DMAP1

DMAP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3HM5, 4IEJ
Ідентифікатори
Символи	DMAP1, DNMAP1, DNMTAP1, EAF2, MEAF2, SWC4, DNA methyltransferase 1 associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605077 MGI: 1913483 HomoloGene: 41311 GeneCards: DMAP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • DNA binding;
Клітинна компонента	• replication fork; • цитоплазма; • NuA4 histone acetyltransferase complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• ремоделювання хроматину; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • Метилювання ДНК; • regulation of growth; • response to ethanol; • GO:0100026 Репарація ДНК; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • histone H4 acetylation; • histone H2A acetylation; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • positive regulation of protein import into nucleus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	55929
	66233
	ENSG00000178028
	ENSMUSG00000009640
	Q9NPF5; Q5TG37
	Q9JI44
	NM_001034023; NM_001034024; NM_019100
	NM_023178
	NP_001029195; NP_001029196; NP_061973
	NP_075667
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DMAP1 (англ. DNA methyltransferase 1 associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 52 993^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATGADVRDI	LELGGPEGDA	ASGTISKKDI	INPDKKKSKK	SSETLTFKRP
EGMHREVYAL	LYSDKKDAPP	LLPSDTGQGY	RTVKAKLGSK	KVRPWKWMPF
TNPARKDGAM	FFHWRRAAEE	GKDYPFARFN	KTVQVPVYSE	QEYQLYLHDD
AWTKAETDHL	FDLSRRFDLR	FVVIHDRYDH	QQFKKRSVED	LKERYYHICA
KLANVRAVPG	TDLKIPVFDA	GHERRRKEQL	ERLYNRTPEQ	VAEEEYLLQE
LRKIEARKKE	REKRSQDLQK	LITAADTTAE	QRRTERKAPK	KKLPQKKEAE
KPAVPETAGI	KFPDFKSAGV	TLRSQRMKLP	SSVGQKKIKA	LEQMLLELGV
ELSPTPTEEL	VHMFNELRSD	LVLLYELKQA	CANCEYELQM	LRHRHEALAR
AGVLGGPATP	ASGPGPASAE	PAVTEPGLGP	DPKDTIIDVV	GAPLTPNSRK
RRESASSSSS	VKKAKKP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, регуляція росту. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Rountree M.R., Bachman K.E., Baylin S.B. (2000). DNMT1 binds HDAC2 and a new co-repressor, DMAP1, to form a complex at replication foci. Nat. Genet. 25: 269—277. PMID 10888872 doi:10.1038/77023
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 doi:10.1093/dnares/7.1.65
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Doyon Y., Cote J. (2004). The highly conserved and multifunctional NuA4 HAT complex. Curr. Opin. Genet. Dev. 14: 147—154. PMID 15196461 doi:10.1016/j.gde.2004.02.009
Xin H., Yoon H.-G., Singh P.B., Wong J., Qin J. (2004). Components of a pathway maintaining histone modification and heterochromatin protein 1 binding at the pericentric heterochromatin in mammalian cells. J. Biol. Chem. 279: 9539—9546. PMID 14665632 doi:10.1074/jbc.M311587200
Doyon Y., Selleck W., Lane W.S., Tan S., Cote J. (2004). Structural and functional conservation of the NuA4 histone acetyltransferase complex from yeast to humans. Mol. Cell. Biol. 24: 1884—1896. PMID 14966270 doi:10.1128/MCB.24.5.1884-1896.2004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18291 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2017-05-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9NPF5 (англ.) . Архів оригіналу за 21 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18291 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2017-05-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9NPF5 (англ.) . Архів оригіналу за 21 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]