CDH17

CDH17
Ідентифікатори
Символи	CDH17, CDH16, HPT-1, HPT1, cadherin 17
Зовнішні ІД	OMIM: 603017 MGI: 1095414 HomoloGene: 56859 GeneCards: CDH17
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • transporter activity • зв'язування з іоном металу • integrin binding • proton-dependent oligopeptide secondary active transmembrane transporter activity • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • cell surface • клітинна мембрана • basolateral plasma membrane • клітинне ядро • міжклітинні контакти • catenin complex Біологічний процес • spleen development • marginal zone B cell differentiation • integrin-mediated signaling pathway • positive regulation of integrin activation by cell surface receptor linked signal transduction • germinal center B cell differentiation • B cell differentiation • adherens junction organization • oligopeptide transport • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • oligopeptide transmembrane transport • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell junction assembly • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1015	12557
Ensembl	ENSG00000079112	ENSMUSG00000028217
UniProt	Q12864	Q9R100
RefSeq (мРНК)	NM_001144663 NM_004063	NM_019753
RefSeq (білок)	NP_001138135 NP_004054	NP_062727
Локус (UCSC)	Хр. 8: 94.13 – 94.22 Mb	Хр. 4: 11.76 – 11.82 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH17 (англ. Cadherin 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 832 амінокислот, а молекулярна маса — 92 219^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MILQAHLHSL		CLLMLYLATG		YGQEGKFSGP		LKPMTFSIYE		GQEPSQIIFQ
FKANPPAVTF		ELTGETDNIF		VIEREGLLYY		NRALDRETRS		THNLQVAALD
ANGIIVEGPV		PITIKVKDIN		DNRPTFLQSK		YEGSVRQNSR		PGKPFLYVNA
TDLDDPATPN		GQLYYQIVIQ		LPMINNVMYF		QINNKTGAIS		LTREGSQELN
PAKNPSYNLV		ISVKDMGGQS		ENSFSDTTSV		DIIVTENIWK		APKPVEMVEN
STDPHPIKIT		QVRWNDPGAQ		YSLVDKEKLP		RFPFSIDQEG		DIYVTQPLDR
EEKDAYVFYA		VAKDEYGKPL		SYPLEIHVKV		KDINDNPPTC		PSPVTVFEVQ
ENERLGNSIG		TLTAHDRDEE		NTANSFLNYR		IVEQTPKLPM		DGLFLIQTYA
GMLQLAKQSL		KKQDTPQYNL		TIEVSDKDFK		TLCFVQINVI		DINDQIPIFE
KSDYGNLTLA		EDTNIGSTIL		TIQATDADEP		FTGSSKILYH		IIKGDSEGRL
GVDTDPHTNT		GYVIIKKPLD		FETAAVSNIV		FKAENPEPLV		FGVKYNASSF
AKFTLIVTDV		NEAPQFSQHV		FQAKVSEDVA		IGTKVGNVTA		KDPEGLDISY
SLRGDTRGWL		KIDHVTGEIF		SVAPLDREAG		SPYRVQVVAT		EVGGSSLSSV
SEFHLILMDV		NDNPPRLAKD		YTGLFFCHPL		SAPGSLIFEA		TDDDQHLFRG
PHFTFSLGSG		SLQNDWEVSK		INGTHARLST		RHTEFEEREY		VVLIRINDGG
RPPLEGIVSL		PVTFCSCVEG		SCFRPAGHQT		GIPTVGMAVG		ILLTTLLVIG
IILAVVFIRI		KKDKGKDNVE		SAQASEVKPL		RS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1756 (англ.) . Архів оригіналу за 28 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-08-28 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q12864 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 8

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»