GDA

GDA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4AQL, 3E0L, 2UZ9
Ідентифікатори
Символи	GDA, guanine deaminase, CYPIN, GUANASE, NEDASIN, Guanine deaminase, GAH
Зовнішні ІД	OMIM: 139260 MGI: 95678 HomoloGene: 3171 GeneCards: GDA
Онтологія гена
Молекулярна функція	• hydrolase activity; • зв'язування з іоном металу; • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds; • zinc ion binding; • guanine deaminase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• guanine catabolic process; • purine nucleotide catabolic process; • nucleobase-containing compound metabolic process; • нейробіологія розвитку; • guanine metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	9615
	14544
	ENSG00000119125
	ENSMUSG00000058624
	Q9Y2T3
	Q9R111
NM_001242505; NM_001242506; NM_001242507; NM_004293; NM_001351571;
	NM_001351572; NM_001351573
	NM_010266
NP_001229434; NP_001229435; NP_001229436; NP_004284; NP_001338500;
	NP_001338501; NP_001338502
	NP_034396
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GDA (англ. Guanine deaminase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 51 003^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MCAAQMPPLA	HIFRGTFVHS	TWTCPMEVLR	DHLLGVSDSG	KIVFLEEASQ
QEKLAKEWCF	KPCEIRELSH	HEFFMPGLVD	THIHASQYSF	AGSSIDLPLL
EWLTKYTFPA	EHRFQNIDFA	EEVYTRVVRR	TLKNGTTTAC	YFATIHTDSS
LLLADITDKF	GQRAFVGKVC	MDLNDTFPEY	KETTEESIKE	TERFVSEMLQ
KNYSRVKPIV	TPRFSLSCSE	TLMGELGNIA	KTRDLHIQSH	ISENRDEVEA
VKNLYPSYKN	YTSVYDKNNL	LTNKTVMAHG	CYLSAEELNV	FHERGASIAH
CPNSNLSLSS	GFLNVLEVLK	HEVKIGLGTD	VAGGYSYSML	DAIRRAVMVS
NILLINKVNE	KSLTLKEVFR	LATLGGSQAL	GLDGEIGNFE	VGKEFDAILI
NPKASDSPID	LFYGDFFGDI	SEAVIQKFLY	LGDDRNIEEV	YVGGKQVVPF
SSSV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

Yuan G., Bin J.C., McKay D.J., Snyder F.F. (1999). Cloning and characterization of human guanine deaminase. Purification and partial amino acid sequence of the mouse protein. J. Biol. Chem. 274: 8175—8180. PMID 10075721 doi:10.1074/jbc.274.12.8175
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Murphy P.M., Bolduc J.M., Gallaher J.L., Stoddard B.L., Baker D. (2009). Alteration of enzyme specificity by computational loop remodeling and design. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106: 9215—9220. PMID 19470646 doi:10.1073/pnas.0811070106

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4212 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y2T3 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4212 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9Y2T3 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]