CDH9

CDH9
Ідентифікатори
Символи	CDH9, cadherin 9
Зовнішні ІД	OMIM: 609974 MGI: 107433 HomoloGene: 9450 GeneCards: CDH9
Пов'язані генетичні захворювання
ішемічна хвороба серця[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • молекулярна функція • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of postsynaptic membrane • integral component of presynaptic membrane • cell surface • catenin complex Біологічний процес • адгезія клітин • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell adhesion • synapse assembly • synaptic membrane adhesion • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1007	12565
Ensembl	ENSG00000113100	ENSMUSG00000025370
UniProt	Q9ULB4	P70407
RefSeq (мРНК)	NM_016279	NM_009869
RefSeq (білок)	NP_057363	NP_033999
Локус (UCSC)	Хр. 5: 26.88 – 27.12 Mb	Хр. 15: 16.73 – 16.86 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH9 (англ. Cadherin 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 789 амінокислот, а молекулярна маса — 88 689^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTYHYIPLF		IWTYMFHTVD		TILLQEKPNS		YLSSKKIAGL		TKDDGKMLRR
TKRGWMWNQF		FLLEEYTGTD		TQYVGKLHTD		QDKGDGNLKY		ILTGDGAGSL
FVIDENTGDI		HAAKKLDREE		KSLYILRAKA		IDRKTGRQVE		PESEFIIKIH
DINDNEPKFT		KDLYTASVPE		MSGVGTSVIQ		VTATDADDAN		YGNSAKVVYS
ILQGQPYFSV		DPESGIIKTA		LPDMSRENRE		QYQVVIQAKD		MGGQMGGLSG
TTTVNITLTD		VNNNPPRFPQ		STYQFNSPES		VPLGTHLGRI		KANDPDVGEN
AEMEYSIAEG		DGADMFDVIT		DKDTQEGIIT		VKQNLDFENQ		MLYTLRVDAS
NTHPDPRFLH		LGPFKDTAVV		KISVEDIDEP		PVFTKVSYLI		EVDEDVKEGS
IIGQVTAYDP		DARNNLIKYS		VDRHTDMDRI		FGIHSENGSI		FTLKALDRES
SPWHNITVTA		TEINNPKQSS		HIPVFIRILD		INDHAPEFAM		YYETFVCENA
KPGQLIQTVS		VMDKDDPPRG		HKFFFEPVPE		FTLNPNFTIV		DNKDNTAGIM
TRKDGYSRNK		MSTYLLPILI		FDNDYPIQSS		TGTLTIRVCA		CDNQGNMQSC
TAEALILSAG		LSTGALVAIL		LCVLILLILV		VLFAALKRQR		KKEPLIISKD
DVRDNIVTYN		DEGGGEEDTQ		AFDIGTLRNP		EAREDSKLRR		DVMPETIFQI
RRTVPLWENI		DVQDFIHRRL		KENDADPSAP		PYDSLATYAY		EGNDSIADSL
SSLESLTADC		NQDYDYLSDW		GPRFKKLADM		YGGDDSDRD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 DOI:10.1042/0264-6021:3490159
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з CDH9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1768 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
5. UniProt, Q9ULB4 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 5

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»