CNOT2

CNOT2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4C0D, 4C0F, 5FU6, 5FU7
Ідентифікатори
Символи	CNOT2, CDC36, NOT2, NOT2H, HSPC131, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, IDNADFS
Зовнішні ІД	OMIM: 604909 MGI: 1919318 HomoloGene: 40953 GeneCards: CNOT2
Пов'язані генетичні захворювання
	бічний аміотрофічний склероз
Онтологія гена
Молекулярна функція	• poly(A)-specific ribonuclease activity; • GO:0001104 transcription coregulator activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • CCR4-NOT complex; • P-body; • CCR4-NOT core complex; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening; • negative regulation of translation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of stem cell population maintenance; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • multicellular organism development; • positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly; • trophectodermal cell differentiation; • Сайленсинг генів; • negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway; • regulation of translation; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay; • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4848
	72068
	ENSG00000111596
	ENSMUSG00000020166
	Q9NZN8
	Q8C5L3
	NM_001199302; NM_001199303; NM_014515
NM_001037846; NM_001037847; NM_001037848; NM_028082; NM_001359247;
	NM_001359248; NM_001359249; NM_001359250; NM_001359251; NM_001359252; NM_001359253; NM_001359563
	NP_001186231; NP_001186232; NP_055330
NP_001032935; NP_001032936; NP_001032937; NP_082358; NP_001346176;
	NP_001346177; NP_001346178; NP_001346179; NP_001346180; NP_001346181; NP_001346182; NP_001346492
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CNOT2 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 59 738^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVRTDGHTLS	EKRNYQVTNS	MFGASRKKFV	EGVDSDYHDE	NMYYSQSSMF
PHRSEKDMLA	SPSTSGQLSQ	FGASLYGQQS	ALGLPMRGMS	NNTPQLNRSL
SQGTQLPSHV	TPTTGVPTMS	LHTPPSPSRG	ILPMNPRNMM	NHSQVGQGIG
IPSRTNSMSS	SGLGSPNRSS	PSIICMPKQQ	PSRQPFTVNS	MSGFGMNRNQ
AFGMNNSLSS	NIFNGTDGSE	NVTGLDLSDF	PALADRNRRE	GSGNPTPLIN
PLAGRAPYVG	MVTKPANEQS	QDFSIHNEDF	PALPGSSYKD	PTSSNDDSKS
NLNTSGKTTS	STDGPKFPGD	KSSTTQNNNQ	QKKGIQVLPD	GRVTNIPQGM
VTDQFGMIGL	LTFIRAAETD	PGMVHLALGS	DLTTLGLNLN	SPENLYPKFA
SPWASSPCRP	QDIDFHVPSE	YLTNIHIRDK	LAAIKLGRYG	EDLLFYLYYM
NGGDVLQLLA	AVELFNRDWR	YHKEERVWIT	RAPGMEPTMK	TNTYERGTYY
FFDCLNWRKV	AKEFHLEYDK	LEERPHLPST	FNYNPAQQAF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zwartjes C.G., Jayne S., van den Berg D.L., Timmers H.T. (2004). Repression of promoter activity by CNOT2, a subunit of the transcription regulatory Ccr4-not complex. J. Biol. Chem. 279: 10848—10854. PMID 14707134 DOI:10.1074/jbc.M311747200
Jayne S., Zwartjes C.G., van Schaik F.M., Timmers H.T. (2006). Involvement of the SMRT/NCoR-HDAC3 complex in transcriptional repression by the CNOT2 subunit of the human Ccr4-Not complex. Biochem. J. 398: 461—467. PMID 16712523 DOI:10.1042/BJ20060406

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CNOT2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7878 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NZN8 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CNOT2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7878 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9NZN8 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]