EPHB1

EPHB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DJS, 2EAO, 3ZFX
Ідентифікатори
Символи	EPHB1, Ephb1, 9330129L11, AW488255, C130099E04Rik, Cek6, ENSMUSG00000074119, Elk, Elkh, Hek6, Net, EPHT2, EPH receptor B1, ELK, NET
Зовнішні ІД	OMIM: 600600 MGI: 1096337 HomoloGene: 20936 GeneCards: EPHB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • kinase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; • protein tyrosine kinase activity; • ATP binding; • ephrin receptor activity; • axon guidance receptor activity; • transmembrane-ephrin receptor activity; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • ендосома; • cell projection; • early endosome membrane; • мембрана; • integral component of plasma membrane; • extracellular region; • дендрит (нейробіологія); • екзосома; • ендоплазматичний ретикулум; • гіалоплазма; • клітинна мембрана; • аксон; • цитоплазма; • filopodium tip; • membrane raft; • neuron projection; • receptor complex; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• фосфорилювання; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • нейробіологія розвитку; • dendritic spine development; • cell-substrate adhesion; • regulation of JNK cascade; • protein phosphorylation; • адгезія клітин; • regulation of neuron death; • regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • protein autophosphorylation; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • immunological synapse formation; • axon guidance; • optic nerve morphogenesis; • central nervous system projection neuron axonogenesis; • retinal ganglion cell axon guidance; • ephrin receptor signaling pathway; • camera-type eye morphogenesis; • positive regulation of synapse assembly; • dendritic spine morphogenesis; • Ангіогенез; • skeletal muscle satellite cell activation; • cranial nerve development; • Нейрогенез; • establishment of cell polarity; • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain; • cell chemotaxis; • neural precursor cell proliferation; • negative regulation of skeletal muscle satellite cell proliferation; • negative regulation of satellite cell differentiation; • modulation of chemical synaptic transmission;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2047
	270190
	ENSG00000154928
	ENSMUSG00000032537
	P54762
	Q8CBF3
	NM_004441
	NM_001168296; NM_173447
	NP_004432
	NP_001161768; NP_775623
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EPHB1 (англ. EPH receptor B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 984 амінокислот, а молекулярна маса — 109 885^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALDYLLLLL	LASAVAAMEE	TLMDTRTATA	ELGWTANPAS	GWEEVSGYDE
NLNTIRTYQV	CNVFEPNQNN	WLLTTFINRR	GAHRIYTEMR	FTVRDCSSLP
NVPGSCKETF	NLYYYETDSV	IATKKSAFWS	EAPYLKVDTI	AADESFSQVD
FGGRLMKVNT	EVRSFGPLTR	NGFYLAFQDY	GACMSLLSVR	VFFKKCPSIV
QNFAVFPETM	TGAESTSLVI	ARGTCIPNAE	EVDVPIKLYC	NGDGEWMVPI
GRCTCKPGYE	PENSVACKAC	PAGTFKASQE	AEGCSHCPSN	SRSPAEASPI
CTCRTGYYRA	DFDPPEVACT	SVPSGPRNVI	SIVNETSIIL	EWHPPRETGG
RDDVTYNIIC	KKCRADRRSC	SRCDDNVEFV	PRQLGLTECR	VSISSLWAHT
PYTFDIQAIN	GVSSKSPFPP	QHVSVNITTN	QAAPSTVPIM	HQVSATMRSI
TLSWPQPEQP	NGIILDYEIR	YYEKEHNEFN	SSMARSQTNT	ARIDGLRPGM
VYVVQVRART	VAGYGKFSGK	MCFQTLTDDD	YKSELREQLP	LIAGSAAAGV
VFVVSLVAIS	IVCSRKRAYS	KEAVYSDKLQ	HYSTGRGSPG	MKIYIDPFTY
EDPNEAVREF	AKEIDVSFVK	IEEVIGAGEF	GEVYKGRLKL	PGKREIYVAI
KTLKAGYSEK	QRRDFLSEAS	IMGQFDHPNI	IRLEGVVTKS	RPVMIITEFM
ENGALDSFLR	QNDGQFTVIQ	LVGMLRGIAA	GMKYLAEMNY	VHRDLAARNI
LVNSNLVCKV	SDFGLSRYLQ	DDTSDPTYTS	SLGGKIPVRW	TAPEAIAYRK
FTSASDVWSY	GIVMWEVMSF	GERPYWDMSN	QDVINAIEQD	YRLPPPMDCP
AALHQLMLDC	WQKDRNSRPR	FAEIVNTLDK	MIRNPASLKT	VATITAVPSQ
PLLDRSIPDF	TAFTTVDDWL	SAIKMVQYRD	SFLTAGFTSL	QLVTQMTSED
LLRIGITLAG	HQKKILNSIH	SMRVQISQSP	TAMA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках, ендосомах.

Література

Stein E., Huynh-Do U., Lane A.A., Cerretti D.P., Daniel T.O. (1998). Nck recruitment to Eph receptor, EphB1/ELK, couples ligand activation to c-Jun kinase. J. Biol. Chem. 273: 1303—1308. PMID 9430661 doi:10.1074/jbc.273.3.1303
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 doi:10.1110/ps.04682504
Stein E., Cerretti D.P., Daniel T.O. (1996). Ligand activation of ELK receptor tyrosine kinase promotes its association with Grb10 and Grb2 in vascular endothelial cells. J. Biol. Chem. 271: 23588—23593. PMID 8798570 doi:10.1074/jbc.271.38.23588
Freywald A., Sharfe N., Roifman C.M. (2002). The kinase-null EphB6 receptor undergoes transphosphorylation in a complex with EphB1. J. Biol. Chem. 277: 3823—3828. PMID 11713248 doi:10.1074/jbc.M108011200
Han D.C., Shen T.L., Miao H., Wang B., Guan J.L. (2002). EphB1 associates with Grb7 and regulates cell migration. J. Biol. Chem. 277: 45655—45661. PMID 12223469 doi:10.1074/jbc.M203165200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3392 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P54762 (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3392 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P54762 (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]