CHD5

CHD5
Ідентифікатори
Символи	CHD5, CHD-5, chromodomain helicase DNA binding protein 5, PMNDS
Зовнішні ІД	OMIM: 610771 MGI: 3036258 HomoloGene: 56712 GeneCards: CHD5
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • зв'язування з іоном металу • H3K27me3 modified histone binding • hydrolase activity • ATP binding Клітинна компонента • NuRD complex • мембрана • GO:0035328 Гетерохроматин • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck Біологічний процес • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K27 trimethylation • positive regulation of signal transduction by p53 class mediator • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • Сперматогенез • histone H4 acetylation • cerebral cortex neuron differentiation • negative regulation of cell population proliferation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26038	269610
Ensembl	ENSG00000116254	ENSMUSG00000005045
UniProt	Q8TDI0	A2A8L1
RefSeq (мРНК)	NM_015557	NM_001081376 NM_029216 NM_001369243
RefSeq (білок)	NP_056372	NP_001074845 NP_083492 NP_001356172
Локус (UCSC)	Хр. 1: 6.1 – 6.18 Mb	Хр. 4: 152.42 – 152.47 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHD5 (англ. Chromodomain helicase DNA binding protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 954 амінокислот, а молекулярна маса — 223 050^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRGPVGTEEE		LPRLFAEEME		NEDEMSEEED		GGLEAFDDFF		PVEPVSLPKK
KKPKKLKENK		CKGKRKKKEG		SNDELSENEE		DLEEKSESEG		SDYSPNKKKK
KKLKDKKEKK		AKRKKKDEDE		DDNDDGCLKE		PKSSGQLMAE		WGLDDVDYLF
SEEDYHTLTN		YKAFSQFLRP		LIAKKNPKIP		MSKMMTVLGA		KWREFSANNP
FKGSSAAAAA		AAVAAAVETV		TISPPLAVSP		PQVPQPVPIR		KAKTKEGKGP
GVRKKIKGSK		DGKKKGKGKK		TAGLKFRFGG		ISNKRKKGSS		SEEDEREESD
FDSASIHSAS		VRSECSAALG		KKSKRRRKKK		RIDDGDGYET		DHQDYCEVCQ
QGGEIILCDT		CPRAYHLVCL		DPELEKAPEG		KWSCPHCEKE		GIQWEPKDDD
DEEEEGGCEE		EEDDHMEFCR		VCKDGGELLC		CDACPSSYHL		HCLNPPLPEI
PNGEWLCPRC		TCPPLKGKVQ		RILHWRWTEP		PAPFMVGLPG		PDVEPSLPPP
KPLEGIPERE		FFVKWAGLSY		WHCSWVKELQ		LELYHTVMYR		NYQRKNDMDE
PPPFDYGSGD		EDGKSEKRKN		KDPLYAKMEE		RFYRYGIKPE		WMMIHRILNH
SFDKKGDVHY		LIKWKDLPYD		QCTWEIDDID		IPYYDNLKQA		YWGHRELMLG
EDTRLPKRLL		KKGKKLRDDK		QEKPPDTPIV		DPTVKFDKQP		WYIDSTGGTL
HPYQLEGLNW		LRFSWAQGTD		TILADEMGLG		KTVQTIVFLY		SLYKEGHSKG
PYLVSAPLST		IINWEREFEM		WAPDFYVVTY		TGDKESRSVI		RENEFSFEDN
AIRSGKKVFR		MKKEVQIKFH		VLLTSYELIT		IDQAILGSIE		WACLVVDEAH
RLKNNQSKFF		RVLNSYKIDY		KLLLTGTPLQ		NNLEELFHLL		NFLTPERFNN
LEGFLEEFAD		ISKEDQIKKL		HDLLGPHMLR		RLKADVFKNM		PAKTELIVRV
ELSQMQKKYY		KFILTRNFEA		LNSKGGGNQV		SLLNIMMDLK		KCCNHPYLFP
VAAVEAPVLP		NGSYDGSSLV		KSSGKLMLLQ		KMLKKLRDEG		HRVLIFSQMT
KMLDLLEDFL		EYEGYKYERI		DGGITGGLRQ		EAIDRFNAPG		AQQFCFLLST
RAGGLGINLA		TADTVIIYDS		DWNPHNDIQA		FSRAHRIGQN		KKVMIYRFVT
RASVEERITQ		VAKRKMMLTH		LVVRPGLGSK		SGSMTKQELD		DILKFGTEEL
FKDDVEGMMS		QGQRPVTPIP		DVQSSKGGNL		AASAKKKHGS		TPPGDNKDVE
DSSVIHYDDA		AISKLLDRNQ		DATDDTELQN		MNEYLSSFKV		AQYVVREEDG
VEEVEREIIK		QEENVDPDYW		EKLLRHHYEQ		QQEDLARNLG		KGKRIRKQVN
YNDASQEDQE		WQDELSDNQS		EYSIGSEDED		EDFEERPEGQ		SGRRQSRRQL
KSDRDKPLPP		LLARVGGNIE		VLGFNARQRK		AFLNAIMRWG		MPPQDAFNSH
WLVRDLRGKS		EKEFRAYVSL		FMRHLCEPGA		DGAETFADGV		PREGLSRQHV
LTRIGVMSLV		RKKVQEFEHV		NGKYSTPDLI		PEGPEGKKSG		EVISSDPNTP
VPASPAHLLP		APLGLPDKME		AQLGYMDEKD		PGAQKPRQPL		EVQALPAALD
RVESEDKHES		PASKERAREE		RPEETEKAPP		SPEQLPREEV		LPEKEKILDK
LELSLIHSRG		DSSELRPDDT		KAEEKEPIET		QQNGDKEEDD		EGKKEDKKGK
FKFMFNIADG		GFTELHTLWQ		NEERAAVSSG		KIYDIWHRRH		DYWLLAGIVT
HGYARWQDIQ		NDPRYMILNE		PFKSEVHKGN		YLEMKNKFLA		RRFKLLEQAL
VIEEQLRRAA		YLNMTQDPNH		PAMALNARLA		EVECLAESHQ		HLSKESLAGN
KPANAVLHKV		LNQLEELLSD		MKADVTRLPS		MLSRIPPVAA		RLQMSERSIL
SRLTNRAGDP		TIQQGAFGSS		QMYSNNFGPN		FRGPGPGGIV		NYNQMPLGPY
VTDI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, нейрогенез, сперматогенез, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Thompson P.M., Gotoh T., Kok M., White P.S., Brodeur G.M. (2003). CHD5, a new member of the chromodomain gene family, is preferentially expressed in the nervous system. Oncogene. 22: 1002—1011. PMID 12592387 doi:10.1038/sj.onc.1206211

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16816 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2015. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2015-12-22 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q8TDI0 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»