EME1

EME1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2ZIU, 2ZIV, 2ZIW, 2ZIX, 4P0P, 4P0Q, 4P0R, 4P0S
Ідентифікатори
Символи	EME1, MMS4L, SLX2A, essential meiotic structure-specific endonuclease 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610885 MGI: 3576783 HomoloGene: 16123 GeneCards: EME1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • endonuclease activity • nuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • endodeoxyribonuclease activity • crossover junction endodeoxyribonuclease activity Клітинна компонента • ядерце • нуклеоплазма • клітинне ядро • Holliday junction resolvase complex Біологічний процес • cellular response to DNA damage stimulus • DNA recombination • interstrand cross-link repair • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • response to intra-S DNA damage checkpoint signaling • GO:0100026 Репарація ДНК • resolution of meiotic recombination intermediates • double-strand break repair • replication fork processing • mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	146956	268465
Ensembl	ENSG00000154920	ENSMUSG00000039055
UniProt	Q96AY2	Q8BJW7
RefSeq (мРНК)	NM_001166131 NM_152463	NM_177752 NM_001379688
RefSeq (білок)	NP_001159603 NP_689676	NP_808420 NP_001366617
Локус (UCSC)	Хр. 17: 50.37 – 50.38 Mb	Хр. 11: 94.54 – 94.54 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EME1 (англ. Essential meiotic structure-specific endonuclease 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 570 амінокислот, а молекулярна маса — 63 252^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALKKSSPSL		DSGDSDSEEL		PTFAFLKKEP		SSTKRRQPER		EEKIVVVDIS
DCEASCPPAP		ELFSPPVPEI		AETVTQTQPV		RLLSSESEDE		EEFIPLAQRL
TCKFLTHKQL		SPEDSSSPVK		SVLDHQNNEG		ASCDWKKPFP		KIPEVPLHDT
PERSAADNKD		LILDPCCQLP		AYLSTCPGQS		SSLAVTKTNS		DILPPQKKTK
PSQKVQGRGS		HGCRQQRQAR		QKESTLRRQE		RKNAALVTRM		KAQRPEECLK
HIIVVLDPVL		LQMEGGGQLL		GALQTMECRC		VIEAQAVPCS		VTWRRRAGPS
EDREDWVEEP		TVLVLLRAEA		FVSMIDNGKQ		GSLDSTMKGK		ETLQGFVTDI
TAKTAGKALS		LVIVDQEKCF		SAQNPPRRGK		QGANKQTKKQ		QQRQPEASIG
SMVSRVDAEE		ALVDLQLHTE		AQAQIVQSWK		ELADFTCAFT		KAVAEAPFKK
LRDETTFSFC		LESDWAGGVK		VDLAGRGLAL		VWRRQIQQLN		RVSLEMASAV
VNAYPSPQLL		VQAYQQCFSD		KERQNLLADI		QVRRGEGVTS		TSRRIGPELS
RRIYLQMTTL		QPHLSLDSAD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Oegruenc M., Sancar A. (2003). Identification and characterization of human MUS81-MMS4 structure-specific endonuclease. J. Biol. Chem. 278: 21715—21720. PMID 12686547 DOI:10.1074/jbc.M302484200
• Ciccia A., Constantinou A., West S.C. (2003). Identification and characterization of the human mus81-eme1 endonuclease. J. Biol. Chem. 278: 25172—25178. PMID 12721304 DOI:10.1074/jbc.M302882200

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24965 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
4. UniProt, Q96AY2 (англ.) . Архів оригіналу за 8 лютого 2018. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 17

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»