CLIP1

CLIP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CP5, 2CP6, 2E3H, 2E3I, 2E4H, 2HQH, 2QK0, 3E2U, 3RDV
Ідентифікатори
Символи	CLIP1, CLIP, CLIP-170, CLIP170, CYLN1, RSN, CAP-Gly domain containing linker protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 179838 MGI: 1928401 HomoloGene: 74455 GeneCards: CLIP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • microtubule binding; • microtubule plus-end binding; • зв'язування з іоном металу; • tubulin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • zinc ion binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • ендосома; • центросома; • cell projection; • мембрана; • microtubule cytoskeleton; • ruffle; • microtubule plus-end; • macropinosome; • cytoplasmic microtubule; • мікротрубочка; • цитоскелет; • Проміжні філаменти; • cytoplasmic vesicle membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • кінетохор; • nuclear envelope; • цитоплазма;
Біологічний процес	• microtubule bundle formation; • positive regulation of microtubule polymerization; • protein transport into plasma membrane raft; • GO:0007067 мітоз;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6249
	56430
	ENSG00000130779
	ENSMUSG00000049550
	P30622
	Q922J3
	NM_001247997; NM_002956; NM_198240; NM_001389291
NM_001291229; NM_019765; NM_001347468; NM_001359220; NM_001359221;
	NM_001359222; NM_001359223; NM_001359224
	NP_001234926; NP_002947; NP_937883
NP_001278158; NP_001334397; NP_062739; NP_001346149; NP_001346150;
	NP_001346151; NP_001346152; NP_001346153
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CLIP1 (англ. CAP-Gly domain containing linker protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 438 амінокислот, а молекулярна маса — 162 246^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSMLKPSGLK	APTKILKPGS	TALKTPTAVV	APVEKTISSE	KASSTPSSET
QEEFVDDFRV	GERVWVNGNK	PGFIQFLGET	QFAPGQWAGI	VLDEPIGKND
GSVAGVRYFQ	CEPLKGIFTR	PSKLTRKVQA	EDEANGLQTT	PASRATSPLC
TSTASMVSSS	PSTPSNIPQK	PSQPAAKEPS	ATPPISNLTK	TASESISNLS
EAGSIKKGER	ELKIGDRVLV	GGTKAGVVRF	LGETDFAKGE	WCGVELDEPL
GKNDGAVAGT	RYFQCQPKYG	LFAPVHKVTK	IGFPSTTPAK	AKANAVRRVM
ATTSASLKRS	PSASSLSSMS	SVASSVSSRP	SRTGLLTETS	SRYARKISGT
TALQEALKEK	QQHIEQLLAE	RDLERAEVAK	ATSHVGEIEQ	ELALARDGHD
QHVLELEAKM	DQLRTMVEAA	DREKVELLNQ	LEEEKRKVED	LQFRVEEESI
TKGDLEQKSQ	ISEDPENTQT	KLEHARIKEL	EQSLLFEKTK	ADKLQRELED
TRVATVSEKS	RIMELEKDLA	LRVQEVAELR	RRLESNKPAG	DVDMSLSLLQ
EISSLQEKLE	VTRTDHQREI	TSLKEHFGAR	EETHQKEIKA	LYTATEKLSK
ENESLKSKLE	HANKENSDVI	ALWKSKLETA	IASHQQAMEE	LKVSFSKGLG
TETAEFAELK	TQIEKMRLDY	QHEIENLQNQ	QDSERAAHAK	EMEALRAKLM
KVIKEKENSL	EAIRSKLDKA	EDQHLVEMED	TLNKLQEAEI	KVKELEVLQA
KCNEQTKVID	NFTSQLKATE	EKLLDLDALR	KASSEGKSEM	KKLRQQLEAA
EKQIKHLEIE	KNAESSKASS	ITRELQGREL	KLTNLQENLS	EVSQVKETLE
KELQILKEKF	AEASEEAVSV	QRSMQETVNK	LHQKEEQFNM	LSSDLEKLRE
NLADMEAKFR	EKDEREEQLI	KAKEKLENDI	AEIMKMSGDN	SSQLTKMNDE
LRLKERDVEE	LQLKLTKANE	NASFLQKSIE	DMTVKAEQSQ	QEAAKKHEEE
KKELERKLSD	LEKKMETSHN	QCQELKARYE	RATSETKTKH	EEILQNLQKT
LLDTEDKLKG	AREENSGLLQ	ELEELRKQAD	KAKAAQTAED	AMQIMEQMTK
EKTETLASLE	DTKQTNAKLQ	NELDTLKENN	LKNVEELNKS	KELLTVENQK
MEEFRKEIET	LKQAAAQKSQ	QLSALQEENV	KLAEELGRSR	DEVTSHQKLE
EERSVLNNQL	LEMKKRESKF	IKDADEEKAS	LQKSISITSA	LLTEKDAELE
KLRNEVTVLR	GENASAKSLH	SVVQTLESDK	VKLELKVKNL	ELQLKENKRQ
LSSSSGNTDT	QADEDERAQE	SQIDFLNSVI	VDLQRKNQDL	KMKVEMMSEA
ALNGNGDDLN	NYDSDDQEKQ	SKKKPRLFCD	ICDCFDLHDT	EDCPTQAQMS
EDPPHSTHHG	SRGEERPYCE	ICEMFGHWAT	NCNDDETF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах.

Література

Pierre P., Scheel J., Rickard J.E., Kreis T.E. (1992). CLIP-170 links endocytic vesicles to microtubules. Cell. 70: 887—900. PMID 1356075 doi:10.1016/0092-8674(92)90240-D
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
Slep K.C., Vale R.D. (2007). Structural basis of microtubule plus end tracking by XMAP215, CLIP-170, and EB1. Mol. Cell. 27: 976—991. PMID 17889670 doi:10.1016/j.molcel.2007.07.023
Hayashi I., Plevin M.J., Ikura M. (2007). CLIP170 autoinhibition mimics intermolecular interactions with p150Glued or EB1. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 980—981. PMID 17828275 doi:10.1038/nsmb1299

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10461 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P30622 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10461 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P30622 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]