GEM (ген)

GEM
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CJW, 2G3Y, 2HT6
Ідентифікатори
Символи	GEM, KIR, GTP binding protein overexpressed in skeletal muscle
Зовнішні ІД	OMIM: 600164 MGI: 99844 HomoloGene: 38024 GeneCards: GEM
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • magnesium ion binding • calmodulin binding • GDP binding • GO:0006184 GTPase activity • calcium channel regulator activity Клітинна компонента • spindle midzone • cytoplasmic side of plasma membrane • клітинна мембрана • midbody • mitotic spindle • клітинне ядро • мембрана Біологічний процес • cell surface receptor signaling pathway • metaphase plate congression • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0007067 мітоз • negative regulation of high voltage-gated calcium channel activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2669	14579
Ensembl	ENSG00000164949	ENSMUSG00000028214
UniProt	P55040	P55041
RefSeq (мРНК)	NM_181702 NM_005261	NM_010276
RefSeq (білок)	NP_005252 NP_859053	NP_034406
Локус (UCSC)	Хр. 8: 94.25 – 94.26 Mb	Хр. 4: 11.7 – 11.71 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GEM (англ. GTP binding protein overexpressed in skeletal muscle) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 296 амінокислот, а молекулярна маса — 33 949^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTLNNVTMRQ		GTVGMQPQQQ		RWSIPADGRH		LMVQKEPHQY		SHRNRHSATP
EDHCRRSWSS		DSTDSVISSE		SGNTYYRVVL		IGEQGVGKST		LANIFAGVHD
SMDSDCEVLG		EDTYERTLMV		DGESATIILL		DMWENKGENE		WLHDHCMQVG
DAYLIVYSIT		DRASFEKASE		LRIQLRRARQ		TEDIPIILVG		NKSDLVRCRE
VSVSEGRACA		VVFDCKFIET		SAAVQHNVKE		LFEGIVRQVR		LRRDSKEKNE
RRLAYQKRKE		SMPRKARRFW		GKIVAKNNKN		MAFKLKSKSC		HDLSVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, молекулою кальмодуліну, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Moyers J.S., Bilan P.J., Zhu J., Kahn C.R. (1997). Rad and Rad-related GTPases interact with calmodulin and calmodulin-dependent protein kinase II. J. Biol. Chem. 272: 11832—11839. PMID 9115241 doi:10.1074/jbc.272.18.11832

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4234 (англ.) . Архів оригіналу за 23 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-23 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P55040 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 8

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»