DEPDC1

DEPDC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YSR
Ідентифікатори
Символи	DEPDC1, DEP.8, DEPDC1-V2, DEPDC1A, SDP35, DEP domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 612002 MGI: 1923381 HomoloGene: 9834 GeneCards: DEPDC1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • transcription repressor complex • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0007243 intracellular signal transduction • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55635	76131
Ensembl	ENSG00000024526	ENSMUSG00000028175
UniProt	Q5TB30	Q8CIG0
RefSeq (мРНК)	NM_017779 NM_001114120	NM_001172092 NM_001172093 NM_029523
RefSeq (білок)	NP_001107592 NP_060249	NP_001165563 NP_001165564 NP_083799
Локус (UCSC)	Хр. 1: 68.47 – 68.5 Mb	Хр. 3: 159.2 – 159.24 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DEPDC1 (англ. DEP domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 811 амінокислот, а молекулярна маса — 92 960^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESQGVPPGP		YRATKLWNEV		TTSFRAGMPL		RKHRQHFKKY		GNCFTAGEAV
DWLYDLLRNN		SNFGPEVTRQ		QTIQLLRKFL		KNHVIEDIKG		RWGSENVDDN
NQLFRFPATS		PLKTLPRRYP		ELRKNNIENF		SKDKDSIFKL		RNLSRRTPKR
HGLHLSQENG		EKIKHEIINE		DQENAIDNRE		LSQEDVEEVW		RYVILIYLQT
ILGVPSLEEV		INPKQVIPQY		IMYNMANTSK		RGVVILQNKS		DDLPHWVLSA
MKCLANWPRS		NDMNNPTYVG		FERDVFRTIA		DYFLDLPEPL		LTFEYYELFV
NILVVCGYIT		VSDRSSGIHK		IQDDPQSSKF		LHLNNLNSFK		STECLLLSLL
HREKNKEESD		STERLQISNP		GFQERCAKKM		QLVNLRNRRV		SANDIMGGSC
HNLIGLSNMH		DLSSNSKPRC		CSLEGIVDVP		GNSSKEASSV		FHQSFPNIEG
QNNKLFLESK		PKQEFLLNLH		SEENIQKPFS		AGFKRTSTLT		VQDQEELCNG
KCKSKQLCRS		QSLLLRSSTR		RNSYINTPVA		EIIMKPNVGQ		GSTSVQTAME
SELGESSATI		NKRLCKSTIE		LSENSLLPAS		SMLTGTQSLL		QPHLERVAID
ALQLCCLLLP		PPNRRKLQLL		MRMISRMSQN		VDMPKLHDAM		GTRSLMIHTF
SRCVLCCAEE		VDLDELLAGR		LVSFLMDHHQ		EILQVPSYLQ		TAVEKHLDYL
KKGHIENPGD		GLFAPLPTYS		YCKQISAQEF		DEQKVSTSQA		AIAELLENII
KNRSLPLKEK		RKKLKQFQKE		YPLIYQKRFP		TTESEAALFG		DKPTIKQPML
ILRKPKFRSL		R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22949 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
4. UniProt, Q5TB30 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»