DTX1

DTX1
Ідентифікатори
Символи	DTX1, hDx-1, deltex 1, deltex E3 ubiquitin ligase 1, RNF140
Зовнішні ІД	OMIM: 602582 MGI: 1352744 HomoloGene: 74522 GeneCards: DTX1
Онтологія гена Молекулярна функція • SH3 domain binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • зв'язування з іоном металу • Notch binding • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • cell surface receptor signaling pathway • glial cell differentiation • transcription by RNA polymerase II • regulation of Notch signaling pathway • negative regulation of T cell differentiation • negative regulation of neuron differentiation • Убіквітин-залежний протеоліз • transcription, DNA-templated • cellular response to leukemia inhibitory factor • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1840	14357
Ensembl	ENSG00000135144	ENSMUSG00000029603
UniProt	Q86Y01	Q61010
RefSeq (мРНК)	NM_004416	NM_008052
RefSeq (білок)	NP_004407	NP_032078
Локус (UCSC)	Хр. 12: 113.06 – 113.1 Mb	Хр. 5: 120.82 – 120.85 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DTX1 (англ. Deltex E3 ubiquitin ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 620 амінокислот, а молекулярна маса — 67 368^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRPGHGGLM		PVNGLGFPPQ		NVARVVVWEW		LNEHSRWRPY		TATVCHHIEN
VLKEDARGSV		VLGQVDAQLV		PYIIDLQSMH		QFRQDTGTMR		PVRRNFYDPS
SAPGKGIVWE		WENDGGAWTA		YDMDICITIQ		NAYEKQHPWL		DLSSLGFCYL
IYFNSMSQMN		RQTRRRRRLR		RRLDLAYPLT		VGSIPKSQSW		PVGASSGQPC
SCQQCLLVNS		TRAASNAILA		SQRRKAPPAP		PLPPPPPPGG		PPGALAVRPS
ATFTGAALWA		APAAGPAEPA		PPPGAPPRSP		GAPGGARTPG		QNNLNRPGPQ
RTTSVSARAS		IPPGVPALPV		KNLNGTGPVH		PALAGMTGIL		LCAAGLPVCL
TRAPKPILHP		PPVSKSDVKP		VPGVPGVCRK		TKKKHLKKSK		NPEDVVRRYM
QKVKNPPDED		CTICMERLVT		ASGYEGVLRH		KGVRPELVGR		LGRCGHMYHL
LCLVAMYSNG		NKDGSLQCPT		CKAIYGEKTG		TQPPGKMEFH		LIPHSLPGFP
DTQTIRIVYD		IPTGIQGPEH		PNPGKKFTAR		GFPRHCYLPN		NEKGRKVLRL
LITAWERRLI		FTIGTSNTTG		ESDTVVWNEI		HHKTEFGSNL		TGHGYPDASY
LDNVLAELTA		QGVSEAAAKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Chastagner P., Israel A., Brou C. (2006). Itch/AIP4 mediates Deltex degradation through the formation of K29-linked polyubiquitin chains. EMBO Rep. 7: 1147—1153. PMID 17028573 doi:10.1038/sj.embor.7400822

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3060 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-08-24 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q86Y01 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 12

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»