CTR9

CTR9
Ідентифікатори
Символи	CTR9, SH2BP1, TSBP, p150, p150TSP, CTR9 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 609366 MGI: 109345 HomoloGene: 40668 GeneCards: CTR9
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA polymerase II complex binding • SH2 domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма • Cdc73/Paf1 complex Біологічний процес • histone monoubiquitination • receptor signaling pathway via JAK-STAT • negative regulation of mRNA polyadenylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K4 trimethylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Wnt signaling pathway • transcription, DNA-templated • stem cell population maintenance • interleukin-6-mediated signaling pathway • endodermal cell fate commitment • positive regulation of histone H3-K4 methylation • inner cell mass cell differentiation • trophectodermal cell differentiation • positive regulation of histone H3-K79 methylation • blastocyst growth • histone H2B ubiquitination • positive regulation of histone H2B ubiquitination • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of myeloid cell differentiation • regulation of genetic imprinting • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0071110, GO:0036413, GO:0036414 histone modification • regulation of histone H3-K4 methylation • blastocyst hatching Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9646	22083
Ensembl	ENSG00000198730	ENSMUSG00000005609
UniProt	Q6PD62	Q62018
RefSeq (мРНК)	NM_014633 NM_001346279	NM_009431
RefSeq (білок)	NP_001333208 NP_055448	NP_033457
Локус (UCSC)	Хр. 11: 10.75 – 10.8 Mb	Хр. 7: 110.63 – 110.66 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CTR9 (англ. CTR9 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 173 амінокислот, а молекулярна маса — 133 502^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRGSIEIPL		RDTDEVIELD		FDQLPEGDEV		ISILKQEHTQ		LHIWIALALE
YYKQGKTEEF		VKLLEAARID		GNLDYRDHEK		DQMTCLDTLA		AYYVQQARKE
KNKDNKKDLI		TQATLLYTMA		DKIIMYDQNH		LLGRACFCLL		EGDKMDQADA
QFHFVLNQSP		NNIPALLGKA		CISFNKKDYR		GALAYYKKAL		RTNPGCPAEV
RLGMGHCFVK		LNKLEKARLA		FSRALELNSK		CVGALVGLAV		LELNNKEADS
IKNGVQLLSR		AYTIDPSNPM		VLNHLANHFF		FKKDYSKVQH		LALHAFHNTE
VEAMQAESCY		QLARSFHVQE		DYDQAFQYYY		QATQFASSSF		VLPFFGLGQM
YIYRGDKENA		SQCFEKVLKA		YPNNYETMKI		LGSLYAASED		QEKRDIAKGH
LKKVTEQYPD		DVEAWIELAQ		ILEQTDIQGA		LSAYGTATRI		LQEKVQADVP
PEILNNVGAL		HFRLGNLGEA		KKYFLASLDR		AKAEAEHDEH		YYNAISVTTS
YNLARLYEAM		CEFHEAEKLY		KNILREHPNY		VDCYLRLGAM		ARDKGNFYEA
SDWFKEALQI		NQDHPDAWSL		IGNLHLAKQE		WGPGQKKFER		ILKQPSTQSD
TYSMLALGNV		WLQTLHQPTR		DREKEKRHQD		RALAIYKQVL		RNDAKNLYAA
NGIGAVLAHK		GYFREARDVF		AQVREATADI		SDVWLNLAHI		YVEQKQYISA
VQMYENCLRK		FYKHQNTEVV		LYLARALFKC		GKLQECKQTL		LKARHVAPSD
TVLMFNVALV		LQRLATSVLK		DEKSNLKEVL		NAVKELELAH		RYFSYLSKVG
DKMRFDLALA		ATEARQCSDL		LSQAQYHVAR		ARKQDEEERE		LRAKQEQEKE
LLRQKLLKEQ		EEKRLREKEE		QKKLLEQRAQ		YVEKTKNILM		FTGETEATKE
KKRGGGGGRR		SKKGGEFDEF		VNDDTDDDLP		ISKKKKRRKG		SGSEQEGEDE
EGGERKKKKR		RRHPKGEEGS		DDDETENGPK		PKKRRPPKAE		KKKAPKPERL
PPSMKGKIKS		KAIISSSDDS		SDEDKLKIAD		EGHPRNSNSN		SDSDEDEQRK
KCASSESDSD		ENQNKSGSEA		GSPRRPRRQR		SDQDSDSDQP		SRKRRPSGSE
QSDNESVQSG		RSHSGVSEND		SRPASPSAES		DHESERGSDN		EGSGQGSGNE
SEPEGSNNEA		SDRGSEHGSD		DSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 doi:10.1093/dnares/2.4.167
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 doi:10.1021/pr800500r
• Kim J., Guermah M., Roeder R.G. (2010). The human PAF1 complex acts in chromatin transcription elongation both independently and cooperatively with SII/TFIIS. Cell. 140: 491—503. PMID 20178742 doi:10.1016/j.cell.2009.12.050

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16850 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
4. UniProt, Q6PD62 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 11

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»