CNTNAP4

CNTNAP4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4NXQ
Ідентифікатори
Символи	CNTNAP4, CASPR4, contactin associated protein like 4, contactin associated protein family member 4
Зовнішні ІД	OMIM: 610518 MGI: 2183572 HomoloGene: 24912 GeneCards: CNTNAP4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • міжклітинні контакти; • клітинна мембрана; • дендрит (нейробіологія); • синапс; • presynaptic membrane; • мембрана; • GABA-ergic synapse; • integral component of presynaptic membrane;
Біологічний процес	• regulation of synaptic transmission, dopaminergic; • regulation of grooming behavior; • адгезія клітин; • regulation of synaptic transmission, GABAergic; • GO:1904739 regulation of synapse organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	85445
	170571
	ENSG00000152910
	ENSMUSG00000031772
	Q9C0A0
	Q99P47
NM_033401; NM_138994; NM_001322178; NM_001322179; NM_001322180;
	NM_001322181; NM_001322187; NM_001322188; NM_001322189; NM_001322190; NM_001322191
	NM_130457
NP_001309107; NP_001309108; NP_001309109; NP_001309110; NP_001309116;
	NP_001309117; NP_001309118; NP_001309119; NP_001309120; NP_207837; NP_620481
	NP_569724
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CNTNAP4 (англ. Contactin associated protein like 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 308 амінокислот, а молекулярна маса — 145 274^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSVTGAVLK	TLLLLSTQNW	NRVEAGNSYD	CDDPLVSALP	QASFSSSSEL
SSSHGPGFAR	LNRRDGAGGW	SPLVSNKYQW	LQIDLGERME	VTAVATQGGY
GSSNWVTSYL	LMFSDSGWNW	KQYRQEDSIW	GFSGNANADS	VVYYRLQPSI
KARFLRFIPL	EWNPKGRIGM	RIEVFGCAYR	SEVVDLDGKS	SLLYRFDQKS
LSPIKDIISL	KFKTMQSDGI	LLHREGPNGD	HITLQLRRAR	LFLLINSGEA
KLPSTSTLVN	LTLGSLLDDQ	HWHSVLIQRL	GKQVNFTVDE	HRHHFHARGE
FNLMNLDYEI	SFGGIPAPGK	SVSFPHRNFH	GCLENLYYNG	VDIIDLAKQQ
KPQIIAMGNV	SFSCSQPQSM	PVTFLSSRSY	LALPDFSGEE	EVSATFQFRT
WNKAGLLLFS	ELQLISGGIL	LFLSDGKLKS	NLYQPGKLPS	DITAGVELND
GQWHSVSLSA	KKNHLSVAVD	GQMASAAPLL	GPEQIYSGGT	YYFGGCPDKS
FGSKCKSPLG	GFQGCMRLIS	ISGKVVDLIS	VQQGSLGNFS	DLQIDSCGIS
DRCLPNYCEH	GGECSQSWST	FHCNCTNTGY	RGATCHNSIY	EQSCEAYKHR
GNTSGFYYID	SDGSGPLEPF	LLYCNMTETA	WTIIQHNGSD	LTRVRNTNPE
NPYAGFFEYV	ASMEQLQATI	NRAEHCEQEF	TYYCKKSRLV	NKQDGTPLSW
WVGRTNETQT	YWGGSSPDLQ	KCTCGLEGNC	IDSQYYCNCD	ADRNEWTNDT
GLLAYKEHLP	VTKIVITDTG	RLHSEAAYKL	GPLLCQGDRS	FWNSASFDTE
ASYLHFPTFH	GELSADVSFF	FKTTASSGVF	LENLGIADFI	RIELRSPTVV
TFSFDVGNGP	FEISVQSPTH	FNDNQWHHVR	VERNMKEASL	QVDQLTPKTQ
PAPADGHVLL	QLNSQLFVGG	TATRQRGFLG	CIRSLQLNGM	TLDLEERAQV
TPEVQPGCRG	HCSSYGKLCR	NGGKCRERPI	GFFCDCTFSA	YTGPFCSNEI
SAYFGSGSSV	IYNFQENYLL	SKNSSSHAAS	FHGDMKLSRE	MIKFSFRTTR
TPSLLLFVSS	FYKEYLSVII	AKNGSLQIRY	KLNKYQEPDV	VNFDFKNMAD
GQLHHIMINR	EEGVVFIEID	DNRRRQVHLS	SGTEFSAVKS	LVLGRILEHS
DVDQDTALAG	AQGFTGCLSA	VQLSHVAPLK	AALHPSHPDP	VTVTGHVTES
SCMAQPGTDA	TSRERTHSFA	DHSGTIDDRE	PLANAIKSDS	AVIGGLIAVV
IFILLCITAI	AVRIYQQKRL	YKRSEAKRSE	NVDSAEAVLK	SELNIQNAVN
ENQKEYFF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Liu X., Shepherd T.R., Murray A.M., Xu Z., Fuentes E.J. (2013). The structure of the Tiam1 PDZ domain/ phospho-syndecan1 complex reveals a ligand conformation that modulates protein dynamics. Structure. 21: 342—354. PMID 23395182 doi:10.1016/j.str.2013.01.004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18747 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9C0A0 (англ.) . Архів оригіналу за 30 березня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18747 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9C0A0 (англ.) . Архів оригіналу за 30 березня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]