DEFA5

DEFA5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1ZMP, 2LXZ, 2MIT, 3I5W, 4E82, 4E83, 4E86, 4RBW, 4RBX, 5CUM, 5CUJ, 5CUI
Ідентифікатори
Символи	DEFA5, DEF5, HD-5, defensin alpha 5, alpha defensin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 600472 MGI: 3711900 HomoloGene: 128604 GeneCards: DEFA5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity;
Клітинна компонента	• Golgi lumen; • secretory granule lumen; • transport vesicle; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • extracellular region; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• defense response; • defense response to bacterium; • defense response to fungus; • antimicrobial humoral response; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; • вроджений імунітет; • positive regulation of membrane permeability; • killing of cells of other organism; • innate immune response in mucosa; • antibacterial humoral response; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium; • membrane disruption in other organism; • cellular response to lipopolysaccharide;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1670
	100041688
	ENSG00000164816; ENSG00000285251
	ENSMUSG00000061845
	Q01523
	E9QLQ1
	NM_021010
	NM_001177481
	NP_066290
	NP_001170952
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DEFA5 (англ. Defensin alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 94 амінокислот, а молекулярна маса — 10 071^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTIAILAAI		LLVALQAQAE		SLQERADEAT		TQKQSGEDNQ		DLAISFAGNG
LSALRTSGSQ		ARATCYCRTG		RCATRESLSG		VCEISGRLYR		LCCR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фунгіцидів. Локалізований у цитоплазматичних везикулах. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Ericksen B., Wu Z., Lu W., Lehrer R.I. (2005). Antibacterial activity and specificity of the six human alpha-defensins. Antimicrob. Agents Chemother. 49: 269—275. PMID 15616305 doi:10.1128/AAC.49.1.269-275.2005
Jones D.E., Bevins C.L. (1992). Paneth cells of the human small intestine express an antimicrobial peptide gene. J. Biol. Chem. 267: 23216—23225. PMID 1429669

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2764 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q01523 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2764 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q01523 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]