CLSTN1

CLSTN1
Ідентифікатори
Символи	CLSTN1, ALC-ALPHA, CDHR12, CSTN1, PIK3CD, XB31alpha, alcalpha1, alcalpha2, CST-1, calsyntenin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611321 MGI: 1929895 HomoloGene: 8814 GeneCards: CLSTN1
Онтологія гена Молекулярна функція • X11-like protein binding • calcium ion binding • amyloid-beta binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinesin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • postsynaptic membrane • комплекс Ґольджі • cell projection • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • синапс • extracellular region • cell surface • міжклітинні контакти • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • postsynaptic endosome • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic density membrane • integral component of spine apparatus membrane Біологічний процес • адгезія клітин • positive regulation of synaptic transmission • regulation of cell growth • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • positive regulation of synapse assembly • regulation of synapse maturation • neurotransmitter receptor transport to postsynaptic membrane • vesicle-mediated transport in synapse Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22883	65945
Ensembl	ENSG00000171603	ENSMUSG00000039953
UniProt	O94985	Q9EPL2
RefSeq (мРНК)	NM_014944 NM_001009566 NM_001302883	NM_001290989 NM_023051
RefSeq (білок)	NP_001009566 NP_001289812 NP_055759	NP_001277918 NP_075538
Локус (UCSC)	Хр. 1: 9.73 – 9.82 Mb	Хр. 4: 149.67 – 149.73 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLSTN1 (англ. Calsyntenin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 981 амінокислот, а молекулярна маса — 109 793^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLRRPAPALA		PAARLLLAGL		LCGGGVWAAR		VNKHKPWLEP		TYHGIVTEND
NTVLLDPPLI		ALDKDAPLRF		AESFEVTVTK		EGEICGFKIH		GQNVPFDAVV
VDKSTGEGVI		RSKEKLDCEL		QKDYSFTIQA		YDCGKGPDGT		NVKKSHKATV
HIQVNDVNEY		APVFKEKSYK		ATVIEGKQYD		SILRVEAVDA		DCSPQFSQIC
SYEIITPDVP		FTVDKDGYIK		NTEKLNYGKE		HQYKLTVTAY		DCGKKRATED
VLVKISIKPT		CTPGWQGWNN		RIEYEPGTGA		LAVFPNIHLE		TCDEPVASVQ
ATVELETSHI		GKGCDRDTYS		EKSLHRLCGA		AAGTAELLPS		PSGSLNWTMG
LPTDNGHDSD		QVFEFNGTQA		VRIPDGVVSV		SPKEPFTISV		WMRHGPFGRK
KETILCSSDK		TDMNRHHYSL		YVHGCRLIFL		FRQDPSEEKK		YRPAEFHWKL
NQVCDEEWHH		YVLNVEFPSV		TLYVDGTSHE		PFSVTEDYPL		HPSKIETQLV
VGACWQEFSG		VENDNETEPV		TVASAGGDLH		MTQFFRGNLA		GLTLRSGKLA
DKKVIDCLYT		CKEGLDLQVL		EDSGRGVQIQ		AHPSQLVLTL		EGEDLGELDK
AMQHISYLNS		RQFPTPGIRR		LKITSTIKCF		NEATCISVPP		VDGYVMVLQP
EEPKISLSGV		HHFARAASEF		ESSEGVFLFP		ELRIISTITR		EVEPEGDGAE
DPTVQESLVS		EEIVHDLDTC		EVTVEGEELN		HEQESLEVDM		ARLQQKGIEV
SSSELGMTFT		GVDTMASYEE		VLHLLRYRNW		HARSLLDRKF		KLICSELNGR
YISNEFKVEV		NVIHTANPME		HANHMAAQPQ		FVHPEHRSFV		DLSGHNLANP
HPFAVVPSTA		TVVIVVCVSF		LVFMIILGVF		RIRAAHRRTM		RDQDTGKENE
MDWDDSALTI		TVNPMETYED		QHSSEEEEEE		EEEEESEDGE		EEDDITSAES
ESSEEEEGEQ		GDPQNATRQQ		QLEWDDSTLS		Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, апараті гольджі, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17447 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
4. UniProt, O94985 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»