EPHA4

EPHA4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2LW8, 2WO1, 2WO2, 2WO3, 3CKH, 3GXU, 4BK4, 4BK5, 4BKA, 4BKF, 4M4P, 4M4R, 4W4Z, 4W50, 5JR2
Ідентифікатори
Символи	EPHA4, Epha4, 2900005C20Rik, AI385584, Cek8, Hek8, Sek, Sek1, Tyro1, rb, EPH receptor A4, HEK8, SEK, TYRO1, EK8
Зовнішні ІД	OMIM: 602188 MGI: 98277 HomoloGene: 20933 GeneCards: EPHA4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • protein kinase activity; • nucleotide binding; • GPI-linked ephrin receptor activity; • ephrin receptor binding; • DH domain binding; • transmembrane-ephrin receptor activity; • kinase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; • PH domain binding; • protein tyrosine kinase activity; • ATP binding; • ephrin receptor activity; • amyloid-beta binding; • protein tyrosine kinase binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • axon terminus; • integral component of membrane; • cell body; • перикаріон; • postsynaptic membrane; • комплекс Ґольджі; • ендосома; • cell projection; • early endosome membrane; • мембрана; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • Філоподія; • neuromuscular junction; • клітинна мембрана; • dendritic spine; • axonal growth cone; • integral component of plasma membrane; • синапс; • cell surface; • мітохондріальна зовнішня мембрана; • міжклітинні контакти; • аксон; • дендрит (нейробіологія); • early endosome; • ендоплазматичний ретикулум; • neuron projection; • dendritic shaft; • receptor complex; • Schaffer collateral - CA1 synapse; • glutamatergic synapse; • integral component of postsynaptic membrane; • integral component of presynaptic membrane;
Біологічний процес	• negative regulation of axon regeneration; • fasciculation of motor neuron axon; • фосфорилювання; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • positive regulation of JUN kinase activity; • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity; • нейробіологія розвитку; • regulation of axonogenesis; • multicellular organism development; • protein phosphorylation; • regulation of astrocyte differentiation; • адгезія клітин; • positive regulation of dendrite morphogenesis; • nephric duct morphogenesis; • protein autophosphorylation; • corticospinal tract morphogenesis; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • fasciculation of sensory neuron axon; • motor neuron axon guidance; • positive regulation of Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity; • regulation of dendritic spine morphogenesis; • glial cell migration; • adult walking behavior; • axon guidance; • ephrin receptor signaling pathway; • negative regulation of neuron projection development; • protein stabilization; • positive regulation of protein tyrosine kinase activity; • neuron projection guidance; • synapse pruning; • neuron projection fasciculation; • negative regulation of long-term synaptic potentiation; • positive regulation of amyloid-beta formation; • positive regulation of aspartic-type endopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process; • negative regulation of proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • cellular response to amyloid-beta; • regulation of modification of synaptic structure;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2043
	13838
	ENSG00000116106
	ENSMUSG00000026235
	P54764
	Q03137
	NM_001304536; NM_001304537; NM_004438; NM_001363748
	NM_007936
	NP_001291465; NP_001291466; NP_004429; NP_001350677
	NP_031962
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EPHA4 (англ. EPH receptor A4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 986 амінокислот, а молекулярна маса — 109 860^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGIFYFALF	SCLFGICDAV	TGSRVYPANE	VTLLDSRSVQ	GELGWIASPL
EGGWEEVSIM	DEKNTPIRTY	QVCNVMEPSQ	NNWLRTDWIT	REGAQRVYIE
IKFTLRDCNS	LPGVMGTCKE	TFNLYYYESD	NDKERFIREN	QFVKIDTIAA
DESFTQVDIG	DRIMKLNTEI	RDVGPLSKKG	FYLAFQDVGA	CIALVSVRVF
YKKCPLTVRN	LAQFPDTITG	ADTSSLVEVR	GSCVNNSEEK	DVPKMYCGAD
GEWLVPIGNC	LCNAGHEERS	GECQACKIGY	YKALSTDATC	AKCPPHSYSV
WEGATSCTCD	RGFFRADNDA	ASMPCTRPPS	APLNLISNVN	ETSVNLEWSS
PQNTGGRQDI	SYNVVCKKCG	AGDPSKCRPC	GSGVHYTPQQ	NGLKTTKVSI
TDLLAHTNYT	FEIWAVNGVS	KYNPNPDQSV	SVTVTTNQAA	PSSIALVQAK
EVTRYSVALA	WLEPDRPNGV	ILEYEVKYYE	KDQNERSYRI	VRTAARNTDI
KGLNPLTSYV	FHVRARTAAG	YGDFSEPLEV	TTNTVPSRII	GDGANSTVLL
VSVSGSVVLV	VILIAAFVIS	RRRSKYSKAK	QEADEEKHLN	QGVRTYVDPF
TYEDPNQAVR	EFAKEIDASC	IKIEKVIGVG	EFGEVCSGRL	KVPGKREICV
AIKTLKAGYT	DKQRRDFLSE	ASIMGQFDHP	NIIHLEGVVT	KCKPVMIITE
YMENGSLDAF	LRKNDGRFTV	IQLVGMLRGI	GSGMKYLSDM	SYVHRDLAAR
NILVNSNLVC	KVSDFGMSRV	LEDDPEAAYT	TRGGKIPIRW	TAPEAIAYRK
FTSASDVWSY	GIVMWEVMSY	GERPYWDMSN	QDVIKAIEEG	YRLPPPMDCP
IALHQLMLDC	WQKERSDRPK	FGQIVNMLDK	LIRNPNSLKR	TGTESSRPNT
ALLDPSSPEF	SAVVSVGDWL	QAIKMDRYKD	NFTAAGYTTL	EAVVHVNQED
LARIGITAIT	HQNKILSSVQ	AMRTQMQQMH	GRMVPV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Richter M., Murai K.K., Bourgin C., Pak D.T., Pasquale E.B. (2007). The EphA4 receptor regulates neuronal morphology through SPAR-mediated inactivation of Rap GTPases. J. Neurosci. 27: 14205—14215. PMID 18094260 doi:10.1523/JNEUROSCI.2746-07.2007
Qin H., Shi J., Noberini R., Pasquale E.B., Song J. (2008). Crystal structure and NMR binding reveal that two small molecule antagonists target the high affinity ephrin-binding channel of the EphA4 receptor. J. Biol. Chem. 283: 29473—29484. PMID 18708347 doi:10.1074/jbc.M804114200
Unified nomenclature for Eph family receptors and their ligands, the ephrins. Cell. 90: 403—404. 1997. PMID 9267020

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3388 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P54764 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3388 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P54764 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]