DCP1A

DCP1A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2WX3, 4B6H
Ідентифікатори
Символи	DCP1A, HSA275986, Nbla00360, SMAD4IP1, SMIF, decapping mRNA 1A
Зовнішні ІД	OMIM: 607010 MGI: 1923151 HomoloGene: 10178 GeneCards: DCP1A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0010576 enzyme regulator activity; • GO:0010577 enzyme activator activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • mRNA binding; • hydrolase activity; • identical protein binding; • kinesin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • клітинне ядро; • P-body; • cytoplasmic ribonucleoprotein granule;
Біологічний процес	• GO:0048554 positive regulation of catalytic activity; • deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA; • protein localization to cytoplasmic stress granule; • regulation of mRNA stability; • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA; • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	55802
	75901
	ENSG00000272886
	ENSMUSG00000021962
	Q9NPI6
	Q91YD3
	NM_018403; NM_001290204; NM_001290205; NM_001290206; NM_001290207
	NM_133761
	NP_001277133; NP_001277134; NP_001277135; NP_001277136; NP_060873
	NP_598522
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DCP1A (англ. Decapping mRNA 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 582 амінокислот, а молекулярна маса — 63 309^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEALSRAGQE	MSLAALKQHD	PYITSIADLT	GQVALYTFCP	KANQWEKTDI
EGTLFVYRRS	ASPYHGFTIV	NRLNMHNLVE	PVNKDLEFQL	HEPFLLYRNA
SLSIYSIWFY	DKNDCHRIAK	LMADVVEEET	RRSQQAARDK	QSPSQANGCS
DHRPIDILEM	LSRAKDEYER	NQMGDSNISS	PGLQPSTQLS	NLGSTETLEE
MPSGSQDKSA	PSGHKHLTVE	ELFGTSLPKE	QPAVVGLDSE	EMERLPGDAS
QKEPNSFLPF	PFEQLGGAPQ	SETLGVPSAA	HHSVQPEITT	PVLITPASIT
QSNEKHAPTY	TIPLSPVLSP	TLPAEAPTAQ	VPPSLPRNST	MMQAVKTTPR
QRSPLLNQPV	PELSHASLIA	NQSPFRAPLN	VTNTAGTSLP	SVDLLQKLRL
TPQHDQIQTQ	PLGKGAMVAS	FSPAAGQLAT	PESFIEPPSK	TAAARVAASA
SLSNMVLAPL	QSMQQNQDPE	VFVQPKVLSS	AIQVAGAPLV	TATTTAVSSV
LLAPSVFQQT	VTRSSDLERK	ASSPSPLTIG	TPESQRKPSI	ILSKSQLQDT
LIHLIKNDSS	FLSTLHEVYL	QVLTKNKDNH	NL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Lykke-Andersen J. (2002). Identification of a human decapping complex associated with hUpf proteins in nonsense-mediated decay. Mol. Cell. Biol. 22: 8114—8121. PMID 12417715 doi:10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Lykke-Andersen J., Wagner E. (2005). Recruitment and activation of mRNA decay enzymes by two ARE-mediated decay activation domains in the proteins TTP and BRF-1. Genes Dev. 19: 351—361. PMID 15687258 doi:10.1101/gad.1282305
Fenger-Groen M., Fillman C., Norrild B., Lykke-Andersen J. (2005). Multiple processing body factors and the ARE binding protein TTP activate mRNA decapping. Mol. Cell. 20: 905—915. PMID 16364915 doi:10.1016/j.molcel.2005.10.031
Cho H., Kim K.M., Kim Y.K. (2009). Human proline-rich nuclear receptor coregulatory protein 2 mediates an interaction between mRNA surveillance machinery and decapping complex. Mol. Cell. 33: 75—86. PMID 19150429 doi:10.1016/j.molcel.2008.11.022
Ingelfinger D., Arndt-Jovin D.J., Luehrmann R., Achsel T. (2002). The human LSm1-7 proteins colocalize with the mRNA-degrading enzymes Dcp1/2 and Xrnl in distinct cytoplasmic foci. RNA. 8: 1489—1501. PMID 12515382

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18714 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NPI6 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18714 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9NPI6 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]