GRIN2C

GRIN2C
Ідентифікатори
Символи	GRIN2C, GluN2C, NMDAR2C, NR2C, glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2C
Зовнішні ІД	OMIM: 138254 MGI: 95822 HomoloGene: 647 GeneCards: GRIN2C
Реагує на сполуку
Гліцин, Аспарагінова кислота, homoquinolinic acid, Tetrazolylglycine, N-метил-D-аспартат, 5,7-dichlorokynurenic acid, d-CCPene, selfotel, амантадин, декстрометорфан, dizocilpine, кетамін, L-morphan, фенциклідин, lanicemine, neboglamine, priralfinamide, esketamine, кетамін, cns-5161, ketamine hydrochloride, amantadine hydrochloride, orphenadrine citrate[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ionotropic glutamate receptor activity • cation channel activity • extracellularly glutamate-gated ion channel activity • NMDA glutamate receptor activity • glutamate-gated calcium ion channel activity • signaling receptor activity • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential Клітинна компонента • integral component of membrane • postsynaptic membrane • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • клітинна мембрана • синапс • міжклітинні контакти • внутрішньоклітинний • integral component of plasma membrane • NMDA selective glutamate receptor complex • postsynaptic density membrane • glutamatergic synapse Біологічний процес • GO:0034613 protein localization • glutamate receptor signaling pathway • neuromuscular process controlling balance • GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process • regulation of membrane potential • directional locomotion • ion transport • MAPK cascade • ionotropic glutamate receptor signaling pathway • response to wounding • excitatory postsynaptic potential • calcium-mediated signaling • GO:0060401 calcium ion transmembrane import into cytosol • regulation of molecular function • GO:0015915 транспорт • brain development • regulation of synaptic plasticity • довготривала потенціація • excitatory chemical synaptic transmission • protein localization to postsynaptic membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2905	14813
Ensembl	ENSG00000161509	ENSMUSG00000020734
UniProt	Q14957	Q01098
RefSeq (мРНК)	NM_000835 NM_001278553	NM_010350
RefSeq (білок)	NP_000826 NP_001265482	NP_034480
Локус (UCSC)	Хр. 17: 74.84 – 74.86 Mb	Хр. 11: 115.14 – 115.16 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GRIN2C (англ. Glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 233 амінокислот, а молекулярна маса — 134 209^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGGALGPALL		LTSLFGAWAG		LGPGQGEQGM		TVAVVFSSSG		PPQAQFRARL
TPQSFLDLPL		EIQPLTVGVN		TTNPSSLLTQ		ICGLLGAAHV		HGIVFEDNVD
TEAVAQILDF		ISSQTHVPIL		SISGGSAVVL		TPKEPGSAFL		QLGVSLEQQL
QVLFKVLEEY		DWSAFAVITS		LHPGHALFLE		GVRAVADASH		VSWRLLDVVT
LELGPGGPRA		RTQRLLRQLD		APVFVAYCSR		EEAEVLFAEA		AQAGLVGPGH
VWLVPNLALG		STDAPPATFP		VGLISVVTES		WRLSLRQKVR		DGVAILALGA
HSYWRQHGTL		PAPAGDCRVH		PGPVSPAREA		FYRHLLNVTW		EGRDFSFSPG
GYLVQPTMVV		IALNRHRLWE		MVGRWEHGVL		YMKYPVWPRY		SASLQPVVDS
RHLTVATLEE		RPFVIVESPD		PGTGGCVPNT		VPCRRQSNHT		FSSGDVAPYT
KLCCKGFCID		ILKKLARVVK		FSYDLYLVTN		GKHGKRVRGV		WNGMIGEVYY
KRADMAIGSL		TINEERSEIV		DFSVPFVETG		ISVMVARSNG		TVSPSAFLEP
YSPAVWVMMF		VMCLTVVAIT		VFMFEYFSPV		SYNQNLTRGK		KSGGPAFTIG
KSVWLLWALV		FNNSVPIENP		RGTTSKIMVL		VWAFFAVIFL		ASYTANLAAF
MIQEQYIDTV		SGLSDKKFQR		PQDQYPPFRF		GTVPNGSTER		NIRSNYRDMH
THMVKFNQRS		VEDALTSLKM		GKLDAFIYDA		AVLNYMAGKD		EGCKLVTIGS
GKVFATTGYG		IAMQKDSHWK		RAIDLALLQF		LGDGETQKLE		TVWLSGICQN
EKNEVMSSKL		DIDNMAGVFY		MLLVAMGLAL		LVFAWEHLVY		WKLRHSVPNS
SQLDFLLAFS		RGIYSCFSGV		QSLASPPRQA		SPDLTASSAQ		ASVLKMLQAA
RDMVTTAGVS		SSLDRATRTI		ENWGGGRRAP		PPSPCPTPRS		GPSPCLPTPD
PPPEPSPTGW		GPPDGGRAAL		VRRAPQPPGR		PPTPGPPLSD		VSRVSRRPAW
EARWPVRTGH		CGRHLSASER		PLSPARCHYS		SFPRADRSGR		PFLPLFPELE
DLPLLGPEQL		ARREALLHAA		WARGSRPRHA		SLPSSVAEAF		ARPSSLPAGC
TGPACARPDG		HSACRRLAQA		QSMCLPIYRE		ACQEGEQAGA		PAWQHRQHVC
LHAHAHLPFC		WGAVCPHLPP		CASHGSWLSG		AWGPLGHRGR		TLGLGTGYRD
SGGLDEISRV		ARGTQGFPGP		CTWRRISSLE		SEV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Lin Y.J., Bovetto S., Carver J.M., Giordano T. (1996). Cloning of the cDNA for the human NMDA receptor NR2C subunit and its expression in the central nervous system and periphery. Brain Res. Mol. Brain Res. 43: 57—64. PMID 9037519 DOI:10.1016/S0169-328X(96)00146-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cai L., Loo L.S., Atlashkin V., Hanson B.J., Hong W. (2011). Deficiency of sorting nexin 27 (SNX27) leads to growth retardation and elevated levels of N-methyl-D-aspartate receptor 2C (NR2C). Mol. Cell. Biol. 31: 1734—1747. PMID 21300787 DOI:10.1128/MCB.01044-10

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4587 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
5. UniProt, Q14957 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 17

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»