GZMB

GZMB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1FQ3, 1IAU
Ідентифікатори
Символи	GZMB, CCPI, CGL-1, CGL1, CSP-B, CSPB, CTLA1, CTSGL1, HLP, SECT, granzyme B, C11
Зовнішні ІД	OMIM: 123910 HomoloGene: 108184 GeneCards: GZMB
Пов'язані генетичні захворювання
вітиліго[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • serine-type peptidase activity • serine-type endopeptidase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • мембрана • immunological synapse • клітинне ядро • мітохондрія • secretory granule • цитоплазма Біологічний процес • Цитоліз • протеоліз • positive regulation of protein insertion into mitochondrial membrane involved in apoptotic signaling pathway • natural killer cell mediated cytotoxicity • GO:0097285 апоптоз • granzyme-mediated apoptotic signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3002	171528
Ensembl	ENSG00000100453	ENSRNOG00000049976
UniProt	P10144	P18291
RefSeq (мРНК)	NM_004131 NM_001346011	NM_138517
RefSeq (білок)	NP_001332940 NP_004122	NP_612526
Локус (UCSC)	Хр. 14: 24.63 – 24.63 Mb	н/д
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GZMB (англ. Granzyme B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 247 амінокислот, а молекулярна маса — 27 716^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQPILLLLAF		LLLPRADAGE		IIGGHEAKPH		SRPYMAYLMI		WDQKSLKRCG
GFLIRDDFVL		TAAHCWGSSI		NVTLGAHNIK		EQEPTQQFIP		VKRPIPHPAY
NPKNFSNDIM		LLQLERKAKR		TRAVQPLRLP		SNKAQVKPGQ		TCSVAGWGQT
APLGKHSHTL		QEVKMTVQED		RKCESDLRHY		YDSTIELCVG		DPEIKKTSFK
GDSGGPLVCN		KVAQGIVSYG		RNNGMPPRAC		TKVSSFVHWI		KKTMKRY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, цитоліз.

Література

• Trapani J.A., Klein J.L., White P.C., Dupont B. (1988). Molecular cloning of an inducible serine esterase gene from human cytotoxic lymphocytes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 6924—6928. PMID 3261871 doi:10.1073/pnas.85.18.6924
• Klein J.L., Shows T.B., Dupont B., Trapani J.A. (1989). Genomic organization and chromosomal assignment for a serine protease gene (CSPB) expressed by human cytotoxic lymphocytes. Genomics. 5: 110—117. PMID 2788607 doi:10.1016/0888-7543(89)90093-1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 doi:10.1110/ps.04682504
• Schmid J., Weissmann C. (1987). Induction of mRNA for a serine protease and a beta-thromboglobulin-like protein in mitogen-stimulated human leukocytes. J. Immunol. 139: 250—256. PMID 2953813
• Caputo A., Sauer D.E., Rowe P.B. (1990). Nucleotide sequence and genomic organization of a human T lymphocyte serine protease gene. J. Immunol. 145: 737—744. PMID 2365998

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з GZMB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4709 (англ.) . Архів оригіналу за 30 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-30 у Wayback Machine.]
5. UniProt, P10144 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 14

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»