DCLK1

DCLK1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1MFW, 1MG4, 1UF0
Ідентифікатори
Символи	DCLK1, CL1, CLICK1, DCAMKL1, DCDC3A, DCLK, doublecortin like kinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604742 MGI: 1330861 HomoloGene: 130530 GeneCards: DCLK1
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • protein kinase activity; • nucleotide binding; • kinase activity; • ATP binding; • protein serine/threonine kinase activity;
Клітинна компонента	• integral component of plasma membrane; • внутрішньоклітинний; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення;
Біологічний процес	• диференціація клітин; • аксоноґенеза; • dendrite morphogenesis; • фосфорилювання; • response to virus; • neuron migration; • нейробіологія розвитку; • multicellular organism development; • endosomal transport; • protein phosphorylation; • central nervous system development; • brain development; • axon extension; • forebrain development; • central nervous system projection neuron axonogenesis; • negative regulation of protein localization to nucleus; • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation; • peptidyl-threonine phosphorylation; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • neuron projection morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	9201
	13175
	ENSG00000133083
	ENSMUSG00000027797
	O15075
	Q9JLM8
NM_001195415; NM_001195416; NM_001195430; NM_004734; NM_001330071;
	NM_001330072
NM_001111051; NM_001111052; NM_001111053; NM_001195538; NM_001195539;
	NM_001195540; NM_019978; NM_001357466; NM_001357468; NM_001357469; NM_001357475; NM_001357476
NP_001182344; NP_001182345; NP_001182359; NP_001317000; NP_001317001;
	NP_004725
NP_001104521; NP_001104522; NP_001104523; NP_001182467; NP_001182468;
	NP_001182469; NP_064362; NP_001344395; NP_001344397; NP_001344398; NP_001344404; NP_001344405
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DCLK1 (англ. Doublecortin like kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 740 амінокислот, а молекулярна маса — 82 224^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSFGRDMELE	HFDERDKAQR	YSRGSRVNGL	PSPTHSAHCS	FYRTRTLQTL
SSEKKAKKVR	FYRNGDRYFK	GIVYAISPDR	FRSFEALLAD	LTRTLSDNVN
LPQGVRTIYT	IDGLKKISSL	DQLVEGESYV	CGSIEPFKKL	EYTKNVNPNW
SVNVKTTSAS	RAVSSLATAK	GSPSEVRENK	DFIRPKLVTI	IRSGVKPRKA
VRILLNKKTA	HSFEQVLTDI	TDAIKLDSGV	VKRLYTLDGK	QVMCLQDFFG
DDDIFIACGP	EKFRYQDDFL	LDESECRVVK	STSYTKIASS	SRRSTTKSPG
PSRRSKSPAS	TSSVNGTPGS	QLSTPRSGKS	PSPSPTSPGS	LRKQRSSQHG
GSSTSLASTK	VCSSMDENDG	PGEEVSEEGF	QIPATITERY	KVGRTIGDGN
FAVVKECVER	STAREYALKI	IKKSKCRGKE	HMIQNEVSIL	RRVKHPNIVL
LIEEMDVPTE	LYLVMELVKG	GDLFDAITST	NKYTERDASG	MLYNLASAIK
YLHSLNIVHR	DIKPENLLVY	EHQDGSKSLK	LGDFGLATIV	DGPLYTVCGT
PTYVAPEIIA	ETGYGLKVDI	WAAGVITYIL	LCGFPPFRGS	GDDQEVLFDQ
ILMGQVDFPS	PYWDNVSDSA	KELITMMLLV	DVDQRFSAVQ	VLEHPWVNDD
GLPENEHQLS	VAGKIKKHFN	TGPKPNSTAA	GVSVIATTAL	DKERQVFRRR
RNQDVRSRYK	AQPAPPELNS	ESEDYSPSSS	ETVRSPNSPF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

Sossey-Alaoui K., Srivastava A.K. (1999). DCAMKL1, a brain-specific transmembrane protein on 13q12.3 that is similar to doublecortin (DCX). Genomics. 56: 121—126. PMID 10036192 DOI:10.1006/geno.1998.5718
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Matsumoto N., Pilz D.T., Ledbetter D.H. (1999). Genomic structure, chromosomal mapping, and expression pattern of human DCAMKL1 (KIAA0369), a homologue of DCX (XLIS). Genomics. 56: 179—183. PMID 10051403 DOI:10.1006/geno.1998.5673
Leong W.F., Chow V.T. (2006). Transcriptomic and proteomic analyses of rhabdomyosarcoma cells reveal differential cellular gene expression in response to enterovirus 71 infection. Cell. Microbiol. 8: 565—580. PMID 16548883 DOI:10.1111/j.1462-5822.2005.00644.x

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з DCLK1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2700 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, O15075 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 13

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з DCLK1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2700 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, O15075 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]