COPE

COPE
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5A1V, 5A1Y
Ідентифікатори
Символи	COPE, epsilon-COP, coatomer protein complex subunit epsilon, COPI coat complex subunit epsilon
Зовнішні ІД	OMIM: 606942 MGI: 1891702 HomoloGene: 5254 GeneCards: COPE
Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural molecule activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • комплекс Ґольджі; • мембрана; • Golgi membrane; • COPI-coated vesicle membrane; • transport vesicle; • нуклеоплазма; • COPI vesicle coat; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • endoplasmic reticulum membrane;
Біологічний процес	• retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; • protein transport; • intra-Golgi vesicle-mediated transport; • vesicle-mediated transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	11316
	59042
	ENSG00000105669
	ENSMUSG00000055681
	O14579
	O89079
	NM_007263; NM_199442; NM_199444; NM_001330469; NM_025088
	NM_021538
	NP_001317398; NP_009194; NP_955474; NP_955476
	NP_067513
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COPE (англ. Coatomer protein complex subunit epsilon) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 308 амінокислот, а молекулярна маса — 34 482^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPPAPGPAS	GGSGEVDELF	DVKNAFYIGS	YQQCINEAQR	VKLSSPERDV
ERDVFLYRAY	LAQRKFGVVL	DEIKPSSAPE	LQAVRMFADY	LAHESRRDSI
VAELDREMSR	SVDVTNTTFL	LMAASIYLHD	QNPDAALRAL	HQGDSLECTA
MTVQILLKLD	RLDLARKELK	RMQDLDEDAT	LTQLATAWVS	LATGGEKLQD
AYYIFQEMAD	KCSPTLLLLN	GQAACHMAQG	RWEAAEGLLQ	EALDKDSGYP
ETLVNLIVLS	QHLGKPPEVT	NRYLSQLKDA	HRSHPFIKEY	QAKENDFDRL
VLQYAPSA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Ґольджі, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті Ґольджі.

Література

Shima D.T., Scales S.J., Kreis T.E., Pepperkok R. (1999). Segregation of COPI-rich and anterograde-cargo-rich domains in endoplasmic-reticulum-to-Golgi transport complexes. Curr. Biol. 9: 821—824. PMID 10469566 doi:10.1016/S0960-9822(99)80365-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2234 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O14579 (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2234 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O14579 (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]