HCN4

HCN4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MNG, 3OTF, 3U11, 4HBN, 4KL1, 4NVP
Ідентифікатори
Символи	HCN4, SSS2, hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4, BRGDA8, EIG18
Зовнішні ІД	OMIM: 605206 MGI: 1298209 HomoloGene: 3997 GeneCards: HCN4
Пов'язані генетичні захворювання
Brugada syndrome 8, миготіння передсердь[1]
Реагує на сполуку
івабрадин[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • potassium channel activity • cAMP binding • sodium channel activity • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • intracellular cAMP-activated cation channel activity • identical protein binding • voltage-gated potassium channel activity • voltage-gated sodium channel activity • voltage-gated potassium channel activity involved in SA node cell action potential depolarization Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • intrinsic component of plasma membrane • клітинна мембрана • perinuclear region of cytoplasm • HCN channel complex Біологічний процес • cellular response to cGMP • м'язове скорочення • sodium ion transmembrane transport • sodium ion transport • SA node cell action potential • regulation of membrane potential • regulation of ion transmembrane transport • cation transport • ion transport • кровообіг • regulation of membrane depolarization • регуляція серцевого ритму • potassium ion transport • трансмембранний транспорт • potassium ion transmembrane transport • regulation of cardiac muscle contraction • regulation of heart rate by cardiac conduction • cellular response to cAMP • membrane depolarization during cardiac muscle cell action potential • membrane depolarization during SA node cell action potential • sodium ion import across plasma membrane • regulation of cardiac muscle cell action potential involved in regulation of contraction • potassium ion import across plasma membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10021	330953
Ensembl	ENSG00000138622	ENSMUSG00000032338
UniProt	Q9Y3Q4	O70507
RefSeq (мРНК)	NM_005477	NM_001081192
RefSeq (білок)	NP_005468	NP_001074661
Локус (UCSC)	Хр. 15: 73.32 – 73.37 Mb	Хр. 9: 58.73 – 58.77 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HCN4 (англ. Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 203 амінокислот, а молекулярна маса — 129 042^[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDKLPPSMRK		RLYSLPQQVG		AKAWIMDEEE		DAEEEGAGGR		QDPSRRSIRL
RPLPSPSPSA		AAGGTESRSS		ALGAADSEGP		ARGAGKSSTN		GDCRRFRGSL
ASLGSRGGGS		GGTGSGSSHG		HLHDSAEERR		LIAEGDASPG		EDRTPPGLAA
EPERPGASAQ		PAASPPPPQQ		PPQPASASCE		QPSVDTAIKV		EGGAAAGDQI
LPEAEVRLGQ		AGFMQRQFGA		MLQPGVNKFS		LRMFGSQKAV		EREQERVKSA
GFWIIHPYSD		FRFYWDLTML		LLMVGNLIII		PVGITFFKDE		NTTPWIVFNV
VSDTFFLIDL		VLNFRTGIVV		EDNTEIILDP		QRIKMKYLKS		WFMVDFISSI
PVDYIFLIVE		TRIDSEVYKT		ARALRIVRFT		KILSLLRLLR		LSRLIRYIHQ
WEEIFHMTYD		LASAVVRIVN		LIGMMLLLCH		WDGCLQFLVP		MLQDFPDDCW
VSINNMVNNS		WGKQYSYALF		KAMSHMLCIG		YGRQAPVGMS		DVWLTMLSMI
VGATCYAMFI		GHATALIQSL		DSSRRQYQEK		YKQVEQYMSF		HKLPPDTRQR
IHDYYEHRYQ		GKMFDEESIL		GELSEPLREE		IINFNCRKLV		ASMPLFANAD
PNFVTSMLTK		LRFEVFQPGD		YIIREGTIGK		KMYFIQHGVV		SVLTKGNKET
KLADGSYFGE		ICLLTRGRRT		ASVRADTYCR		LYSLSVDNFN		EVLEEYPMMR
RAFETVALDR		LDRIGKKNSI		LLHKVQHDLN		SGVFNYQENE		IIQQIVQHDR
EMAHCAHRVQ		AAASATPTPT		PVIWTPLIQA		PLQAAAATTS		VAIALTHHPR
LPAAIFRPPP		GSGLGNLGAG		QTPRHLKRLQ		SLIPSALGSA		SPASSPSQVD
TPSSSSFHIQ		QLAGFSAPAG		LSPLLPSSSS		SPPPGACGSP		SAPTPSAGVA
ATTIAGFGHF		HKALGGSLSS		SDSPLLTPLQ		PGARSPQAAQ		PSPAPPGARG
GLGLPEHFLP		PPPSSRSPSS		SPGQLGQPPG		ELSLGLATGP		LSTPETPPRQ
PEPPSLVAGA		SGGASPVGFT		PRGGLSPPGH		SPGPPRTFPS		APPRASGSHG
SLLLPPASSP		PPPQVPQRRG		TPPLTPGRLT		QDLKLISASQ		PALPQDGAQT
LRRASPHSSG		ESMAAFPLFP		RAGGGSGGSG		SSGGLGPPGR		PYGAIPGQHV
TLPRKTSSGS		LPPPLSLFGA		RATSSGGPPL		TAGPQREPGA		RPEPVRSKLP
SNL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, транспорт натрію. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, калію, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Xu X., Vysotskaya Z.V., Liu Q., Zhou L. (2010). Structural basis for the cAMP-dependent gating in the human HCN4 channel. J. Biol. Chem. 285: 37082—37091. PMID 20829353 DOI:10.1074/jbc.M110.152033
• Milanesi R., Baruscotti M., Gnecchi-Ruscone T., DiFrancesco D. (2006). Familial sinus bradycardia associated with a mutation in the cardiac pacemaker channel. N. Engl. J. Med. 354: 151—157. PMID 16407510 DOI:10.1056/NEJMoa052475

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з HCN4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16882 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
6. UniProt, Q9Y3Q4 (англ.) . Архів оригіналу за 11 березня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 15

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»