CDH15

CDH15
Ідентифікатори
Символи	CDH15, CDH14, CDH3, CDHM, MCAD, MRD3, cadherin 15
Зовнішні ІД	OMIM: 114019 MGI: 106672 HomoloGene: 3622 GeneCards: CDH15
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 3[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • caveola • integral component of membrane • neuromuscular junction • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • комплекс Ґольджі • гіалоплазма • cell surface • catenin complex Біологічний процес • адгезія клітин • adherens junction organization • positive regulation of muscle cell differentiation • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • GO:0000767 cell morphogenesis • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1013	12555
Ensembl	ENSG00000129910	ENSMUSG00000031962
UniProt	P55291	P33146
RefSeq (мРНК)	NM_004933	NM_007662
RefSeq (білок)	NP_004924	NP_031688
Локус (UCSC)	Хр. 16: 89.17 – 89.2 Mb	Хр. 8: 123.57 – 123.59 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH15 (англ. Cadherin 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 814 амінокислот, а молекулярна маса — 88 916^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDAAFLLVLG		LLAQSLCLSL		GVPGWRRPTT		LYPWRRAPAL		SRVRRAWVIP
PISVSENHKR		LPYPLVQIKS		DKQQLGSVIY		SIQGPGVDEE		PRGVFSIDKF
TGKVFLNAML		DREKTDRFRL		RAFALDLGGS		TLEDPTDLEI		VVVDQNDNRP
AFLQEAFTGR		VLEGAVPGTY		VTRAEATDAD		DPETDNAALR		FSILQQGSPE
LFSIDELTGE		IRTVQVGLDR		EVVAVYNLTL		QVADMSGDGL		TATASAIITL
DDINDNAPEF		TRDEFFMEAI		EAVSGVDVGR		LEVEDRDLPG		SPNWVARFTI
LEGDPDGQFT		IRTDPKTNEG		VLSIVKALDY		ESCEHYELKV		SVQNEAPLQA
AALRAERGQA		KVRVHVQDTN		EPPVFQENPL		RTSLAEGAPP		GTLVATFSAR
DPDTEQLQRL		SYSKDYDPED		WLQVDAATGR		IQTQHVLSPA		SPFLKGGWYR
AIVLAQDDAS		QPRTATGTLS		IEILEVNDHA		PVLAPPPPGS		LCSEPHQGPG
LLLGATDEDL		PPHGAPFHFQ		LSPRLPELGR		NWSLSQVNVS		HARLRPRHQV
PEGLHRLSLL		LRDSGQPPQQ		REQPLNVTVC		RCGKDGVCLP		GAAALLAGGT
GLSLGALVIV		LASALLLLVL		VLLVALRARF		WKQSRGKGLL		HGPQDDLRDN
VLNYDEQGGG		EEDQDAYDIS		QLRHPTALSL		PLGPPPLRRD		APQGRLHPQP
PRVLPTSPLD		IADFINDGLE		AADSDPSVPP		YDTALIYDYE		GDGSVAGTLS
SILSSQGDED		QDYDYLRDWG		PRFARLADMY		GHPCGLEYGA		RWDHQAREGL
SPGALLPRHR		GRTA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Shibata T., Shimoyama Y., Gotoh M., Hirohashi S. (1997). Identification of human cadherin-14, a novel neurally specific type II cadherin, by protein interaction cloning. J. Biol. Chem. 272: 5236—5240. PMID 9030594 DOI:10.1074/jbc.272.8.5236
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з CDH15 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1754 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
5. UniProt, P55291 (англ.) . Архів оригіналу за 18 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 16

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»