CTCFL

CTCFL
Ідентифікатори
Символи	CTCFL, BORIS, CT27, CTCF-T, HMGB1L1, dJ579F20.2, CCCTC-binding factor like
Зовнішні ІД	OMIM: 607022 MGI: 3652571 HomoloGene: 46476 GeneCards: CTCFL
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0031493 histone binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • зв'язування з іоном металу; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • цитоплазма;
Біологічний процес	• regulation of gene expression by genetic imprinting; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of histone H3-K4 methylation; • DNA methylation involved in gamete generation; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • клітинний цикл; • histone methylation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	140690
	664799
	н/д
	ENSMUSG00000070495
	Q8NI51
	A2APF3
NM_001269040; NM_001269041; NM_001269042; NM_001269043; NM_001269044;
	NM_001269045; NM_001269046; NM_001269047; NM_001269048; NM_001269049; NM_001269050; NM_001269051; NM_001269052; NM_001269054; NM_001269055; NM_080618; NM_001386993; NM_001386994; NM_001386995; NM_001386996; NM_001386997
	NM_001081387; NM_001355185
NP_001255969; NP_001255970; NP_001255971; NP_001255972; NP_001255973;
	NP_001255974; NP_001255975; NP_001255976; NP_001255977; NP_001255978; NP_001255979; NP_001255980; NP_001255981; NP_001255983; NP_001255984; NP_542185
	NP_001074856; NP_001342114
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CTCFL (англ. CCCTC-binding factor like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 663 амінокислот, а молекулярна маса — 75 747^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAATEISVLS	EQFTKIKELE	LMPEKGLKEE	EKDGVCREKD	HRSPSELEAE
RTSGAFQDSV	LEEEVELVLA	PSEESEKYIL	TLQTVHFTSE	AVELQDMSLL
SIQQQEGVQV	VVQQPGPGLL	WLEEGPRQSL	QQCVAISIQQ	ELYSPQEMEV
LQFHALEENV	MVASEDSKLA	VSLAETTGLI	KLEEEQEKNQ	LLAERTKEQL
FFVETMSGDE	RSDEIVLTVS	NSNVEEQEDQ	PTAGQADAEK	AKSTKNQRKT
KGAKGTFHCD	VCMFTSSRMS	SFNRHMKTHT	SEKPHLCHLC	LKTFRTVTLL
RNHVNTHTGT	RPYKCNDCNM	AFVTSGELVR	HRRYKHTHEK	PFKCSMCKYA
SVEASKLKRH	VRSHTGERPF	QCCQCSYASR	DTYKLKRHMR	THSGEKPYEC
HICHTRFTQS	GTMKIHILQK	HGENVPKYQC	PHCATIIARK	SDLRVHMRNL
HAYSAAELKC	RYCSAVFHER	YALIQHQKTH	KNEKRFKCKH	CSYACKQERH
MTAHIRTHTG	EKPFTCLSCN	KCFRQKQLLN	AHFRKYHDAN	FIPTVYKCSK
CGKGFSRWIN	LHRHSEKCGS	GEAKSAASGK	GRRTRKRKQT	ILKEATKGQK
EAAKGWKEAA	NGDEAAAEEA	STTKGEQFPG	EMFPVACRET	TARVKEEVDE
GVTCEMLLNT	MDK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Jelinic P., Stehle J.-C., Shaw P. (2006). The testis-specific factor CTCFL cooperates with the protein methyltransferase PRMT7 in H19 imprinting control region methylation. PLoS Biol. 4: E355—E355. PMID 17048991 DOI:10.1371/journal.pbio.0040355
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Klenova E.M., Morse H.C. III, Ohlsson R., Lobanenkov V.V. (2002). The novel BORIS + CTCF gene family is uniquely involved in the epigenetics of normal biology and cancer. Semin. Cancer Biol. 12: 399—414. PMID 12191639 DOI:10.1016/S1044-579X(02)00060-3

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16234 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8NI51 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16234 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8NI51 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]