CTSB

CTSB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3PBH, 1CSB, 1GMY, 1HUC, 1PBH, 2IPP, 2PBH, 3AI8, 3CBJ, 3CBK, 3K9M
Ідентифікатори
Символи	CTSB, APPS, CPSB, cathepsin B, RECEUP
Зовнішні ІД	OMIM: 116810 MGI: 88561 HomoloGene: 37550 GeneCards: CTSB
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • collagen binding • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • proteoglycan binding • serine-type endopeptidase activity • endopeptidase activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • Меланосома • внутрішньоклітинний • extracellular region • endolysosome lumen • ядерце • мітохондрія • лізосома • екзосома • perinuclear region of cytoplasm • міжклітинний простір • ficolin-1-rich granule lumen • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • regulation of apoptotic process • epithelial cell differentiation • протеоліз • toll-like receptor signaling pathway • decidualization • cellular response to thyroid hormone stimulus • collagen catabolic process • viral entry into host cell • GO:0048552 regulation of catalytic activity • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1508	13030
Ensembl	ENSG00000164733 ENSG00000285132	ENSMUSG00000021939
UniProt	P07858	P10605
RefSeq (мРНК)	NM_001908 NM_147780 NM_147781 NM_147782 NM_147783 NM_001317237	NM_007798
RefSeq (білок)	NP_001304166 NP_001899 NP_680090 NP_680091 NP_680092 NP_680093	NP_031824
Локус (UCSC)	Хр. 8: 11.84 – 11.87 Mb	Хр. 14: 63.36 – 63.38 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CTSB (англ. Cathepsin B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 37 822^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWQLWASLCC		LLVLANARSR		PSFHPLSDEL		VNYVNKRNTT		WQAGHNFYNV
DMSYLKRLCG		TFLGGPKPPQ		RVMFTEDLKL		PASFDAREQW		PQCPTIKEIR
DQGSCGSCWA		FGAVEAISDR		ICIHTNAHVS		VEVSAEDLLT		CCGSMCGDGC
NGGYPAEAWN		FWTRKGLVSG		GLYESHVGCR		PYSIPPCEHH		VNGSRPPCTG
EGDTPKCSKI		CEPGYSPTYK		QDKHYGYNSY		SVSNSEKDIM		AEIYKNGPVE
GAFSVYSDFL		LYKSGVYQHV		TGEMMGGHAI		RILGWGVENG		TPYWLVANSW
NTDWGDNGFF		KILRGQDHCG		IESEVVAGIP		RTDQYWEKI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Локалізований у лізосомі. Також секретований назовні.

Література

• Chan S.J., San Segundo B., McCormick M.B., Steiner D.F. (1986). Nucleotide and predicted amino acid sequences of cloned human and mouse preprocathepsin B cDNAs. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 7721—7725. PMID 3463996 doi:10.1073/pnas.83.20.7721
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Ritonja A., Popovic T., Turk V., Wiedenmann K., Machleidt W. (1985). Amino acid sequence of human liver cathepsin B. FEBS Lett. 181: 169—172. PMID 3972105 doi:10.1016/0014-5793(85)81136-4
• Fong D., Calhoun D.H., Hsieh W.-T., Lee B., Wells R.D. (1986). Isolation of a cDNA clone for the human lysosomal proteinase cathepsin B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 2909—2913. PMID 3010323 doi:10.1073/pnas.83.9.2909
• Turk D., Podobnik M., Kuhelj R., Dolinar M., Turk V. (1996). Crystal structures of human procathepsin B at 3.2- and 3.3-A resolution reveal an interaction motif between a papain-like cysteine protease and its propeptide. FEBS Lett. 384: 211—214. PMID 8617355 doi:10.1016/0014-5793(96)00309-2
• Podobnik M., Kuhelj R., Turk V., Turk D. (1997). Crystal structure of the wild-type human procathepsin B at 2.5-A resolution reveals the native active site of a papain-like cysteine protease zymogen. J. Mol. Biol. 271: 774—788. PMID 9299326 doi:10.1006/jmbi.1997.1218

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2527 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-10-14 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P07858 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 8

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»