVIVIDQND		NRPIFREGPY
IGHVMEGSPT		GTTVMRMTAF		DADDPATDNA		LLRYNIRQQT		PDKPSPNMFY
IDPEKGDIVT		VVSPALLDRE		TLENPKYELI		IEAQDMAGLD		VGLTGTATAT
IMIDDKNDHS		PKFTKKEFQA		TVEEGAVGVI		VNLTVEDKDD		PTTGAWRAAY
TIINGNPGQS		FEIHTNPQTN		EGMLSVVKPL		DYEISAFHTL		LIKVENEDPL
VPDVSYGPSS		TATVHITVLD		VNEGPVFYPD		PMMVTRQEDL		SVGSVLLTVN
ATDPDSLQHQ		TIRYSVYKDP		AGWLNINPIN		GTVDTTAVLD		RESPFVDNSV
YTALFLAIDS		GNPPATGTGT		LLITLEDVND		NAPFIYPTVA		EVCDDAKNLS
VVILGASDKD		LHPNTDPFKF		EIHKQAVPDK		VWKISKINNT		HALVSLLQNL
NKANYNLPIM		VTDSGKPPMT		NITDLRVQVC		SCRNSKVDCN		AAGALRFSLP
SVLLLSLFSL		ACL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Lee S.W. (1996). H-cadherin, a novel cadherin with growth inhibitory functions and diminished expression in human breast cancer. Nat. Med. 2: 776—782. PMID 8673923 DOI:10.1038/nm0796-776
• Sato M., Mori Y., Sakurada A., Fujimura S., Horii A. (1998). The H-cadherin (CDH13) gene is inactivated in human lung cancer. Hum. Genet. 103: 96—101. PMID 9737784 DOI:10.1007/s004390050790
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Niermann T., Kern F., Erne P., Resink T. (2000). The glycosyl phosphatidylinositol anchor of human T-cadherin binds lipoproteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 276: 1240—1247. PMID 11027617 DOI:10.1006/bbrc.2000.3465
• Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з CDH13 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1753 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
5. UniProt, P55290 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 16

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»