FNTB

FNTB
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1JCQ, 1LD7, 1LD8, 1MZC, 1S63, 1SA4, 1TN6, 2F0Y, 2H6F, 2H6G, 2H6H, 2H6I, 2IEJ, 3E37
Ідентифікатори
Символи	FNTB, FPTB, farnesyltransferase, CAAX box, beta
Зовнішні ІД	OMIM: 134636 MGI: 1861305 HomoloGene: 1535 GeneCards: FNTB
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • transferase activity; • prenyltransferase activity; • каталітична активність; • protein farnesyltransferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • farnesyltranstransferase activity; • zinc ion binding; • isoprenoid binding; • пептидний зв'язок;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • protein farnesyltransferase complex; • microtubule associated complex; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• protein farnesylation; • positive regulation of cell population proliferation; • negative regulation of cell population proliferation; • response to inorganic substance; • GO:1904578 response to organic cyclic compound; • response to cytokine; • Загоєння ран; • positive regulation of cell cycle; • positive regulation of fibroblast proliferation; • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process; • protein prenylation; • regulation of fibroblast proliferation; • regulation of rhodopsin mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2342
	110606
	н/д
	ENSMUSG00000033373
	P49356
	Q8K2I1
	NM_002028
	NM_145927
	NP_002019; NP_001189487; NP_001189488
	NP_666039
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

FNTB (англ. Farnesyltransferase, CAAX box, beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 437 амінокислот, а молекулярна маса — 48 774^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASPSSFTYY	CPPSSSPVWS	EPLYSLRPEH	ARERLQDDSV	ETVTSIEQAK
VEEKIQEVFS	SYKFNHLVPR	LVLQREKHFH	YLKRGLRQLT	DAYECLDASR
PWLCYWILHS	LELLDEPIPQ	IVATDVCQFL	ELCQSPEGGF	GGGPGQYPHL
APTYAAVNAL	CIIGTEEAYD	IINREKLLQY	LYSLKQPDGS	FLMHVGGEVD
VRSAYCAASV	ASLTNIITPD	LFEGTAEWIA	RCQNWEGGIG	GVPGMEAHGG
YTFCGLAALV	ILKRERSLNL	KSLLQWVTSR	QMRFEGGFQG	RCNKLVDGCY
SFWQAGLLPL	LHRALHAQGD	PALSMSHWMF	HQQALQEYIL	MCCQCPAGGL
LDKPGKSRDF	YHTCYCLSGL	SIAQHFGSGA	MLHDVVLGVP	ENALQPTHPV
YNIGPDKVIQ	ATTYFLQKPV	PGFEELKDET	SAEPATD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Long S.B., Hancock P.J., Kral A.M., Hellinga H.W., Beese L.S. (2001). The crystal structure of human protein farnesyltransferase reveals the basis for inhibition by CaaX tetrapeptides and their mimetics. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 12948—12953. PMID 11687658 doi:10.1073/pnas.241407898
Reid T.S., Terry K.L., Casey P.J., Beese L.S. (2004). Crystallographic analysis of CaaX prenyltransferases complexed with substrates defines rules of protein substrate selectivity. J. Mol. Biol. 343: 417—433. PMID 15451670 doi:10.1016/j.jmb.2004.08.056
Terry K.L., Casey P.J., Beese L.S. (2006). Conversion of protein farnesyltransferase to a geranylgeranyltransferase. Biochemistry. 45: 9746—9755. PMID 16893176 doi:10.1021/bi060295e

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3785 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P49356 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3785 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P49356 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]