FANCM

FANCM
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4BXO, 4DAY, 4DRB, 4E45, 4M6W
Ідентифікатори
Символи	FANCM, FAAP250, KIAA1596, Fanconi anemia complementation group M, FA complementation group M, POF15, SPGF28
Зовнішні ІД	OMIM: 609644 MGI: 2442306 HomoloGene: 35378 GeneCards: FANCM
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nuclease activity • nucleotide binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • hydrolase activity • GO:0008026 helicase activity • GO:0043140 3'-5' DNA helicase activity Клітинна компонента • FANCM-MHF complex • Fanconi anaemia nuclear complex • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • resolution of meiotic recombination intermediates • interstrand cross-link repair • replication fork processing • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0100026 Репарація ДНК • DNA duplex unwinding • positive regulation of protein monoubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57697	104806
Ensembl	ENSG00000187790	ENSMUSG00000055884
UniProt	Q8IYD8	Q8BGE5
RefSeq (мРНК)	NM_001308133 NM_001308134 NM_020937	NM_178912 NM_001364447
RefSeq (білок)	NP_001295062 NP_001295063 NP_065988	NP_849243 NP_001351376
Локус (UCSC)	Хр. 14: 45.14 – 45.2 Mb	Хр. 12: 65.12 – 65.18 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FANCM (англ. Fanconi anemia complementation group M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 048 амінокислот, а молекулярна маса — 232 191^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGRQRTLFQ		TWGSSISRSS		GTPGCSSGTE		RPQSPGSSKA		PLPAAAEAQL
ESDDDVLLVA		AYEAERQLCL		ENGGFCTSAG		ALWIYPTNCP		VRDYQLHISR
AALFCNTLVC		LPTGLGKTFI		AAVVMYNFYR		WFPSGKVVFM		APTKPLVTQQ
IEACYQVMGI		PQSHMAEMTG		STQASTRKEI		WCSKRVLFLT		PQVMVNDLSR
GACPAAEIKC		LVIDEAHKAL		GNYAYCQVVR		ELVKYTNHFR		ILALSATPGS
DIKAVQQVIT		NLLIGQIELR		SEDSPDILTY		SHERKVEKLI		VPLGEELAAI
QKTYIQILES		FARSLIQRNV		LMRRDIPNLT		KYQIILARDQ		FRKNPSPNIV
GIQQGIIEGE		FAICISLYHG		YELLQQMGMR		SLYFFLCGIM		DGTKGMTRSK
NELGRNEDFM		KLYNHLECMF		ARTRSTSANG		ISAIQQGDKN		KKFVYSHPKL
KKLEEVVIEH		FKSWNAENTT		EKKRDETRVM		IFSSFRDSVQ		EIAEMLSQHQ
PIIRVMTFVG		HASGKSTKGF		TQKEQLEVVK		QFRDGGYNTL		VSTCVGEEGL
DIGEVDLIIC		FDSQKSPIRL		VQRMGRTGRK		RQGRIVIILS		EGREERIYNQ
SQSNKRSIYK		AISSNRQVLH		FYQRSPRMVP		DGINPKLHKM		FITHGVYEPE
KPSRNLQRKS		SIFSYRDGMR		QSSLKKDWFL		SEEEFKLWNR		LYRLRDSDEI
KEITLPQVQF		SSLQNEENKP		AQESTTGIHQ		LSLSEWRLWQ		DHPLPTHQVD
HSDRCRHFIG		LMQMIEGMRH		EEGECSYELE		VESYLQMEDV		TSTFIAPRNE
SNNLASDTFI		THKKSSFIKN		INQGSSSSVI		ESDEECAEIV		KQTHIKPTKI
VSLKKKVSKE		IKKDQLKKEN		NHGIIDSVDN		DRNSTVENIF		QEDLPNDKRT
SDTDEIAATC		TINENVIKEP		CVLLTECQFT		NKSTSSLAGN		VLDSGYNSFN
DEKSVSSNLF		LPFEEELYIV		RTDDQFYNCH		SLTKEVLANV		ERFLSYSPPP
LSGLSDLEYE		IAKGTALENL		LFLPCAEHLR		SDKCTCLLSH		SAVNSQQNLE
LNSLKCINYP		SEKSCLYDIP		NDNISDEPSL		CDCDVHKHNQ		NENLVPNNRV
QIHRSPAQNL		VGENNHDVDN		SDLPVLSTDQ		DESLLLFEDV		NTEFDDVSLS
PLNSKSESLP		VSDKTAISET		PLVSQFLISD		ELLLDNNSEL		QDQITRDANS
FKSRDQRGVQ		EEKVKNHEDI		FDCSRDLFSV		TFDLGFCSPD		SDDEILEHTS
DSNRPLDDLY		GRYLEIKEIS		DANYVSNQAL		IPRDHSKNFT		SGTVIIPSNE
DMQNPNYVHL		PLSAAKNEEL		LSPGYSQFSL		PVQKKVMSTP		LSKSNTLNSF
SKIRKEILKT		PDSSKEKVNL		QRFKEALNST		FDYSEFSLEK		SKSSGPMYLH
KSCHSVEDGQ		LLTSNESEDD		EIFRRKVKRA		KGNVLNSPED		QKNSEVDSPL
HAVKKRRFPI		NRSELSSSDE		SENFPKPCSQ		LEDFKVCNGN		ARRGIKVPKR
QSHLKHVARK		FLDDEAELSE		EDAEYVSSDE		NDESENEQDS		SLLDFLNDET
QLSQAINDSE		MRAIYMKSLR		SPMMNNKYKM		IHKTHKNINI		FSQIPEQDET
YLEDSFCVDE		EESCKGQSSE		EEVCVDFNLI		TDDCFANSKK		YKTRRAVMLK
EMMEQNCAHS		KKKLSRIILP		DDSSEEENNV		NDKRESNIAV		NPSTVKKNKQ
QDHCLNSVPS		GSSAQSKVRS		TPRVNPLAKQ		SKQTSLNLKD		TISEVSDFKP
QNHNEVQSTT		PPFTTVDSQK		DCRKFPVPQK		DGSALEDSST		SGASCSKSRP
HLAGTHTSLR		LPQEGKGTCI		LVGGHEITSG		LEVISSLRAI		HGLQVEVCPL
NGCDYIVSNR		MVVERRSQSE		MLNSVNKNKF		IEQIQHLQSM		FERICVIVEK
DREKTGDTSR		MFRRTKSYDS		LLTTLIGAGI		RILFSSCQEE		TADLLKELSL
VEQRKNVGIH		VPTVVNSNKS		EALQFYLSIP		NISYITALNM		CHQFSSVKRM
ANSSLQEISM		YAQVTHQKAE		EIYRYIHYVF		DIQMLPNDLN		QDRLKSDI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23168 (англ.) . Архів оригіналу за 6 червня 2017. Процитовано 20 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-06 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q8IYD8 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 20 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 14

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»