DCPS

DCPS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1ST0, 1ST4, 1XML, 1XMM, 3BL7, 3BL9, 3BLA, 4QDE, 4QDV, 4QEB
Ідентифікатори
Символи	DCPS, DCS1, HINT-5, HINT5, HSL1, ARS, HSPC015, decapping enzyme, scavenger
Зовнішні ІД	OMIM: 610534 MGI: 1916555 HomoloGene: 32202 GeneCards: DCPS
Пов'язані генетичні захворювання
	Al-Raqad syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• m7G(5')pppN diphosphatase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • RNA 7-methylguanosine cap binding; • exoribonuclease activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мітохондрія; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • P-body; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• mRNA cis splicing, via spliceosome; • negative regulation of programmed cell death; • mRNA processing; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay; • cellular response to menadione; • Сплайсинг РНК; • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic; • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	28960
	69305
	ENSG00000110063
	ENSMUSG00000032040
	Q96C86
	Q9DAR7
	NM_014026; NM_001350236
	NM_027030
	NP_054745; NP_001337165
	NP_081306
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DCPS (англ. Decapping enzyme, scavenger) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 337 амінокислот, а молекулярна маса — 38 609^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADAAPQLGK	RKRELDVEEA	HAASTEEKEA	GVGNGTCAPV	RLPFSGFRLQ
KVLRESARDK	IIFLHGKVNE	ASGDGDGEDA	VVILEKTPFQ	VEQVAQLLTG
SPELQLQFSN	DIYSTYHLFP	PRQLNDVKTT	VVYPATEKHL	QKYLRQDLRL
IRETGDDYRN	ITLPHLESQS	LSIQWVYNIL	DKKAEADRIV	FENPDPSDGF
VLIPDLKWNQ	QQLDDLYLIA	ICHRRGIRSL	RDLTPEHLPL	LRNILHQGQE
AILQRYRMKG	DHLRVYLHYL	PSYYHLHVHF	TALGFEAPGS	GVERAHLLAE
VIENLECDPR	HYQQRTLTFA	LRADDPLLKL	LQEAQQS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Liu H., Rodgers N.D., Jiao X., Kiledjian M. (2002). The scavenger mRNA decapping enzyme DcpS is a member of the HIT family of pyrophosphatases. EMBO J. 21: 4699—4708. PMID 12198172 DOI:10.1093/emboj/cdf448
Kwasnicka D.A., Krakowiak A., Thacker C., Brenner C., Vincent S.R. (2003). Coordinate expression of NADPH-dependent flavin reductase, Fre-1, and Hint-related 7meGMP-directed hydrolase, DCS-1. J. Biol. Chem. 278: 39051—39058. PMID 12871939 DOI:10.1074/jbc.M306355200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang Z., Kiledjian M. (2001). Functional link between the mammalian exosome and mRNA decapping. Cell. 107: 751—762. PMID 11747811 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00592-X
van Dijk E., Le Hir H., Seraphin B. (2003). DcpS can act in the 5'-3' mRNA decay pathway in addition to the 3'-5' pathway. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12081—12086. PMID 14523240 DOI:10.1073/pnas.1635192100
Kwasnicka-Crawford D.A., Vincent S.R. (2005). Role of a novel dual flavin reductase (NR1) and an associated histidine triad protein (DCS-1) in menadione-induced cytotoxicity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 336: 565—571. PMID 16140270 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.08.129

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з DCPS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29812 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96C86 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2018. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з DCPS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29812 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q96C86 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2018. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]