DHX58

DHX58
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2RQA, 2W4R, 3EQT
Ідентифікатори
Символи	DHX58, D11LGP2, D11lgp2e, LGP2, RLR-3, DEXH-box helicase 58
Зовнішні ІД	OMIM: 608588 MGI: 1931560 HomoloGene: 69371 GeneCards: DHX58
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • nucleotide binding; • GO:0008026 helicase activity; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • single-stranded RNA binding; • RNA binding; • double-stranded RNA binding; • hydrolase activity; • ATP binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма;
Біологічний процес	• negative regulation of MDA-5 signaling pathway; • regulation of innate immune response; • процес імунної системи; • response to virus; • positive regulation of RIG-I signaling pathway; • defense response to virus; • negative regulation of innate immune response; • negative regulation of type I interferon production; • вроджений імунітет; • GO:0022415 viral process; • positive regulation of MDA-5 signaling pathway; • positive regulation of type I interferon production; • negative regulation of RIG-I signaling pathway; • response to bacterium;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	79132
	80861
	ENSG00000108771
	ENSMUSG00000017830
	Q96C10
	Q99J87
	NM_024119
	NM_030150
	NP_077024
	NP_084426
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DHX58 (англ. DExH-box helicase 58) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 678 амінокислот, а молекулярна маса — 76 613^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MELRSYQWEV	IMPALEGKNI	IIWLPTGAGK	TRAAAYVAKR	HLETVDGAKV
VVLVNRVHLV	TQHGEEFRRM	LDGRWTVTTL	SGDMGPRAGF	GHLARCHDLL
ICTAELLQMA	LTSPEEEEHV	ELTVFSLIVV	DECHHTHKDT	VYNVIMSQYL
ELKLQRAQPL	PQVLGLTASP	GTGGASKLDG	AINHVLQLCA	NLDTWCIMSP
QNCCPQLQEH	SQQPCKQYNL	CHRRSQDPFG	DLLKKLMDQI	HDHLEMPELS
RKFGTQMYEQ	QVVKLSEAAA	LAGLQEQRVY	ALHLRRYNDA	LLIHDTVRAV
DALAALQDFY	HREHVTKTQI	LCAERRLLAL	FDDRKNELAH	LATHGPENPK
LEMLEKILQR	QFSSSNSPRG	IIFTRTRQSA	HSLLLWLQQQ	QGLQTVDIRA
QLLIGAGNSS	QSTHMTQRDQ	QEVIQKFQDG	TLNLLVATSV	AEEGLDIPHC
NVVVRYGLLT	NEISMVQARG	RARADQSVYA	FVATEGSREL	KRELINEALE
TLMEQAVAAV	QKMDQAEYQA	KIRDLQQAAL	TKRAAQAAQR	ENQRQQFPVE
HVQLLCINCM	VAVGHGSDLR	KVEGTHHVNV	NPNFSNYYNV	SRDPVVINKV
FKDWKPGGVI	SCRNCGEVWG	LQMIYKSVKL	PVLKVRSMLL	ETPQGRIQAK
KWSRVPFSVP	DFDFLQHCAE	NLSDLSLD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, противірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Komuro A., Horvath C.M. (2006). RNA- and virus-independent inhibition of antiviral signaling by RNA helicase LGP2. J. Virol. 80: 12332—12342. PMID 17020950 DOI:10.1128/JVI.01325-06
Vitour D., Meurs E.F. (2007). Regulation of interferon production by RIG-I and LGP2: a lesson in self-control. Sci. STKE. 2007: PE20—PE20. PMID 17473309 DOI:10.1126/stke.3842007pe20
Bamming D., Horvath C.M. (2009). Regulation of signal transduction by enzymatically inactive antiviral RNA helicase proteins MDA5, RIG-I, and LGP2. J. Biol. Chem. 284: 9700—9712. PMID 19211564 DOI:10.1074/jbc.M807365200
Loo Y.M., Gale M. Jr. (2011). Immune signaling by RIG-I-like receptors. Immunity. 34: 680—692. PMID 21616437 DOI:10.1016/j.immuni.2011.05.003
Broquet A.H., Hirata Y., McAllister C.S., Kagnoff M.F. (2011). RIG-I/MDA5/MAVS are required to signal a protective IFN response in rotavirus-infected intestinal epithelium. J. Immunol. 186: 1618—1626. PMID 21187438 DOI:10.4049/jimmunol.1002862

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29517 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96C10 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29517 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q96C10 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]