EDC3

EDC3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2VC8, 2WAX, 2WAY, 3D3J, 3D3K
Ідентифікатори
Символи	EDC3, LSM16, YJDC, YJEFN2, MRT50, enhancer of mRNA decapping 3, hYjeF_N2-15q23
Зовнішні ІД	OMIM: 609842 MGI: 2142951 HomoloGene: 11827 GeneCards: EDC3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphodiesterase decapping endonuclease activity • identical protein binding • RNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • P-body • cytoplasmic ribonucleoprotein granule Біологічний процес • P-body assembly • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80153	353190
Ensembl	ENSG00000179151	ENSMUSG00000038957
UniProt	Q96F86	Q8K2D3
RefSeq (мРНК)	NM_001142443 NM_001142444 NM_025083 NM_001351378 NM_001351379	NM_153799
RefSeq (білок)	NP_001135915 NP_001135916 NP_079359 NP_001338307 NP_001338308	NP_722494
Локус (UCSC)	Хр. 15: 74.63 – 74.7 Mb	Хр. 9: 57.62 – 57.66 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EDC3 (англ. Enhancer of mRNA decapping 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 56 078^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATDWLGSIV		SINCGDSLGV		YQGRVSAVDQ		VSQTISLTRP		FHNGVKCLVP
EVTFRAGDIT		ELKILEIPGP		GDNQHFGDLH		QTELGPSGAG		CQVGINQNGT
GKFVKKPASS		SSAPQNIPKR		TDVKSQDVAV		SPQQQQCSKS		YVDRHMESLS
QSKSFRRRHN		SWSSSSRHPN		QATPKKSGLK		NGQMKNKDDE		CFGDDIEEIP
DTDFDFEGNL		ALFDKAAVFE		EIDTYERRSG		TRSRGIPNER		PTRYRHDENI
LESEPIVYRR		IIVPHNVSKE		FCTDSGLVVP		SISYELHKKL		LSVAEKHGLT
LERRLEMTGV		CASQMALTLL		GGPNRLNPKN		VHQRPTVALL		CGPHVKGAQG
ISCGRHLANH		DVQVILFLPN		FVKMLESITN		ELSLFSKTQG		QQVSSLKDLP
TSPVDLVINC		LDCPENVFLR		DQPWYKAAVA		WANQNRAPVL		SIDPPVHEVE
QGIDAKWSLA		LGLPLPLGEH		AGRIYLCDIG		IPQQVFQEVG		INYHSPFGCK
FVIPLHSA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Fenger-Groen M., Fillman C., Norrild B., Lykke-Andersen J. (2005). Multiple processing body factors and the ARE binding protein TTP activate mRNA decapping. Mol. Cell. 20: 905—915. PMID 16364915 doi:10.1016/j.molcel.2005.10.031
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26114 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q96F86 (англ.) . Архів оригіналу за 21 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 15

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»