CSTF2

CSTF2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1P1T, 2J8P
Ідентифікатори
Символи	CSTF2, CstF-64, cleavage stimulation factor subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 300907 MGI: 1343054 HomoloGene: 80171 GeneCards: CSTF2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • mRNA binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex; • cleavage body; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • ядерні тільця;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA processing; • mRNA 3'-end processing; • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation; • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation; • mRNA polyadenylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1478
	108062
	ENSG00000101811
	ENSMUSG00000031256
	P33240
	Q8BIQ5
	NM_001306206; NM_001306209; NM_001325
	NM_001290398; NM_001290399; NM_133196; NM_001359053; NM_001359054
	NP_001293135; NP_001293138; NP_001316; NP_001293135.1
	NP_001277327; NP_001277328; NP_573459; NP_001345982; NP_001345983
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CSTF2 (англ. Cleavage stimulation factor subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 577 амінокислот, а молекулярна маса — 60 959^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGLTVRDPA	VDRSLRSVFV	GNIPYEATEE	QLKDIFSEVG	PVVSFRLVYD
RETGKPKGYG	FCEYQDQETA	LSAMRNLNGR	EFSGRALRVD	NAASEKNKEE
LKSLGTGAPV	IESPYGETIS	PEDAPESISK	AVASLPPEQM	FELMKQMKLC
VQNSPQEARN	MLLQNPQLAY	ALLQAQVVMR	IVDPEIALKI	LHRQTNIPTL
IAGNPQPVHG	AGPGSGSNVS	MNQQNPQAPQ	AQSLGGMHVN	GAPPLMQASM
QGGVPAPGQM	PAAVTGPGPG	SLAPGGGMQA	QVGMPGSGPV	SMERGQVPMQ
DPRAAMQRGS	LPANVPTPRG	LLGDAPNDPR	GGTLLSVTGE	VEPRGYLGPP
HQGPPMHHVP	GHESRGPPPH	ELRGGPLPEP	RPLMAEPRGP	MLDQRGPPLD
GRGGRDPRGI	DARGMEARAM	EARGLDARGL	EARAMEARAM	EARAMEARAM
EARAMEVRGM	EARGMDTRGP	VPGPRGPIPS	GMQGPSPINM	GAVVPQGSRQ
VPVMQGTGMQ	GASIQGGSQP	GGFSPGQNQV	TPQDHEKAAL	IMQVLQLTAD
QIAMLPPEQR	QSILILKEQI	QKSTGAP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Takagaki Y., Macdonald C.C., Shenk T., Manley J.L. (1992). The human 64-kDa polyadenylylation factor contains a ribonucleoprotein-type RNA binding domain and unusual auxiliary motifs. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1403—1407. PMID 1741396 doi:10.1073/pnas.89.4.1403
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Takagaki Y., Manley J.L. (1997). RNA recognition by the human polyadenylation factor CstF. Mol. Cell. Biol. 17: 3907—3914. PMID 9199325 doi:10.1128/MCB.17.7.3907
Takagaki Y., Manley J.L. (2000). Complex protein interactions within the human polyadenylation machinery identify a novel component. Mol. Cell. Biol. 20: 1515—1525. PMID 10669729 doi:10.1128/MCB.20.5.1515-1525.2000
Calvo O., Manley J.L. (2001). Evolutionarily conserved interaction between CstF-64 and PC4 links transcription, polyadenylation, and termination. Mol. Cell. 7: 1013—1023. PMID 11389848 doi:10.1016/S1097-2765(01)00236-2
Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 doi:10.1038/sj.emboj.7600070

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2484 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P33240 (англ.) . Архів оригіналу за 3 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома X

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2484 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P33240 (англ.) . Архів оригіналу за 3 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]