CLCN3

CLCN3
Ідентифікатори
Символи	CLCN3, CLC3, ClC-3, chloride voltage-gated channel 3, NEDSBA, NEDHYBA
Зовнішні ІД	OMIM: 600580 MGI: 103555 HomoloGene: 20435 GeneCards: CLCN3
Реагує на сполуку
phloretin[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • volume-sensitive chloride channel activity • PDZ domain binding • protein homodimerization activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • antiporter activity • ATP binding • chloride channel activity • voltage-gated chloride channel activity • solute:proton antiporter activity • chloride ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • ендосома • late endosome • комплекс Ґольджі • early endosome membrane • мембрана • late endosome membrane • Синаптичні бульбашки • vesicle membrane • Golgi membrane • клітинна мембрана • transport vesicle membrane • secretory granule • cell surface • early endosome • specific granule • phagocytic vesicle • external side of plasma membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • integral component of plasma membrane Біологічний процес • negative regulation of cell volume • endosomal lumen acidification • ion transport • regulation of anion transmembrane transport • chloride transport • regulation of pH • chloride transmembrane transport • regulation of anion transport • трансмембранний транспорт • GO:0015915 транспорт • synaptic vesicle lumen acidification Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1182	12725
Ensembl	ENSG00000109572	ENSMUSG00000004319
UniProt	P51790	P51791
RefSeq (мРНК)	NM_001243372 NM_001243374 NM_001829 NM_173872	NM_007711 NM_173873 NM_173874 NM_173876
RefSeq (білок)	NP_001230301 NP_001230303 NP_001820 NP_776297	NP_031737 NP_776298 NP_776299 NP_776301
Локус (UCSC)	Хр. 4: 169.61 – 169.72 Mb	Хр. 8: 61.36 – 61.44 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLCN3 (англ. Chloride voltage-gated channel 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 818 амінокислот, а молекулярна маса — 90 966^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESEQLFHRG		YYRNSYNSIT		SASSDEELLD		GAGVIMDFQT		SEDDNLLDGD
TAVGTHYTMT		NGGSINSSTH		LLDLLDEPIP		GVGTYDDFHT		IDWVREKCKD
RERHRRINSK		KKESAWEMTK		SLYDAWSGWL		VVTLTGLASG		ALAGLIDIAA
DWMTDLKEGI		CLSALWYNHE		QCCWGSNETT		FEERDKCPQW		KTWAELIIGQ
AEGPGSYIMN		YIMYIFWALS		FAFLAVSLVK		VFAPYACGSG		IPEIKTILSG
FIIRGYLGKW		TLMIKTITLV		LAVASGLSLG		KEGPLVHVAC		CCGNIFSYLF
PKYSTNEAKK		REVLSAASAA		GVSVAFGAPI		GGVLFSLEEV		SYYFPLKTLW
RSFFAALVAA		FVLRSINPFG		NSRLVLFYVE		YHTPWYLFEL		FPFILLGVFG
GLWGAFFIRA		NIAWCRRRKS		TKFGKYPVLE		VIIVAAITAV		IAFPNPYTRL
NTSELIKELF		TDCGPLESSS		LCDYRNDMNA		SKIVDDIPDR		PAGIGVYSAI
WQLCLALIFK		IIMTVFTFGI		KVPSGLFIPS		MAIGAIAGRI		VGIAVEQLAY
YHHDWFIFKE		WCEVGADCIT		PGLYAMVGAA		ACLGGVTRMT		VSLVVIVFEL
TGGLEYIVPL		MAAVMTSKWV		GDAFGREGIY		EAHIRLNGYP		FLDAKEEFTH
TTLAADVMRP		RRNDPPLAVL		TQDNMTVDDI		ENMINETSYN		GFPVIMSKES
QRLVGFALRR		DLTIAIESAR		KKQEGIVGSS		RVCFAQHTPS		LPAESPRPLK
LRSILDMSPF		TVTDHTPMEI		VVDIFRKLGL		RQCLVTHNGR		LLGIITKKDI
LRHMAQTANQ		DPASIMFN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, хлоридом. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• Borsani G., Rugarli E.I., Taglialatela M., Wong C., Ballabio A. (1995). Characterization of a human and murine gene (CLCN3) sharing similarities to voltage-gated chloride channels and to a yeast integral membrane protein. Genomics. 27: 131—141. PMID 7665160 DOI:10.1006/geno.1995.1015
• Shepard A.R., Rae J.L. (1998). Ion transporters and receptors in cDNA libraries from lens and cornea epithelia. Curr. Eye Res. 17: 708—719. PMID 9678416 DOI:10.1080/02713689808951247
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Chloride voltage-gated channel 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2021 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
5. UniProt, P51790 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 4

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»