CITED2

CITED2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1P4Q, 1R8U
Ідентифікатори
Символи	CITED2, ASD8, MRG-1, MRG1, P35SRJ, VSD2, Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602937 MGI: 1306784 HomoloGene: 4433 GeneCards: CITED2
Пов'язані генетичні захворювання
atrial heart septal defect 8[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • LBD domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • protein domain specific binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • nodal signaling pathway involved in determination of lateral mesoderm left/right asymmetry • adrenal cortex formation • positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • диференціація клітин • response to hypoxia • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of cell-cell adhesion • embryonic heart tube left/right pattern formation • ventricular septum morphogenesis • outflow tract morphogenesis • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • spleen development • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • response to fluid shear stress • response to estrogen • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • heart development • determination of left/right symmetry • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of cell migration • positive regulation of cell cycle • regulation of animal organ formation • Детермінація статі • positive regulation of peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway • liver development • left/right pattern formation • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • проліферація • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • left/right axis specification • positive regulation of male gonad development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10370	17684
Ensembl	ENSG00000164442	ENSMUSG00000039910
UniProt	Q99967	O35740
RefSeq (мРНК)	NM_006079 NM_001168388 NM_001168389	NM_010828
RefSeq (білок)	NP_001161860 NP_001161861 NP_006070	NP_034958
Локус (UCSC)	Хр. 6: 139.37 – 139.37 Mb	Хр. 10: 17.6 – 17.6 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CITED2 (англ. Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 28 497^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADHMMAMNH		GRFPDGTNGL		HHHPAHRMGM		GQFPSPHHHQ		QQQPQHAFNA
LMGEHIHYGA		GNMNATSGIR		HAMGPGTVNG		GHPPSALAPA		ARFNNSQFMG
PPVASQGGSL		PASMQLQKLN		NQYFNHHPYP		HNHYMPDLHP		AAGHQMNGTN
QHFRDCNPKH		SGGSSTPGGS		GGSSTPGGSG		SSSGGGAGSS		NSGGGSGSGN
MPASVAHVPA		AMLPPNVIDT		DFIDEEVLMS		LVIEMGLDRI		KELPELWLGQ
NEFDFMTDFV		CKQQPSRVSC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на стрес, транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Shioda T., Fenner M.H., Isselbacher K.J. (1996). msg1, a novel melanocyte-specific gene, encodes a nuclear protein and is associated with pigmentation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 12298—12303. PMID 8901575 DOI:10.1073/pnas.93.22.12298
• Leung M.K., Jones T., Michels C.L., Livingston D.M., Bhattacharya S. (1999). Molecular cloning and chromosomal localization of the human CITED2 gene encoding p35srj/Mrg1. Genomics. 61: 307—313. PMID 10552932 DOI:10.1006/geno.1999.5970
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tien E.S., Davis J.W., Vanden Heuvel J.P. (2004). Identification of the CREB-binding protein/p300-interacting protein CITED2 as a peroxisome proliferator-activated receptor alpha coregulator. J. Biol. Chem. 279: 24053—24063. PMID 15051727 DOI:10.1074/jbc.M401489200
• De Guzman R.N., Martinez-Yamout M.A., Dyson H.J., Wright P.E. (2004). Interaction of the TAZ1 domain of the CREB-binding protein with the activation domain of CITED2: regulation by competition between intrinsically unstructured ligands for non-identical binding sites. J. Biol. Chem. 279: 3042—3049. PMID 14594809 DOI:10.1074/jbc.M310348200

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з CITED2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1987 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
5. UniProt, Q99967 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 6

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»